LOC122346012 (cunh9orf84,LOC107704297)


Basic Information

Item Value
gene id LOC122346012
gene name cunh9orf84,LOC107704297
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056703.1
NCBI id CM032072.1
chromosome length 32833783
location 432779 ~ 447486 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU47239
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>XM_043240633.1
TCTCCCCTCAGATAATTTTGTTTCAGATTTGTTAGTTACGTCCACTTTTAAGTGCGCAACTGTCCGGATGAATTGAATTACTCATCGCTCGTCATTTCAACAGAACTGATATTTGACgatatattcatatttagtaTCGAACTGACAGGCCGCATCAAAACCAGACcaattcatttttcaatttttttttcgtttaaCCGAGGATAAAAGAGGCGCACCTTTTCTTGAAACTGCACTACAATCGCGTGAAGATTATTCCACAACAAGATGTAGTTGGTATTTTgtaaattcttattttatttgtttattagtttaAGCTCGTTTGATGTGATTTCAACATGAGTTCCCGTGGTCAAACCCGACAAAGTGCCAGTTTCATGACTGTTCGTTATAAGGGTATTGATTATATCTCTGAGGCCTCGGTCAGACGCAGAATAATGATCAGCTTGTTAGAACTTCCAGTTCCGTTCCAGCTGGACGGTAACATCTATCCACACAACGGACAGCTGCAGGACAACGCTTATAGAGTACCATGGAAGAACAAAACAACAGTTTGTACTCTACCAGTGACTGGGTCTGTAATGGATGATTTGAAGGCCAGCACACATTTCAGTGACTGCTTGGAGAGGTTTAGTGTGTTGCAGACAGGAAGAGGTCGAGAGGAAGTGGTTCCCAGCTCTAACCCTGCCTCTCAGTGTAGTATTTCTACCACAGAAGCCCTCTGGCTCCTAGATGGAGTTGAGAGCAATCTTTCTCTGCAAGAGGAGGTGATATTTAGTGACCATCTGCAGCAGTTTAAAATCCACTTACCTCCATTTCAAATGATGCTTCAGAGGCTGAACATCATGATTGTCTCAGATCCAGTTTTCAATTCATCAGTAAATCTCTTAGAAGAGGTCATTTTTAGACAGTGTGCTTCATATGATGCAGTTTTAGACAAGGTAACTGGTGCCACGTCTGCTTTAAATGCTACAGAAGAGTTCACAAAAGAGGCAGTTTTGAACGAAGAGTCTCTGATGTTGCCTGTTGAAGTTCATATGGACTGCTTTCCAAGGAAAGAGCCCAATTATTCCTTTGCACAAATGCAAGATTTTCTAAATGTCACCCGTGAACCAACAGAAGAATGCTTTCCTTTAGAAGATCTTCTCAAAGAAGTCTCCTCTGctgataaacacacaaatgagTTGGAGGTCCTGGAAATGCCCGAAAGCTGCTTTGCCAACATCATCTGCAAGGAGCCACAATCTCCAGTTGCTTTGAGGTTTTATGCTGAGATGGAATTAGACCTGCTTCTTTCACCATGTAGTCATACGCTGTGTCTTCCAGACCTGTGTATGTCAAGCAGACAGCTGTCAGCTGAGATTCTGTCACCAGTTTATAAGCAGAATTTCATGTCAGACGGTGATTgtgaaaatatggaaaaaactGTTTGGATGGCAGAGAAACATTCCCAATATGTGGCTCGATTTTTACTAGCTGAACCACAGGTAGATAAGCCACTGATCCACATCCAGTCACTCCCAGAGCTTCTTACACTCCTGAAGGTGGAGATGGAACAGGTTGCAGAACCCAAAAACATTATGGCCCAGTTTCACCTCACTGATAATACAATTCATCCTAAAAATGTCTTCCCAAATCTTTCCATCTATACTGAGAAAATATCCACAGAAGACCGTAAGAGAGCTATGAGAAAGCCACATGTGGATGAAACATATTTGCCACTGTCTATTATGAAAATAGATGagaTGCTGAGTAAGTGTGTTTCAAATGCAGcaCTGACACCTTCAGGTCTTCCCACTGCAGTTCACCTTTCCCAGAGTAAACCACTGCAGTCAGCTGTACCAACACAGATGGATAGAGATACGTCTGTGAAGTTCTTTATATTTGAGTCTCACCACCGAGACAGTTCTGCAGTGAGAACAACCAGAGGAGACTGTAAAGTTGCAGAGATAAAACAACATAAGCTCAATCCAGCAGAAAGATGCTCTGGGAATTTCTCCAAAAGTCCTTCAGAACAGCAATCGGTCATCTCTAAAGGGATTGAGATGTCTAGGTCTTCTCCACTGAAACCCGGTGTTAAAGATATTGAAGTGATATCCAATATACAAACGCTTCCTAAGCGTTCAGAACAGGCAAGAGAAGATAAGACCTCTAAATCATCTCCATCATTAAACTGTTTGAGAGGCAGAAAGAGAAATAATTCTGTAGTTCTGTCTCATGAAGAACTGAACCCTTTGTCGTCTTTTGTGACATTAAGAGCAATGCAGATATTTCCAATGCAATCTCAAAAGAGCAGTCCAACATCTGCAGAGTGTCAAAGAGATGCATATAGGGAACTGCATGCGTTGGCTCTGCCCTCTCTGAGTAAAATCAAGAAAGAATGCTTCAGAAAGAAAAGAGTCAGAGTAGACACCTTCACATATTATAAGAATGCATATAACATTGTGAAATGGCCAAAATCAtcacatgatgttttttttgcagagaaacattttgtgttattttttgtgACAGATGGGGACAGTGTGCTTAATGAGGTGACACTGCTACATATTCTGGTCACGTTAAAGGAACATGTTCTACTCACAAGTGACCTCAGCACAGCCACTGGTTACCTGGCTAATGTGAAGGATTCCTTCGCTCTGAGCGTTCTGGGTGAGCTGTTGAGAAAGTTAGAGGTGCTGCAATATCTGAGTCAGAAGAGAAAAGGACCCGATCCTAAACTTCTGGAGCTGCAGGAGCGAATCAACACATGGATGAAGTCCCATTCTAACCACAACACTAAAGTTCTGGTTTTGACCATGAGCCGTGTAAACACAGAGTTGCTTGTTGCCCTCAAACAAGTACGAGgaaACTCTGTGTTTGAAGTCATCCCCAAAGAAGGAATGAGTAAAGTCGTGAGCAGAGAAGTGATGGACGGACTCTCCTGCAGTTTGTGTCTTGTTGTGTGCAGTCAGCACGTTGGTCCAGACTTCCCGTGGCAGCGTTTCAGCATGGTGTTTGAGCTTCACTCTGTGGGTCCCTCACCCTTCGgcagtgtgtgttcagagagAAACATCAACTTTATATCCTTCTTCACTGCAGTGCCTGAATCCAATTTCCCACAAGAATCTACTGCATCATATCTGCACACTGTTCCGTTTGTGTTGCTCATCACCGATAGTTTACTGCAACGCTTAAAGATGCAACGCACGCTGGAGACAATGTACAATATGGTTCTGCTGGAGAGGAAAAGCTCTCCGTCCTCACTGCAGCTGGGTGGAACCCATTATGACGTCATCACTGTGGACGAGAACACCGCCATCCTCATCCAGgagcTGGGTGAGTTGGACATGAGGATCGGAGTGGCGTCTGAGCAGGTTGTCATGAGACTCACAGTCCTCTCTCTGCAGTTCAGCCGCTGCTGGGTCATTCTGCACTGTACTGAGAACCACAGGGCACTGATTTCCTGTAACATCTATATCAATCTGCTTCATATCTACTCTGCATCCGTGTTGTTCGGAAACAAGTCTGAGAAGTTTGACGTTAAGgTGTTACTGGTGTGTGAGGAAGAAGAGATGGCTAGCTACATCTATAAGATCTGTTTACATACGCTGATGAACTCGGAGAGAGATGGACTGAGCTGGTTGGATAGAGACTGGCTCAGTGTGCAGTCCACAGAGgcGGAACGTTGCCTGCTGGAGTTTCCCTGCATTAATCCTCTGGTTGCTCAACTGATGTTAAAAAGAGCTCCATCACTGCAGTGGCTGCTGGGAGCTTCTTTCTCTGAGCTGCAGGAAATGTTCCCACAGATCCCTCACAAAGTCATTAAGCTCTTTAGTGACATCACAGCTGAGTCCAAAGTCAAAAAGAGTGAGACTACACCCTTCTCAAACATAAACAGCCAAGTTCACTCTCTCCCTTGGGAACAGGATCCTGTTAAACCACAGATACAGCTGGAGGATAAGACGCCGCCTAGCCAGTTTACAGAGCAGATTTGCCATAACAGCATGAGAGGAGAGGATACAGCTAATTTTCACTCATTATCGGCGAGCCAGTTCAGCCGAGGTTCAGCTACAGCGAGCGTCTGGCAGCTACAGGGTGAAGGATTCATTCACAACCCAGATCTCATGCCAGGCCGAGCTGCTCCAAGAGGGTCTGCCCAGGTTCCCTTGGCTCCTCTGCTCACTCCTGAAGTGCTGGGAGGCAGAAACACTGGGTTTGGATTCAGCTCTAGATCGCAGAGTCAGACACACTGGAGCTCACCTGAGAATGATCTGTCCAACAAGacaggagaggagaggaagaggaagaggcgAGGAGGAGAAGATGTGCAtggtacagacacacacacacacacacacacaaatttctAACCTCAATAActtcctttcttctgtggaacacaaaaatgacattttaaacaacatttaaaaatagtctCTCTgttaatttgataaaatatgATTCACAAATGCATGAGCTAATTATGCGTATTGTTTGTTTCTAAAGGCAGTTAACTGAAGTTAATTaagaagcatttaaaaaaatcatgcatttgTCATGATTATaaagaaactattttaaaaaatggttacaattttttttaatgagtttgtgAATTGctctttgtaaatatataatgttgtaAATGCGTATGTGAACTAGTTAATGCAAAtgagaataatattttttaatatttttctaatttagcTCCTCACAGAAAAACAATTGGTGTGTGAAATTTTGCTCAGAATCTGTTAATTTAgctcattttacattatttaaaaaaggaaggtagaagtaatatttttttgtaaagcatgccacaataatgattataattaataaacaataatacattgttttgaataatttgttaattaatgttaCAGTGTATAGAAatcccattgactttcactttactgtaaaaaacatattttttgaagtatttataTGAATTCAGCATGAAAGAATTAGTGGTATCATGAGGGCAGGAGAGTCTTGCTCTATcggtctgt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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU47239 False 308 lncRNA 0.40 3 433028 433805
XM_043240633.1 True 7022 mRNA 0.40 27 432779 447486

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-12e13.12 LOC107653106,LOC107725106,LOC107594598,LOC107572264,LOC107723305,LOC107667694 coding upstream 15577 414822 ~ 417202 (+)
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si:ch211-155m12.1 NA coding upstream 57260 373796 ~ 375519 (+)
tnksb tnksb,LOC107750292 coding upstream 59677 353034 ~ 373102 (+)
agpat9l agpat9l,LOC107725122,LOC107704894,LOC107567651,LOC107594581,LOC105902903,LOC108411269,LOC108255643 coding upstream 82961 341495 ~ 349818 (+)
LOC122345394 ugt2b3,ugt2b1,ugt2b5,LOC107667397,LOC107572263,LOC107723313,LOC107725113,LOC107725071 coding downstream 6596 454082 ~ 462279 (+)
LOC122345389 ugt2b3,zgc:172315,ugt2b1,ugt2b6,LOC107723313,LOC107725113,LOC107572263,LOC107667397 coding downstream 16595 464081 ~ 483423 (+)
LOC122345390 ugt2b3,ugt2b1,ugt2b5,LOC107667397,LOC107572263,LOC107723313,LOC107725113,LOC107704326 coding downstream 16668 464154 ~ 468427 (+)
LOC122345391 LOC107572263,LOC107667397,LOC107723313,LOC107725113,LOC107667542,LOC107725071 coding downstream 21475 468961 ~ 472971 (+)
LOC122345393 NA coding downstream 25507 472993 ~ 473935 (+)
LOC122346098 NA non-coding upstream 30399 398821 ~ 402380 (+)
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G31983 NA non-coding upstream 133405 298474 ~ 299374 (+)
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G32032 NA non-coding downstream 50205 497691 ~ 498900 (+)
G32042 ddr2l,LOC107725118,LOC107550294,LOC107723312,LOC107594585,LOC107704361,LOC107667359 non-coding downstream 109239 556725 ~ 560608 (+)
G32067 LOC107751416,LOC107579531,LOC107653145,LOC107550279,LOC107667655,LOC107723311 non-coding downstream 169714 617200 ~ 621039 (+)
susd1 susd1,LOC107594557,LOC107704917,LOC107572260,LOC107667560 other upstream 1314 419242 ~ 431465 (+)
G32004 LOC107725159,LOC107594583,LOC107704910,LOC107667568 other upstream 25118 402573 ~ 407661 (+)
rchy1 LOC107725104,LOC107723308 other upstream 38315 389910 ~ 394464 (+)
idua idua,LOC107572256,LOC107750302,LOC107723292 other upstream 49320 367792 ~ 383459 (+)
tal2 tal2,LOC107594599,LOC107725114,LOC107723303,LOC107667406 other downstream 2682 450168 ~ 451365 (+)
G32277 NA other downstream 607707 1055193 ~ 1057153 (+)
selenoe fep15,LOC107667262,LOC107566481,LOC107750764,LOC108443918,LOC101066385,LOC105931211,LOC100703742 other downstream 664778 1112264 ~ 1115405 (+)
ccl19a.2 ccl19a.2,LOC107704660,LOC107755825,LOC107599642,LOC107668736,LOC107599131,LOC107741495 other downstream 1344342 1791828 ~ 1793266 (+)
G32611 prrc2b,LOC107704672 other downstream 1375168 1822654 ~ 1826114 (+)

Expression


Co-expression Network