LOC103024232 (arhgef10la,LOC108438575,LOC107695083,LOC106565901)


Basic Information

Item Value
gene id LOC103024232
gene name arhgef10la,LOC108438575,LOC107695083,LOC106565901
gene type coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035918.1
NCBI id CM008321.1
chromosome length 32506130
location 8438713 ~ 8733125 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

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Function

symbol description
arhgef10la Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity. Human ortholog(s) of this gene implicated in ovarian endometrial cancer and ovarian serous carcinoma. Orthologous to human ARHGEF10L (Rho guanine nucleotide exchange factor 10 like).

NR:

description
PREDICTED: rho guanine nucleotide exchange factor 10-like protein isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K16727 ARHGEF10; Rho guanine nucleotide exchange factor 10

RNA

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Neighbor

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G188009 NA non-coding upstream 437336 8000834 ~ 8001377 (+)
G187904 NA non-coding upstream 1060125 7377151 ~ 7378588 (+)
G188178 NA non-coding downstream 37183 8770308 ~ 8771086 (+)
LOC111195453 NA non-coding downstream 86031 8819156 ~ 8820096 (+)
G188185 NA non-coding downstream 116181 8849306 ~ 8849567 (+)
G188186 NA non-coding downstream 122381 8855506 ~ 8891767 (+)
G188188 NA non-coding downstream 149843 8882968 ~ 8943622 (+)
agtrap agtrap other upstream 167001 8256796 ~ 8271712 (+)
LOC111195452 NA other upstream 325471 8112003 ~ 8113242 (+)
trnaq-uug_4 NA other upstream 1246487 7192154 ~ 7192226 (+)
LOC103029365 NA other upstream 1340041 7077165 ~ 7098672 (+)
p3h1 NA other upstream 2639734 5779891 ~ 5798979 (+)
LOC103032765 igsf21,igsf21a,LOC108438574,LOC107749415,LOC107727841,LOC107685626 other downstream 550670 9283795 ~ 9819955 (+)
G188325 NA other downstream 1121182 9854307 ~ 9856995 (+)
LOC111195371 NA other downstream 1368630 10101755 ~ 10106530 (+)
G188624 NA other downstream 1570235 10303360 ~ 10303665 (+)
G188771 NA other downstream 2114946 10848071 ~ 10852736 (+)

Expression


Co-expression Network