G192574


Basic Information

Item Value
gene id G192574
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035918.1
NCBI id CM008321.1
chromosome length 32506130
location 23992196 ~ 24049734 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU261312
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>TU261313
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>TU261314
cacactgcttttggataactttatgccactcctggtgcaaaatttcaagcagttcagcttggtttgatggcttgtgatcatccatcttcctcttgattatattcaatttagtaaatcaaagaaactcaacttTTTAAAGTGGTCAACAGACATCTGTTATTTGAATATTAGCATTGTTGAAATTAGTTCAGTGAAGGGAGCCGCCATCTTGGAAAGCTAtcaaaaattgtcattttaagctTAATAAATGAGCTTAGGTCACACTCTTGACACATGGCATTATCCTAAAGGGGTATAATCAAATGATCTGATCTGAGGTGAGGGTGTAGGTGTCATTTTTACCACAGCTGGCCATGCAGCATCATAAAGAGATAATTTAGGACTATATTAAagaccattttttttctctcacattaTTTTAAGAAGGTGAAGCTCAAGAATAAGACACGTGCATTTTAAAGAACttttgaagaaaaagaaaaaaaaaatacaatttatactAAGTTCAAAATCATTCATTTCCTTTAACTGATTCATTTAAATTTTGCAATtaaacatttgtacaattttagaaaaaaaaacaatgcatatataatactattttaggtttttgttttttacttaaaaGCTCGACCTTGTACACTCGCACATGCAACAGTGAAAGTGGCCTAAAATACACCCACACATCAGACACAACACTTGTGGTGACATGATTAATTTCTCGAGTCTTCTGCTAGTGTGAACACAGGTTTAAACTATATTATAAACTTCTTATTGAGACTGCGTCCAAATGATGACAAGACCAGGTCAGCGTTAAAAACCTGAAAACAGCAGGTTGGCATTGGTTGGATCAAAGCTCTTTATCTGAACTAATATCCCCCTGAACCCCATCGCTGTGACCTttacacacgcacatacacacatgctcacagtattattattttatattaatttattttctattgtgaTATTTATTCAAACACAGAATGaccaaaaacactttttcaattTTACTGTAAACTGTAGCTCACTGTAGTTTTAGACACAGAAGATTAGCTGTGATGAAAGGTTAGCTGAGAGTGTTAGCTTTTGTTAGCTGGTCAGCAGCGTTCTAGAATTTGACCACATGCACTGATACAATTTACTTTGTCtttgtcatcatcatcatcttcatcatcatcatcactattatcatcattaggggtgtcacgattctctaaatccttaaatcgattttatttccgattttagggtcacaattcgattcaattctcagttttcttttttttttcttttttttttacagcagagaggcctatgccagttttagattagtctatggtcagtcattggtttagTTCATCAAATtaacaatatcttaGAGAGCTTGTGTAGcgtagagggagggatcgtcaatcctctttttgacttcgaggcttgggaccatgacataatttcgatcgatttcgatgacATATcgaaaatcgtgacacccctaatcatcattataatgtagAAACACACTGAAGGTATATCTCTGTCCTGTGGCACGGGTTCGTCTGATCACTGCATTTGAAGGGAATATtgtcaattattttttatcaatattatttatatgataATTTTCCATGGCTGTTCATCTCAAGACTTCCTACAACTTTTTCTGCACTGATCTGTCTTTCAgaattttttactgtttctttgTATGctctttaaatgtgttaaatgtgttgCGCTGCAGGTATTCCAAATCTGTGAACATTCAGACACACACTGCAATTTCAGGCACGATTATACTAGTTTGATCAGTCAATTTTCCAACAAACAAAATTGATGCATCTGATTATATTGgtttttgagttaactcaactttatttagtcatgcattctttaaacttacattttttactaaTCTTTAGCTGAAACATTTACTATATTTTTCGCacaataaggtgcaccggattgtaaggcacattatgcgacactagtaaggaacaggggtgccgccatgttttccttctaattaaatcaaacgagcactggatgttaattttacacagatttttttcctgaaaactgtttatttgggtaagtaaagtccttccgtttatttacagtaaacttagatctCCAGTTTTCCACAAAGACTgcagcattagtggctaaccccTAGCGCCAACTGTTTGCAGCTAACGCAGCCCGACATCATTACACTGAGTGGTCTGGTACGCCAgggtgatatcagctagcggtttgtttTAGCacgataaacacacaaactacagtttgatatactcacctataaacagcaaaagagctagcgctgaacgaagttagtggctaatgctaatgctgctccagcagtgctagccagggttagcagcagtaattcgtaaaaaaaaaataaaattttcttttaaagtcaaatgagcgcaggatgttaatctacacagatttctcttctgaaatctgtttatttggttgagtaaagcgcttccatttatttacagtaagcttagcttAGGttgcaacattagcattagcggttaaGCACTAGctgaggaacactgagtgttctggtaagtcagggcgatattagctagtgtttCATCCCACGTAGCCTGTTGTAACACAGTAAATGTGCTTGCTCTGAACGTCAAAATAGCTAGCGCtgtgattagcagctaatgctagaactgtgaaacttctgtataatgctgtacttcagcggagtggctttacttctccttaaaaccagactggtaaaattcttacataaggctcaccagattataaggcgcactgacgatttttactgtatttaattggaatttaaaacattataccATTCaaacctgcatttttttttatttatcaaagAACAAGAAGTGTAAGATCTTACAGTGTTTGTCTGGCTTTACTGACTTTCCATTAAGTATAAAAAACCCTCTGCAAGACTACAGTGAGCAGGAAATACCACAACCCCCCAGATTAGTACACTAAGTATGAGGCACTTCCTGTATTAATAAACTGTGATCATTCTGGAGTTCTAAAGGTAGCAAAGCCCACTGTGTACAATAAACCCTGTatgtgtaacttttttttttgtatttcgccattaaacattaaatagaaCCTGAACCTTCAGTACTGATCCAGGATCAGCTTCATGCAACCATAATATTTACCATTCTACGTCCCGTCAGATCTCAGATCAGTATTAAGGGCAGCTTTCTGAAacgtgtaatttttttaagatggGAATGTTGTGTGTTGGGAGTCTGTTGACTCGTTTTTATGAGTGTGGGTTGGGTCGTCTCTGCTGTCAGGTCTGCCTAATGTGAACTGAATGAGCCTGCCAAATGGAACTTGTAAATATTCTTCAATAAACACCTTTtgattgtattaaaaaataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU261312 False 3541 lncRNA 0.36 3 23992196 24034791
TU261313 True 3542 lncRNA 0.36 3 23992196 24034791
TU261314 False 3438 lncRNA 0.36 4 23992196 24049734

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103040327 LOC108425717 coding downstream 3997 23980543 ~ 23988199 (-)
zc3h11a NA coding downstream 22029 23957828 ~ 23970167 (-)
LOC103046362 maf1,LOC108425756,LOC108254834,LOC107727190,LOC107685718,LOC107602775,LOC106583327 coding downstream 35859 23948531 ~ 23956337 (-)
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LOC103041505 pnp4a,LOC103041505,LOC108411380,LOC107727193,LOC107685744,LOC107655042,LOC107727769,LOC107559547 coding downstream 295949 23682209 ~ 23696247 (-)
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G192484 NA non-coding downstream 107658 23876635 ~ 23884538 (-)
G192439 dvl1,LOC108411373,LOC107685713,LOC107560111,LOC107749512,LOC107655081,LOC107727776 non-coding downstream 385165 23602319 ~ 23607031 (-)
G192428 NA non-coding downstream 433020 23544535 ~ 23559176 (-)
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G192251 adipor1,LOC107749488,LOC107385668 other downstream 933391 23054633 ~ 23058805 (-)
LOC103041653 phf20,LOC107655063,LOC107727854,LOC107561906 other downstream 1188554 22786163 ~ 22803642 (-)
amhr2 NA other downstream 1269291 22709549 ~ 22722905 (-)
alas1 alas1,LOC106583798 other downstream 1629738 22349347 ~ 22362458 (-)
G191862 dusp7,LOC107561798,LOC107697567,LOC107677944 other downstream 2140554 21846969 ~ 21851642 (-)
G192815 mdm4 other upstream 1161941 25211675 ~ 25217550 (-)
LOC111195415 tfeb other upstream 1825176 25874910 ~ 25878653 (-)
fam72a fam72a,zgc:101564,LOC108425783,LOC107590148,LOC107656018,LOC107548849,LOC107675824 other upstream 2661519 26711253 ~ 26724106 (-)
G193097 NA other upstream 2981929 27031663 ~ 27033089 (-)
LOC111195340 NA other upstream 3341060 27390794 ~ 27391571 (-)

Expression


Co-expression Network