klhdc8b (klhdc8b,LOC107712738,LOC106572099)


Basic Information

Item Value
gene id klhdc8b
gene name klhdc8b,LOC107712738,LOC106572099
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035911.1
NCBI id CM008314.1
chromosome length 35718434
location 24854201 ~ 25008250 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
klhdc8b Human ortholog(s) of this gene implicated in Hodgkin's lymphoma. Orthologous to human KLHDC8B (kelch domain containing 8B).

NR:

description
kelch domain-containing protein 8B-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

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XM_022677397.1 False 8747 mRNA 0.43 6 24854201 25008250

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC103032451 LOC108436322 coding upstream 15617 25023867 ~ 25043285 (-)
LOC103031928 asb14b,LOC108436293,LOC108276494,LOC107560887,LOC107671999,LOC107737718 coding upstream 36200 25044450 ~ 25053042 (-)
dnah12 dnah12 coding upstream 45849 25054099 ~ 25098182 (-)
LOC103029485 NA coding upstream 181487 25189737 ~ 25197438 (-)
rpl10 rpl10,rl10 coding upstream 209939 25218189 ~ 25221346 (-)
G134520 NA non-coding downstream 24317 24829305 ~ 24829884 (-)
G134516 LOC103033727,LOC108436326,LOC108276432 non-coding downstream 33612 24817171 ~ 24820589 (-)
G134500 NA non-coding downstream 180412 24672405 ~ 24673789 (-)
G134497 NA non-coding downstream 197629 24654166 ~ 24656572 (-)
G134496 NA non-coding downstream 200110 24653384 ~ 24654091 (-)
G134535 NA non-coding upstream 13982 25022232 ~ 25022463 (-)
G134748 NA non-coding upstream 182714 25190964 ~ 25191789 (-)
LOC103026004 NA non-coding upstream 276193 25284443 ~ 25303167 (-)
G134775 NA non-coding upstream 420962 25429212 ~ 25429657 (-)
G134779 NA non-coding upstream 447301 25455551 ~ 25461401 (-)
trnah-gug_15 NA other downstream 43699 24810431 ~ 24810502 (-)
ebp ebp,LOC107672060,LOC107712744 other downstream 44866 24806913 ~ 24809335 (-)
LOC111194123 NA other downstream 222344 24621617 ~ 24631857 (-)
trpc4ap trpc4ap,trpc4apb,LOC107741324,LOC107737634,LOC107562468,LOC107672047,LOC107560917 other downstream 359776 24483965 ~ 24494425 (-)
LOC111194023 NA other downstream 420730 24431159 ~ 24433471 (-)
G134867 si:rp71-17i16.4,tnnc2,LOC103044939,LOC108434838,LOC107737591,LOC107568845,LOC107672054,LOC101472191 other upstream 783637 25791887 ~ 25798373 (-)
taf13 taf13,LOC107671955 other upstream 795827 25804077 ~ 25805824 (-)
LOC111194124 NA other upstream 906151 25914401 ~ 25927945 (-)
G134931 uba1,LOC107737583,LOC107672015,LOC107699604 other upstream 978941 25987191 ~ 26004934 (-)
G135102 emc1 other upstream 1571926 26580176 ~ 26581742 (-)

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