LOC122350223


Basic Information

Item Value
gene id LOC122350223
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056706.1
NCBI id CM032075.1
chromosome length 24299999
location 12047509 ~ 12050968 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>XM_043246554.1
aatcGTACAGtaccattttgtattttttttacttggtgttaaaaaaattattaatctgTCTAgtagtaattattaattataatggTATTCCGATTCAAATGTTCTGTAACAGCTACTTgacaaacatttattgtttgtttgtagtgTGATACAGCTTTATCAAAGGAATTATATCAATTATCACTGTTATTTTCTCTTTACAATGACTATGAGTCAATGATGTTTCTGCAGATACATCAGGTtggacagaaaaacacaagaaagCATATTTAAATCTCTTCTTTGTCAGTTTCTTGATTGATAGAGACAGTAGCCCGTGTCTCTATTATGATCAAACTATATGCTCTTTAACCATTTACCCGGTGAAGCCGATCTCTTAAATGTTCAGTCACCAGAATATTTAATACTATAATGTTCTCAAATGTTCAGAGGATGTGATATGTGGGAAGTGacataaatcaaacaaaaaaaaaagagaagtgaatgaataaatacgtAATGATATGTACAAAACAGTTATTGTCAGCTTTATAGAAAGTGTAGTATTTTCCACTGTATATGTAACATGGCAACCTGtgatttaaatgattacataattatatttatctgtGCAGTATTTAACTAGAAAGACTGTAAAGGTCGCTACTTTGTTAAGAAAAACACACCAGCCTTGAGAatgtatttaacaatattttgggACAATCTGCATGGTAGCTAAattgttaatgaaaatgtatggtttgttgTCTTTCACGCAAGCATCGCTTCATTCGGTGCTGTAACTGAAGGTATGATGGACACATACACTATTCAAGACGTTCAAGACAAGACATATAATCTATTCAAGCCCAGCataccatttaaaatgaacatttcaacTTGACATGATGATAGatcttcatttttatgtatactgCTTTGATGTGGTTGTCAtgtttaagtgtttgtttgttcttgtACTTAGAAATCAGCCGCAATAATTTTCTGACGTGTATAAAAAGGCTGTACTTCCTTTTTCCTTCAGCTGTTCGTCATGGTCTTATGTTTAAAGAATTCGTTCCTCAATTCGACacgaaaaaaatacaaagttgTCCAGAGTTCagctttttaaacaatatttgaaatatcacAGAGGAAAATGAAGctggttttctttcttcttgtcCTCTTGGAGAACGgattGAATTTAACAGCAGAGCTCCATGTGCTTTATTCTTCAcaggaaattattttaaaatatttcttttacccatattataatatttataaaataggtTGTTGTAAGATTAATTTGTTGGGATGCTACTCCTTTGTGAACAATAGAGGACAATTTGCCTCCCAGTATGAAGGAAGAGCATTCATTACTAACTATAATGGCGGATTTGAGGTAAAAATTACAAACCTGAGCATAACGGATGCTGGAAGATACAGATGTGGAGTCATAGGCATCCCTGAAACCTATGAAGATGTTCAAGTTACAATTTCTGCTCCTCTCTCACCAATATCCTCGATCAAATCAACTGTCTGGCCCTCTTCTTCTCCCTCTACACCAATTGTTTCAGAGGACGACAAAGATAAATTAAGTGACGGCTGGAGAGCATCCTACACGCTAGCTGCTGTTTTAAGTGCTCTGGTGTTTGCTGTCATCTCAGTCACACTGCTTGTCTGCCGTCTAAAGGCCAGGGTGAAGAAATCCACAGATGAAAGTGAAATTTATGATTCTCCTAACACTACCCTGGAACAGAACGGCATCATCTACACTATGGTGGAGTTCAAGCCTTTTCAGGATCCATCTGAACTTTATGCCAATTTGCAGATCCACAACCCAAAAGACACTGATGCCGAGTCAAACTCTACAGTCACAGTAGAGGAAAGTGTATTATACTCCACTATTATGAGAGCACCAAGATAAATATTCACAATGATTATGTTCTGTGTTTTGCTGtggttgcttttgttttcttgatgAATTTGTTTTGTGAGATTTAGCAATATTACTAATTTAACACTGATACTgcagaagtatttttttttattcattatgatGATAAACGCTTCAAAATGTCTATAGAAGTAAAACAGTACCGTCTAAAAATGTGTAACTCTTTACTGTGAAACCATTTTGGTATTTGACTCATGTTGATGATTACTTAACTACTAATTTTATTGTGGATGAACAGAGAAAGTTTTAGTTATGAAACTATTGCTGGATGTTGGAAATCAGTGAAAACCAGATTTTGCAATCCTGTACTTCTTTAGGTAAAAACAGTTAGATCCAGTTAGTCTTTGAGCGAGCGAAGCGTTGTTTGTAATGAATTATTTCGGTGTTGTATAGGATTTAAAGGACACTGAGTTAACCAAGGCCACTCAAATGAATCACAACTAGGTCTACCACCTTCCCAACCATACAAATAAATTCATCAATGACA
>XM_043246556.1
ttaatcGTACAGtaccattttgtattttttttacttggtgttaaaaaaattattaatctgTCTAgtagtaattattaattataatggTATTCCGATTCAAATGTTCTGTAACAGCTACTTgacaaacatttattgtttgtttgtagtgTGATACAGCTTTATCAAAGGAATTATATCAATTATCACTGTTATTTTCTCTTTACAATGACTATGAGTCAATGATGTTTCTGCAGATACATCAGGTtggacagaaaaacacaagaaagCATATTTAAATCTCTTCTTTGTCAGTTTCTTGATTGATAGAGACAGTAGCCCGTGTCTCTATTATGATCAAACTATATGCTCTTTAACCATTTACCCGGTGAAGCCGATCTCTTAAATGTTCAGTCACCAGAATATTTAATACTATAATGTTCTCAAATGTTCAGAGGATGTGATATGTGGGAAGTGacataaatcaaacaaaaaaaaaagagaagtgaatgaataaatacgtAATGATATGTACAAAACAGTTATTGTCAGCTTTATAGAAAGTGTAGTATTTTCCACTGTATATGTAACATGGCAACCTGtgatttaaatgattacataattatatttatctgtGCAGTATTTAACTAGAAAGACTGTAAAGGTCGCTACTTTGTTAAGAAAAACACACCAGCCTTGAGAatgtatttaacaatattttgggACAATCTGCATGGTAGCTAAattgttaatgaaaatgtatggtttgttgTCTTTCACGCAAGCATCGCTTCATTCGGTGCTGTAACTGAAGGTATGATGGACACATACACTATTCAAGACGTTCAAGACAAGACATATAATCTATTCAAGCCCAGCataccatttaaaatgaacatttcaacTTGACATGATGATAGatcttcatttttatgtatactgCTTTGATGTGGTTGTCAtgtttaagtgtttgtttgttcttgtACTTAGAAATCAGCCGCAATAATTTTCTGACGTGTATAAAAAGGCTGTACTTCCTTTTTCCTTCAGCTGTTCGTCATGGTCTTATGTTTAAAGAATTCGTTCCTCAATTCGACacgaaaaaaatacaaagttgTCCAGAGTTCagctttttaaacaatatttgaaatatcacAGAGGAAAATGAAGctggttttctttcttcttgtcCTCTTGGAGAACGgattGAATTTAACAGCAGAGCTCCATGTGCTTTATTCTTCAcagAGGACAATTTGCCTCCCAGTATGAAGGAAGAGCATTCATTACTAACTATAATGGCGGATTTGAGGTAAAAATTACAAACCTGAGCATAACGGATGCTGGAAGATACAGATGTGGAGTCATAGGCATCCCTGAAACCTATGAAGATGTTCAAGTTACAATTTCTGCTCCTCTCTCACCAATATCCTCGATCAAATCAACTGTCTGGCCCTCTTCTTCTCCCTCTACACCAATTGTTTCAGAGGACGACAAAGATAAATTAAGTGACGGCTGGAGAGCATCCTACACGCTAGCTGCTGTTTTAAGTGCTCTGGTGTTTGCTGTCATCTCAGTCACACTGCTTGTCTGCCGTCTAAAGGCCAGGGTGAAGAAATCCACAGATGAAAGTGAAATTTATGATTCTCCTAACACTACCCTGGAACAGAACGGCATCATCTACACTATGGTGGAGTTCAAGCCTTTTCAGGATCCATCTGAACTTTATGCCAATTTGCAGATCCACAACCCAAAAGACACTGATGCCGAGTCAAACTCTACAGTCACAGTAGAGGAAAGTGTATTATACTCCACTATTATGAGAGCACCAAGATAAATATTCACAATGATTATGTTCTGTGTTTTGCTGtggttgcttttgttttcttgatgAATTTGTTTTGTGAGATTTAGCAATATTACTAATTTAACACTGATACTgcagaagtatttttttttattcattatgatGATAAACGCTTCAAAATGTCTATAGAAGTAAAACAGTACCGTCTAAAAATGTGTAACTCTTTACTGTGAAACCATTTTGGTATTTGACTCATGTTGATGATTACTTAACTACTAATTTTATTGTGGATGAACAGAGAAAGTTTTAGTTATGAAACTATTGCTGGATGTTGGAAATCAGTGAAAACCAGATTTTGCAATCCTGTACTTCTTTAGGTAAAAACAGTTAGATCCAGTTAGTCTTTGAGCGAGCGAAGCGTTGTTTGTAATGAATTATTTCGGTGTTGTATAGGATTTAAAGGACACTGAGTTAACCAAGGCCACTCAAATGAATCACAACTAGGTCTACCACCTTCCCAACCATACAAATAAATTCATCAATGACA
>XR_006251578.1
atacctttaatcGTACAGtaccattttgtattttttttacttggtgttaaaaaaattattaatctgTCTAgtagtaattattaattataatggTATTCCGATTCAAATGTTCTGTAACAGCTACTTgacaaacatttattgtttgtttgtagtgTGATACAGCTTTATCAAAGGAATTATATCAATTATCACTGTTATTTTCTCTTTACAATGACTATGAGTCAATGATGTTTCTGCAGATACATCAGGTtggacagaaaaacacaagaaagCATATTTAAATCTCTTCTTTGTCAGTTTCTTGATTGATAGAGACAGTAGCCCGTGTCTCTATTATGATCAAACTATATGCTCTTTAACCATTTACCCGGTGAAGCCGATCTCTTAAATGTTCAGTCACCAGAATATTTAATACTATAATGTTCTCAAATGTTCAGAGGATGTGATATGTGGGAAGTGacataaatcaaacaaaaaaaaaagagaagtgaatgaataaatacgtAATGATATGTACAAAACAGTTATTGTCAGCTTTATAGAAAGTGTAGTATTTTCCACTGTATATGTAACATGGCAACCTGtgatttaaatgattacataattatatttatctgtGCAGTATTTAACTAGAAAGACTGTAAAGGTCGCTACTTTGTTAAGAAAAACACACCAGCCTTGAGAatgtatttaacaatattttgggACAATCTGCATGGTAGCTAAattgttaatgaaaatgtatggtttgttgTCTTTCACGCAAGCATCGCTTCATTCGGTGCTGTAACTGAAGGTATGATGGACACATACACTATTCAAGACGTTCAAGACAAGACATATAATCTATTCAAGCCCAGCataccatttaaaatgaacatttcaacTTGACATGATGATAGatcttcatttttatgtatactgCTTTGATGTGGTTGTCAtgtttaagtgtttgtttgttcttgtACTTAGAAATCAGCCGCAATAATTTTCTGACGTGTATAAAAAGGCTGTACTTCCTTTTTCCTTCAGCTGTTCGTCATGGTCTTATGTTTAAAGAATTCGTTCCTCAATTCGACacgaaaaaaatacaaagttgTCCAGAGTTCagctttttaaacaatatttgaaatatcacAGAGGAAAATGAAGctggttttctttcttcttgtcCTCTTGGAGAACGgattGAATTTAACAGCAGAGCTCCATGTGCTTTATTCTTCAcaggaaattattttaaaatatttcttttacccatattataatatttataaaataggtTGTTGTAAGATTAATTTGTTGGGATGCTACTCCTTTGTGAACAATAGAGGACAATTTGCCTCCCAGTATGAAGGAAGAGCATTCATTACTAACTATAATGGCGGATTTGAGGTAAAAATTACAAACCTGAGCATAACGGATGCTGGAAGATACAGATGTGGAGTCATAGGCATCCCTGAAACCTATGAAGATGTTCAAGTTACAATTTCTGATTTAACAAGTAACAACATATTACACAGCTCCTCTCTCACCAATATCCTCGATCAAATCAACTGTCTGGCCCTCTTCTTCTCCCTCTACACCAATTGTTTCAGAGGACGACAAAGATAAATTAAGTGACGGCTGGAGAGCATCCTACACGCTAGCTGCTGTTTTAAGTGCTCTGGTGTTTGCTGTCATCTCAGTCACACTGCTTGTCTGCCGTCTAAAGGCCAGGGTGAAGAAATCCACAGATGAAAGTGAAATTTATGATTCTCCTAACACTACCCTGGAACAGAACGGCATCATCTACACTATGGTGGAGTTCAAGCCTTTTCAGGATCCATCTGAACTTTATGCCAATTTGCAGATCCACAACCCAAAAGACACTGATGCCGAGTCAAACTCTACAGTCACAGTAGAGGAAAGTGTATTATACTCCACTATTATGAGAGCACCAAGATAAATATTCACAATGATTATGTTCTGTGTTTTGCTGtggttgcttttgttttcttgatgAATTTGTTTTGTGAGATTTAGCAATATTACTAATTTAACACTGATACTgcagaagtatttttttttattcattatgatGATAAACGCTTCAAAATGTCTATAGAAGTAAAACAGTACCGTCTAAAAATGTGTAACTCTTTACTGTGAAACCATTTTGGTATTTGACTCATGTTGATGATTACTTAACTACTAATTTTATTGTGGATGAACAGAGAAAGTTTTAGTTATGAAACTATTGCTGGATGTTGGAAATCAGTGAAAACCAGATTTTGCAATCCTGTACTTCTTTAGGTAAAAACAGTTAGATCCAGTTAGTCTTTGAGCGAGCGAAGCGTTGTTTGTAATGAATTATTTCGGTGTTGTATAGGATTTAAAGGACACTGAGTTAACCAAGGCCACTCAAATGAATCACAACTAGGTCTACCACCTTCCCAACCATACAAATAAATTCATCAATGACA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_043246554.1 False 2429 mRNA 0.34 6 12047517 12050968
XM_043246556.1 False 2330 mRNA 0.35 7 12047515 12050968
XR_006251578.1 True 2465 transcript 0.34 6 12047509 12050968

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC122350149 si:ch211-269m15.3,LOC107731249,LOC107550453,LOC107712004,LOC107591828,LOC107678953 coding upstream 1939 12031564 ~ 12045570 (+)
mmp9 mmp9,LOC107668111,LOC107550477,LOC107678941,LOC107591829 coding upstream 16285 12026342 ~ 12031224 (+)
cpne5a cpne5a,LOC107731272,LOC107668107,LOC107591830,LOC107550474,LOC108265068,LOC108412993 coding upstream 84455 11900545 ~ 11963054 (+)
srpk1a LOC107549962,LOC107731242,LOC107678882,LOC107745731,LOC107667998,LOC107591832 coding upstream 165366 11869607 ~ 11882143 (+)
mapk14a mapk14a,LOC107668071,LOC107731233,LOC107591834,LOC107549963,LOC107678860,LOC108436315,LOC102231047,LOC108246862,LOC106513331,LOC103028137,LOC104939458,LOC108442382 coding upstream 178279 11857544 ~ 11869230 (+)
slc16a4 slc16a4,LOC107731239,LOC107678963,LOC107712002,LOC107668003 coding downstream 10659 12061627 ~ 12074306 (+)
slc6a17 slc6a17,LOC107668054,LOC107731213,LOC107678997,LOC107712000 coding downstream 64936 12115904 ~ 12134729 (+)
ngrn LOC107550488,LOC107668094,LOC107711999,LOC107736076,LOC107731126 coding downstream 146300 12197268 ~ 12199793 (+)
sypl2b LOC107550468,LOC107668009,LOC107711993 coding downstream 164810 12215778 ~ 12218469 (+)
atxn7l2b LOC107668112,LOC107550490,LOC107731254,LOC107711991,LOC107591815 coding downstream 169924 12220892 ~ 12228499 (+)
G63188 NA non-coding upstream 30157 12016726 ~ 12017352 (+)
LOC122350250 NA non-coding upstream 48215 11987331 ~ 11999294 (+)
G63173 NA non-coding upstream 191889 11855386 ~ 11855620 (+)
G63158 NA non-coding upstream 249538 11770781 ~ 11797971 (+)
LOC122350251 NA non-coding upstream 294924 11749560 ~ 11752585 (+)
LOC122350249 NA non-coding downstream 1614 12052582 ~ 12054352 (+)
G63195 NA non-coding downstream 4074 12055042 ~ 12055247 (+)
G63207 NA non-coding downstream 80929 12131897 ~ 12139410 (+)
G63204 NA non-coding downstream 129219 12180187 ~ 12189479 (+)
G63218 NA non-coding downstream 189673 12240641 ~ 12327938 (+)
si:ch211-163l21.10 LOC107731153,LOC107549947,LOC107668018,LOC107745734 other upstream 190088 11853594 ~ 11857421 (+)
fance LOC107731142,LOC107668098,LOC107549969,LOC107678824,LOC107745739,LOC107591838,LOC107577385 other upstream 226850 11817057 ~ 11820659 (+)
ppdpfa ppdpfa,LOC107678627,LOC107549986,LOC107745755,LOC107668053,LOC107731217,LOC108412507,LOC103034602 other upstream 483101 11562281 ~ 11564408 (+)
slc17a9a slc17a9a,LOC107731251,LOC107668105,LOC107549987,LOC107745761,LOC107549524 other upstream 506388 11534500 ~ 11541121 (+)
plp2a NA other upstream 602501 11441969 ~ 11445008 (+)
lamtor5 lamtor5,xip,LOC107668015,LOC106566397 other downstream 6689 12057657 ~ 12060197 (+)
G63453 NA other downstream 439292 12490260 ~ 12491924 (+)
G63533 NA other downstream 587262 12638230 ~ 12638565 (+)
LOC122350405 LOC107556500,LOC107717521,LOC107669623,LOC107679608,LOC107591846 other downstream 693210 12744178 ~ 12747558 (+)
zgc:136971 zgc:136971,LOC107717528,LOC107669673,LOC107556470 other downstream 771066 12822034 ~ 12833000 (+)

Expression


Co-expression Network