negr1 (negr1,LOC107673552,LOC107711106,LOC107726517,LOC107582736,LOC107585169,LOC107685309)


Basic Information

Item Value
gene id negr1
gene name negr1,LOC107673552,LOC107711106,LOC107726517,LOC107582736,LOC107585169,LOC107685309
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035909.1
NCBI id CM008312.1
chromosome length 44161018
location 38630637 ~ 38899446 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU157930
TTACTGATAGAAGCTTTGTGGATCGATGGTGGATCTATTAATTGACGTTTTAATTGGGACGATTTGGTTGCGAGAAGAGTGACTGGCTGCTCCTCTAAACCTTTTGAATGAAGCCTCTCCTTGTGTTCATAAGGCTCTCTTAGACAGACAACTGGCAGCTAAGAGATTAGACTCACATTCAGACTTTGGGGTTGGGTTGTCATGCCAACAAGGTCCTTGTTGTCTCTGTGTGTCCCTAATGGCCTCCCAACCTCAGGGCTTTTACTTACAAGAGAATCTTTTATCTACCAATTTACATCTTCAGAGGATCGGGAGTCGCCGCGCTTCAGTACGAGGGACTTTTATGGTTGTATATTACCCTGTTGTTACTTTTGTTCCCGGCTGTCCTCGGAAAGCACACGTTAATTCACCAAAGGTTCaaggcttttttcttttttgtcaaaAATGATTAATTCTATTAGTAAATCTAATGTAAAATTCTAGGTGTTTCACACAGTTCTGTGTCATACTGCTTTAAAACCAAGACTGCAAATGCAAATAAAGGCATAATGACTGTAAATGTGTGAGCTGAATTATGACTTTTTTggtaacattacattaaaggcAGTATTATGCAGCATTTTGTGCAACCTTGTGCATTGATCTGTaatgaggagagagaagagcatCTCTAATGTTGCCACTTCAGGGTGAACATGCTGCtcactgcactgtgtaactttggTAAAACCCTGTAATTTTGTACTACAAAAACTTTTTAGAAAAACTTTACACATATATCCTTGACTTTTAATGTCAATTTTGTATGTTACAGCCTAAGAAAGCACAATGCCAAATCActaaaagttctttttttttgtaccaaatattgaatttgtcatcaatacatatattttaaaattgaggttctagatcaggggtcggcaattaagttatttatattccagttaagttatttatattctagttaagttatttatttttcaagccattacgtggcaagccacaaaaaaaaagctattttggaaaatgaagtgtaatgggacgGAGTGCTagagactagtagctctccagcccagagggttgttgaacccaattgcagaacagttgatctcaaagcaggtaaacccaaaaaaagtaaaaaataaataaaaaaaatctactagtGACCTCCTCTTGAACTACTCTTAAAAGGAATGgtgtcacactttttttttgtgccagttCAAGGAAACCTCAACACTCTCGCAATCTCGCAGTTATTTCCCATGTACAGTGAGGTGACTAGCTTGTgcgcttattttttttaattttttttttatttttccactgcAGACTTTATTAAAGCCTCAAACATCAGATAACATCAGGCTCTTTCTcgtgagcttttttttttttttttgtgcaatcgCAGTATTATTAGTTAGTTGACATCAAAAAAGTACGCACTAAACTGTAGACCCACATGAAGGCGGCTTCAGGAGTTCAAGGACATTACAAACATTTACAAGCATTAACACACATTAGCATAGTAGCAAGCGTACgcactgtatgtactgtatgtagttcTATAACCTTGATACGTCACTGACTCCACACGTCACAACAGCTTACATTACATTGTGCTGCGTTAAGTTGCATTATGTTACGTTTTatcacacattattattattgctacgTTTTTCAAGCTGAGGAATTGTTTTGGCTTGTGATGCCTGTGATGAAACCCTTAACAGTTCAGGCCTATAGACTAATAGTGTGGAATCATAATAGAGTGGTAAAATAATGAATAGGTTGCAGTTCATTAACTAACACTGGAGAACGAGTCACTTCGGGAATAagtactgtataaaatgtgcCTTTTAAAGTAGTATTACGCGATCTGTTGAATACCACAGAAAAGCCTCATGttttaacacacactatatCGGTACAGTAGGGTCATGAACAGACAGAGTAACAGTGTTGTGCAGTAACGACGATAATGATGATCATAATGATGGCTACTTGCTTTAGTACCTGCTTTTCCATCTACAATGTATGCAGTCTACATAAttacatatatgtgtataactatatatatatatatatatacacacacacagtatgtaTGTGATGAACcgagacagttttttttttttttgctgtaataaATATCTCACAAAGTATTTTAGCAAACAAATTCTTTTTCGATAAGTATAATCAGAGTGAGAAAAATCAATGAAGGCTTCATTAACATCGCCTAAGTGGAtatcaagtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaggacagcGAAACAGCCAGAAGGTACTCATGCATGCATAATTACTCGCAAAGTTGCGGCTCCACAAAAGAGTATGTAAATAACAGGTAAATGTGTGCCGCGCATTTACATTCAGAACATCTAATGACTTGATAATTACATTTCGGTCGTGCATTAATATTCaaagactttatttatttatttatttttttaactgcttgCATTGTCTAAGCGCTCACTATTTTCTCTTGTTAACCCAGAATCCACTCTGCTTCAGAGACACGAGACACAAGATCTGCGGCCTCCCTCTGCTTTATCATTTCATAAAAAAGTAGTCATAAAATCCTCACGAGCTGTTGCTATTTTTGAAGCAGTTTAGTGCACTGAAAAACGGAAAActcaaaaaaacactgttatttatttgtgtttaatgcATCATCACCCCCACTGCCTTCATCCTTCATGATATTGTGTGTACATTACATATagatgaatgagtgaatgagtgctGTTTCTCTTTGGATGGATGTGTGATCTGtgtacatacaggggttggacaatgaaacagaaacacctggttttagaccacaataattcattgtcctgacggacagttctggtggaaacaggaaagttgaggtgcacattgaattctgctgtgatttgggcagccgtggttttatgttttttg
>XM_007249079.3
CTCCCATTCTTCATTTCCTCACTAGATGGTGTGAGAGCCGCTGGAGAGCAGAGCCCCAGCCTTCCCCGCGCTCACACTCTCTCAGACCAAAACAAACCTGGGAAAGTACGCGGAGCGCCGCCGTTCAGACGGGTTTATACGAAGGGAAGAGCGGAGTTCACCTATTTCTTATTAAACTCACGCTTCTTTTTTccgtttgtttattttttattttgctttttaaataacgGCGCGAATAAGCCTCGAGCTGGCGGTGATGGACATTATGAGTGCGGTGCAGGATGCGTGTGTCTCCGGTCAGTGGCTCACAGCGATCATTCTCAGTCTCTGCTGCTTTTTGCCTTCGTGCTTGCCCGCTGGCCAAACTGTGGACTATGCTTCGACTGAGAACGTGGTCAGCAGACAAGGGGACACGGCACTTTTGAGATGCTACTTGTTGGATGGGATCTCAAAAGGAGCATGGTTGAACCGTTCCAGTATAATATTCGCAGGGAATGACAAATGGTCAGTGGATCCTCGTGTATCCATCGTTTCAAATCTGGGGGATAAACATGAATACAGTCTACAAATACAGAAAGTGGATGTAACGGACGAAGGCTTGTATACCTGCTCGATACAAAGCGAACGCAATCCACGGCCAAAGCTCATTCAGTTAATTGTAAAAGTTCCTCCCAAAATATATGACATTTCATCGGACGTCACGGTAAACGAAGGCGGCAATATTTCACTCTTCTGTTTAGCCAGTGGCAAACCGGAGCCTACGATCACCTGGAAACACATCTCTCCATcatCCAAGCATACCTGGACTGGAGAGAACATGAACATAACGGCTATAACTCGAGATGCAGCGGGGGAGTACGAATGCGGCGCCGGGAACGACATTGCCTCTCCTGACACCAGGACTGTGAAAGTCGTAGTCAATTATCCTCCACACATTCAGGAGATGAAGAGTCATGGGGTCCGGCCTGGTTTaccagcactgctgaggtgcgAGGCGTCTGCTATCCCCTATCCAAGCTTTGAGTGGTACAAGGGAGAGAAGAGGCTTAGCAGGAAACCTGGCATCGAAATCAAGAACCTCAGCTCCAGATCAGTCCTCACAGTCTCCAACATTACGGAGGATCATTACGGCAACTACACCTGTGTGGCCACCAACAGGTTGGGAACAGCCAACGCCAGCGTGTCTCTGACTCCCCCCAACACGGCTCCGTATGGAAGTACAGGAGGAGGCGAGGTCCTGCTGGCCTGCCCGTTCCTGCTGCTGGCGCTCTCCTCCCTACTCTACATTTACTAGCCCTGCGGACAGCCATACACAATGACTGTAAAGAACCCTTTCGAGCATTTGCAAATCCTTTGACATCGCTGATGACTGGATCCAATCTGGTACTGTTTGTTTGGGAAGCAGCGAGGGATTTTAATCAGCAGTACTTATGTTTGGgatggtgtttttattttttttcctttttttatttaatttttttctctttttttgtcctGTGAAATTTCTCATCatgtaaatacatacaatttaggcttttttttttttttcctctctcttattttattttcttgattGCCCACTCTGTGAATCAGCTCACATTGTCCTCTTTCGGAAAGCTTCAAAATTAGCCGTAtatagagggagggaggggtgggAAAGGGGCGACATTAGAGGCTTTGTTGTTGGAAGCGGCTCAGAGGGTGCCCTAGCGTGCCGCCTCCGTCAGAGTGCCGCTGCGCCGCACTTCCATATAGTCAGGCATGGAAACGCAGCGTTTTAGGTCTCGGGGGTTCGACTAGCGGATTTCAATCCAGTTATGTTACGGAAACAATCCAAACAAAGCTTTGAAAAAGGAACATTCTGAGATGCTGAAACGATGATAATTGTACGGCGGATGACGAGCCGAATGTGCTGACACAGATTCGCGGGGTAGAGCGTTTCATCACTGAGTAAGAATTGCGACGTGTTGTGGACCAAAATTACAGCCATAATTCAATGATTTAGCGCATTATGCTACGGAGGCTCATTCGCTCTACACAATAAGAGAGAAGACCGCACTGAAGGAAGTAGCACAGTCTCGTCGCTTATTCACTATAATCAGCATGCCTTGTCTGCCATAACAATATCAACAATATCTTGACAGCAGAGATTTCAAGAGAGAAGTATTGAGAGTATTTCCCAAATACATaacaatatttgatattttgtaGACTTCtcgatatatatatactagaccACATAGTATATGATTAGGAGATGAACCCGAACCAGTTCCAAGCACTGAATATATGCCATACGCCAGATTTGGCCGTAAAACAGCCGTGTTTTTGCATCTGTGCGGGAAAAAAAAGAGCCACAAACCACGGATGCTACAGTGTGTGCTGTGAACGAAACTACTCAATATAAGATGTATTTAATTAATGTGAATATGATGTATGTATAAAGATATTACAGAGAATCTGATGAGTTTTTATGCACTGTGTTCAATTTTCCTGATGTTTACAAATTGACAGTATGCAAAAATGACCGCCAGTTGATTACTAATCCTAATTACGATGATGGATTTTAAACCTTCTCTTACATTTATTGAAATTATGGGTTTAATTTTTAACGTCCACattagtaaaaataaagcaaGTTCACACCGTGTCCTACGCAGCTTAGCCTGTGCCTGTGGGCAGTGGATGAACTAAACTACTTACTGTATTTCCAACAGAACTTTTGTCTGATCGCCTAATTTTGTGTTTCACTATAGctgtcacttatttttttattttatttgatttgtttaattGATTTCATGTGTTTGGtctaacatttctttttttttttttccttttttttcttgatattAAGTTCTGTTTTATTATGGCTATAATTTGTACAGgattttttgtattaatgtattaatgcatCACATGTACCCCCTGCTTTGCTTTAGTCCGTGTGAAACTTGCTCGAATAGGGAAGCAGAAAAAAGCTTATGTTCGCTTCCCTCGTGAGGACAGTATGAAGTGTGGGTTTCAATATGTCAATGAATATGATCTGAAAGAAGTATGCAGTATGGCATAGTTTACAATGTTGTCTTTGAGTTTAGATGCCATATCTGTCGTTGGTTCTTGTCAAAAACAAATAGAttcaatttaagaaaaaaaaaaaaaaagaaagaaagaaaaaaagtacacGTTTATAATCAAATAATCTACTTTTTAACTCAGAGGGTGTGAAGCAGTTATACGATATCATAGAAGATAAGTCGTGTGTGTATTTGGAGAAAGTagaattaattttttatattattggtaGAGCCTGTGTCTAGGTTTAGTTTAACCTCTACCCTAGTTCTCACACACGTTGTGTATTATGATGTGCAGAAATTATGATTGTGCTGCATGTCAAATGAATATGTACGTTTAAAGGTGGCCAATGACCATAAATCAGTACTGTTTGAGTACAAAACCAGTTTCAAGACTGTTTTGACTCGTTTTCTCTCACTGGAATGAACAAGTACAAGTCGTACAGCGTCAACATACGAATCCTCCATGTTCAAAAGCTTCTTTTGACGATGAAACACCTTTGGCACAACAGTCTGAAATGACCATCGAATCTCCCAACACGGATTTACTTACTATACTGTACATGGGATTTCTACTGAAACCTGATAGAAAAATGTACTACGAtgtatttttacacacattCAAATGCTACACTTTTCACATTTCGACACATTTCCTCTTTAATTTCACATATTTTGGATTCAATGTGTAGCGATATTGTTGTATTATTAATTCaggtaggaaaaaaaaaacgttagttaccataaataacaataaacatttgaaacatcaggttattattattattattttttacctaCAGCACAATAACAGAGACTTGAGGACTTTTTAATTTTGtagttttactaaaaaaaaaat
>XM_015605766.2
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Function

symbol description
negr1 Enables identical protein binding activity. Is expressed in head. Orthologous to human NEGR1 (neuronal growth regulator 1).

NR:

description
neuronal growth regulator 1 isoform X3

GO: NA

KEGG:

id description
K06775 NEGR1; neuronal growth regulator 1

RNA

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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103032030 zgc:110788,LOC108440097,LOC107711028,LOC107673477,LOC107726515,LOC107585211,LOC107580362 coding upstream 97432 38996878 ~ 39000165 (-)
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G116805 plcxd1,LOC103035541,LOC105895009,LOC107711026,LOC107673474,LOC108441321,LOC107585164 other downstream 246039 38381270 ~ 38384598 (-)
tubgcp5 tubgcp5,chst7,LOC107585157,LOC107582726,LOC107673606,LOC107753407,LOC107582727 other downstream 382013 38233474 ~ 38248624 (-)
G116581 eif4b,LOC108441049 other downstream 1584849 37041361 ~ 37045788 (-)
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Expression


Co-expression Network