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Basic Information


Item Value
gene id cntn3a.2
gene name cntn3a.2,LOC107727029,LOC107681399,LOC107705655,LOC108438229,LOC108275552,LOC107568042
gene type coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_056721.1
NCBI id CM032090.1
chromosome length 19062720
location 6202638 ~ 6270227 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence


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AACAacgtctctctcttcctctgcgTGGCTGTGGACGCGGCGAGGTGAGCTTGGCACGGGAGAGGGACTGTCTGGCTTTGCGCGCAGTTTGCAGACAGATTTGCGAGGGAGCCGCGCTGGAATATATTCAGGGGTGAAGAACCGAAGGGAGAAAGGGCGAAACCCTCCTCCAGCCTGCGCTTTCTtctccctcttctctctctctctgtatctatCTCTGGACGCGAAGACTTGGGCAAAATGGTTTTTCCGAAATCTCAGTGACTGCGATGTCAGCACCTCTCGTCCACCGCTTGTGGAGCACAGACTAAATACACCTCccgagagaagaaaaaaacacgcTAGCGGGGTCAGGTGGTTttctcgagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagcgcagcCGTTCATTCACGGCGTACTGGATTCAAGTAACACTCGCCCCTGGCAGCTGAAGATGACGTTACTATGGAAACAGTTTTTGCTGCTATCAATCATGGAGTATCTTGCAGAGTGTATGGATTATAAGTCTTTCAATGGGCCGAAATGGCGAATGGAGCCTAGTGATCTGACGGTGGGCTCACTGGAAGAAGAGGCGACGCTGACCTGTGACGCAAAGGGCATCCCTTCCCCTCAGTACAGgTGGTCTCTGAACGGCACGTTGATTAATCTCAGTACCGATTCCCGTCGGCGGCTATCTGGAGGAAATTTGGTCATTAGGAGTCTGGACCGAGCCCAGGATGGAGGGATATACCAGTGCACTGCCTTCAACCCACAGGGAGCAATTCTTAGCAGAAGAGCGAGCCTCCAGTTTGCATacttgaatttaaaaactcaaacaagAAGTGCTGTCTCTGTGCGAGAAGGCCAGGGGGTTGTTTTACTTTGTGGTACACCATCATATGCAGGAGATCTCTCATTTGCATGGGTCTTTAATGAGTACCCTTACTTTGTTCAGCAAGACAATCGTCGCTTTGTCTCTCAGGAGACGGGAAACCTTTACATCGCCAAAGTCGAGCCCTCAGATGTGGGTAACTACACATGCGTGGTGGTTAACCGCATCACTAAAGGCAAAGTCCTCAGCTCGCCGACCCCTCTGGTACTACGAACCGATGgcgTAATGGGTGAATATGAGCCGAAAATAGAGGTTCATTTCTCTGACATGGTTCCGGCTGCAAAGGGATCAGTTGTGACACTGGAGTGTTTTGCTTTGGGGAACCCAGTTCCAGAGATAACGTGGAGGAGAGCGAACGGAGTGCCGTTTCCCAGCAAGGTGAAGATGAAGAACTCAAATGTAGTTCTGGAGATTCCCAGTTTCCAGCAGGAGGATGCCGGAGGCTATGAATGTGTGGCTGAGAACAAGATGGGAAAGAACACAGTGCAAGGACGACTGTCTTTCCACGCGAAGCCTCAGTGGGTTCAGACGATGCGAGACAACGCTTTGTCAATCGAAGAGAGATTGTTCTGGGAGTGCAAGGCCAATGGGAAGCCCAAGCCTTCGTACAGCTGGTTGAAGAATGGAGAACTACTGGCAGCCGAGGACAGGATCCAGATAGAGAACGGAGCCCTGACAATGAGCTCTGTAAACCTCTCAGATGCTGGCATGTATCAGTGTGTCGCTGAGAACAAACATggaatcatttattttggtgCTGAATTGGTGGTGTTAGCCTCGCCCCCAGACTTTTCCAGAAGCCCTCTCAGAGCTCTGCTTAAAGCCAAGACGGGTAGCACCGTCACGATGGAGTGCAGGCCGCAGGCGTTTCCCACAGCCACCAGCATGTGGAGGAAAGGCAACGAACCGGTGCAGAGCTCAGAGAGGATAACTTTACTTCCTGATGGAACACTTAGAATTACAAATGTGACCAAGATGGACGGGGGAAACTACGCTTGCTTGGCTAGAAACCAGTTTGGTGCGGCCAGCACTACAGGAAGACTGCTGGTCACAGATCCCACACAAATCACCCAGGGTCCAGTGGACATGGAGATCATTGTTGGAGAGAGCATCGTCCTGCCCTGCCAGATCTCCTGCGACCCTGCTCTGGATGTTTCATTCTCCTGGGCCTTCAATGGGCAGCTCCTAAATAAACTAGACCAACATTATGAGCATGTGGGTGGGAGTACATCTGGAGATTTGATGATACGGAATATACAGCTCAAACACGCCGGAAAGTACGTCTGTGTGGTCGACACGGATGTTGAGAGTTTATCGGCGGCGGCTATTTTAATCGTGAAAGGTCCCCCAGGAGCTCCAGATGGTGTAACAGTGGAGGAGATCACAGACAGCACGGCTCAGCTTTCTTGGAGACCTGGCCAGGATAACGGCAGCCCCATCACAAGCTATATCATCCAGGCCAAGACAGCTTTCACAGTGGGCTGGCAAGCGGTGAACACGGTCCCGGGGGTGATTGATGGGAACACCTTGACGGCGACGGTGGTGGATCTGAACGCATGGGTGGAGTATGAGTTCAGAGTGCTGGCCAGAAATAGCGTTGGCGTGGGTGAACCGAGTCCTGCTTCTCTTAAAACTAGAACTGAAGATTCAGTTCCTGACACGGCCCCCACCGATGTCGGAGGTGGGGGTGGCTCCAAGTCAGAGCTAGTAATAACATGGGAGCCTGTGCCTGAAGACCTGCAAAACGGGGATGGTTTCGGCTACATCATCGCTTTCCGGCCGCTGGGCGAGGTCAACTGGACGCACGCCGTCACCTCCGTACCGTCCCAGTCGCGTTACGTGTACAGGAACGAGAGCATCCCGCCCTTCTCTCCATTTAGCGTCAAAGTGGGTGCCTACAACACCAAAGGCCAGGGACCATTCAGCCCCGTTACCATTGTGTACTCGGCTGAGAACGAGCCCAGTGGCGTTCCAGACGGCGTGTGGGCCAGAAGCATTTCTGCCACTGAAATTGAAGTGAGCTGGCACATTCTCAGCGCTTCCCCAGAAAGAGTGTTGGGCTATGAGGTGGTGTACTGGGAGGACGATACAAAACCAGAGACCATGGGCAAAGTCAGAGTGTCTGCCAATCAGAACAAGGTTAACATCAGCGGGCTGAGAGGATACACTCAGTATTTCCTGACAGTGAGCGCTTTCAACACAGCAGGAACTGGCCCACTGTCTCCCACCATCAACGTGACCACCAAGAAGTCCCCACCCGGGCAGCCACCTTTGAACGTGGAGTGGAATCTGATTGGCTCTAAGCTCACTGTTCACTGGGAGCCTGTCATTTCTCTGGAGATGGAGTCAGATGTTACCGGGTATCAGGTGTCTTACAGAAGGAACCGGcataaagaaattaacacaataacaacaaatcTGACCTCAGTGGAGCTCACGCTACCTGCAGATGATGATTACATCATTCAGATACGGGCGCTGAGTGACGGAGGAGAAGGGATGCCAACCGAACCCATCAATATACATAAACTTAGTATGAGCGTACGAGGGTCCAGAGCCTGGCGACCCAACACCATCCCGGTCTCCTTGCTTTCTATCATCGCGTTATCGACACTAAAACCGGCTTTGTGTTAACGTCCGAAGAATCGAACATCCCCTGACCGGTATGATTGCCTGCACTCTTCCTCGCTCTGCAGCCACTGGAGAGGTGCACCAAAACACTTCTGAAGAGAGATTATTGATCTATCTCTCCATAGTTATCTGAGGCAATGCCCGGCGAGGCCTTCAAGGAGCGTAACGGGAAAACGTCAGCGTCACGGTGGTCAGATTTCATGTGCATGTGTTATGTACTGTGTATCATTGTGTCCTTGCAAGTGATCCGAGACCCTAACAAGGTTTCAACCGAAGGGTTTTGAAGAGTATCGGTGTACGAGGAGGGATGAGTCATGTTACTGCACTAAGATTTCATCTTCTCATTGATCCGTCGAAACAAATGCCTTACTTCCATGTACATGCCAAAGTAGTTAACATCCTTTTACTTCTTACTAAGCTACTGTTTGTTAAAGTTGTGATTTGTTTTGTAGATCACATCATTAATtgaaggattagttcacccaaaatcaTTTACACACCCCCATGTTGTTGTCATGTGACTTTAAAGAACAATCGCGTGCAATTACAACGAATGGAGAAAGAGGCAGATTCGTTTGTTTCTTAATCGAAACAATATTTTGGGGGAAATGTAACATTGTGTCACTTTttcaccaatggatgctctgcagtgaatgggtgccgtaagaataagagtccaaacagctgataaaaacatcacaataatcaaaGTAGTCAACACAACTAtggcattttaacttttaaagctATATTGAGAGCTATTTTGTAGATCTTAAAAACACCTTACAggtggatttgtttattacaaatgcTCAGCTCTTAACACAAGACAAATCTGATAAACCGGAGTCACGTGGATTAGTTATTGtgtttttcatcagctgttttgacggcacccattcactacattggtgagcaagtgacgtaaTGATACATTGCTCCAAATCTGTCTTTaggaagaaacaaactcgtctgACCTgagaataattacatttacagcaaattaacatttttgaagtCACAAAAGagctataaatatatcataaatgcAGTGCATACTTGTTTGCCGTGTCACCTCTAACAAATTCACGTGAGGATTTTATGCGAGAAGCAAGCCAAAAAATTCAACTTTCGTGTttcaatgaaaaaagaaagacgtttggaacaacatgagggtgagtaaataatgacagaaggctcatattttgtgtgtgaatgatcCCTTTAAGCTGTTTGTTATACTTGTGATTCTGTAATggtattattaattaacatttagcCTTTGCTTATTAGTTTAGTTATTTGTTCAAGAGTTGTCTCTGTGCCTTATCTATGTTTTAGCACACAGTAGGCTTGTATTTGTTTGCTCCAGGCACCATGTTGCAGCTACAAGCCTCAAGTATTCATGATTGTCGAAGCGCTACAGTACATTCACAGGTTTTGTGACAACAAGATCTACTGT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Function


symbol description
cntn3a.2 Predicted to enable cell-cell adhesion mediator activity. Predicted to be involved in axon guidance; dendrite self-avoidance; and homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules. Predicted to be active in axon and plasma membrane. Orthologous to human CNTN3 (contactin 3).

NR:

description
contactin-3-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


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Neighbor


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rybpa rybpa,LOC107666235,LOC107705708,LOC107727016,LOC107681380,LOC107568051 coding downstream 53699 6323926 ~ 6332219 (+)
eif4e3 eif4e3,LOC107568047,LOC107705706,LOC107666244,LOC107681400,LOC107727004 coding downstream 63096 6333323 ~ 6338138 (+)
foxp1a foxp1a,LOC107727024,LOC107681376,LOC107568046,LOC107705705,LOC107666297 coding downstream 68184 6338411 ~ 6369985 (+)
krt8 krt8,LOC107681390,LOC107551542,LOC107705700,LOC107666368 coding downstream 215201 6485428 ~ 6490071 (+)
G155295 NA non-coding upstream 65000 6134980 ~ 6137638 (+)
G155263 NA non-coding upstream 278027 5924402 ~ 5924611 (+)
G155262 NA non-coding upstream 282581 5919766 ~ 5920057 (+)
LOC122329298 NA non-coding upstream 406326 5793282 ~ 5796312 (+)
G155204 NA non-coding upstream 424143 5748369 ~ 5778495 (+)
G155330 LOC107727022,LOC107681375 non-coding downstream 105843 6376070 ~ 6380365 (+)
LOC122328815 krt18,LOC107681396,LOC107727028,LOC107551541,LOC107666358,LOC107568050,LOC107705701 non-coding downstream 114334 6384561 ~ 6457809 (+)
G155351 NA non-coding downstream 151996 6422223 ~ 6424080 (+)
G155360 NA non-coding downstream 188331 6458558 ~ 6459029 (+)
LOC122328814 NA non-coding downstream 191092 6461319 ~ 6482153 (+)
LOC122328459 g6pd,LOC107723128,LOC107697003,LOC107594489 other upstream 1367154 4817365 ~ 4835484 (+)
ube2t ube2t,LOC107746510,LOC107707375,LOC107673550 other upstream 2505616 3694652 ~ 3697022 (+)
mitfb LOC107704626,LOC107709243,LOC107748437,LOC108438070,LOC107687304,LOC107558923,LOC107709232 other upstream 3105603 3060509 ~ 3097035 (+)
rbm10 LOC107709225,LOC107687301,LOC107704624,LOC107748436 other upstream 3192621 2995169 ~ 3010017 (+)
LOC122329169 NA other upstream 3258832 2925308 ~ 2943806 (+)
si:ch211-220i18.4 LOC107551506,LOC107666586,LOC107559855,LOC107681367,LOC107705652,LOC108275527,LOC107100285 other downstream 322375 6592602 ~ 6598532 (+)
G155561 NA other downstream 955767 7225994 ~ 7238919 (+)
tcea2 tcea2,LOC107681409,LOC107551521,LOC107705683,LOC107571665,LOC107666524 other downstream 1028133 7298360 ~ 7305534 (+)
LOC122328506 klhl14,LOC107677170,LOC107599684,LOC107554641,LOC107717384 other downstream 2051478 8321705 ~ 8333376 (+)
G155799 NA other downstream 2217859 8488086 ~ 8488641 (+)

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