G95533


Basic Information

Item Value
gene id G95533
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 3669705 ~ 3727497 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU108664
AATGATTAAACAGATTTTATTGACAGAAAACAAAAAGCTGATATGATAAACAATAGAAGCTTTGCAAATATCAGTATATAATATGATATGATATAAATTCATAAGTAGGCTATAATGCTTACAGCTTTCTCAAAACCTGACAAATGTACTATCAGACAAACATTTACCAACTTTTACCATTATTTATTATCATATTACTACACATAATATGACATTTAAAATGCAATAGCATTATTATTAAATACGTTATGATATTCATTATAACAGGGTTTCTGCAGGTTTTATAAAGTTAGATTTAAGACTTTTTAAAAACCAAGTAAAGAAAATGTAAGGAATGAAGTGAAGGGAACACAACATGTCAAAATGTCTAGATATGAATTGTACTAGTAACACTACAAAGTTTCAAAATACAACTTCCCACTGATCTCCATTACTAATTCATTTAAAAAAAAATTATAAAACATCATATATTCTTGATGTTCTCAGTATTCTCAGTCTTGTTTTCAAGTGCAAATGTCAAAAGAGTCTTAAATCAAGATACATTTACTTCACAATCTGCCAATGGGCTCAGAAAAATTAGAAAAGTTAATTCAAAGAGAAAACAAGTTTTCATACTCCATTGACATTTGTTTTTGTTTTAAGTGTAAACTTAATTTTGCTTAGACTTTATTTCTTCATTTTACATCTCAAGCAAATGTATCTTGATTTAAGGATGTTTAAATATTTGTATTGGAAAACGACAAAAATACTGAGATACTGGGAACTAAAAAACACTAACATTTATTTTTCGCTCTGCATGCAACATTTAATGCAGGAACTTGATGAATGTAGTCTAAGTTTTTCTGTTCTGATATAAAACCTGCAAGAACCCTGATAAAAAAAAGATACCCTACTCAAAGTAGTGAGTACTTTAGATAGCATGGCACACAGCAACAACCAATTCAATCCTTACAAAAACTTTTGAGTGTTTTTATTCATATAAGAGTATTTGCTAAGGTTATGCCTTTATCATAACATCACTTTCTCTGTTAATTAAGCATTTTATGTTGAGTGGATTAAACTATAGTAATGCATTAGATGTGTGTACTCACTGGCACAGCATTTCATTGCATTTTGCTTCCACAGCGGCAATTCAAATACTTGCCCTGGCTGTACAGTTACTTTGCTCCCACATACAAAGAGTCTCAAATTACTGTAAACAAGCCAGTACATATGTAGATACATGTCTGGGTAATAACAGCAAAACTAGAGAGAGACATTTACTCTCTCCCTCACACACATTTTATCCACTTTTTCAGGAACTATGTGCCATGCTACATTTATATATAATATTTATATTATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATATTTCGCAAATGTCAAACGAATGTTAAATATAAAACTAACTTAACCGCAGTGGGCTATACTTGAACCCTATTCTGGAGCTTTTTGCAGAACCCTAGCATTTTAACAAATTTTGTTTGCTTTAAAGGATTAGTTCACTTTCAAATGAAAAT
>TU108665
AATGATTAAACAGATTTTATTGACAGAAAACAAAAAGCTGATATGATAAACAATAGAAGCTTTGCAAATATCAGTATATAATATGATATGATATAAATTCATAAGTAGGCTATAATGCTTACAGCTTTCTCAAAACCTGACAAATGTACTATCAGACAAACATTTACCAACTTTTACCATTATTTATTATCATATTACTACACATAATATGACATTTAAAATGCAATAGCATTATTATTAAATACGTTATGATATTCATTATAACAGGGTTTCTGCAGGTTTTATAAAGTTAGATTTAAGACTTTTTAAAAACCAAGTAAAGAAAATGTAAGGAATGAAGTGAAGGGAACACAACATGTCAAAATGTCTAGATATGAATTGTACTAGTAACACTACAAAGTTTCAAAATACAACTTCCCACTGATCTCCATTACTAATTCATTTAAAAAAAAATTATAAAACATCATATATTCTTGATGTTCTCAGTATTCTCAGTCTTGTTTTCAAGTGCAAATGTCAAAAGAGTCTTAAATCAAGATACATTTACTTCACAATCTGCCAATGGGCTCAGAAAAATTAGAAAAGTTAATTCAAAGAGAAAACAAGTTTTCATACTCCATTGACATTTGTTTTTGTTTTAAGTGTAAACTTAATTTTGCTTAGACTTTATTTCTTCATTTTACATCTCAAGCAAATGTATCTTGATTTAAGGATGTTTAAATATTTGTATTGGAAAACGACAAAAATACTGAGATACTGGGAACTAAAAAACACTAACATTTATTTTTCGCTCTGCATGCAACATTTAATGCAGGAACTTGATGAATGTAGTCTAAGTTTTTCTGTTCTGATATAAAACCTGCAAGAACCCTGATAAAAAAAAGATACCCTACTCAAAGTAGTGAGTACTTTAGATAGCATGGCACACAGCAACAACCAATTCAATCCTTACAAAAACTTTTGAGTGTTTTTATTCATATAAGAGTATTTGCTAAGGTTATGCCTTTATCATAACATCACTTTCTCTGTTAATTAAGCATTTTATGTTGAGTGGATTAAACTATAGTAATGCATTAGATGTGTGTACTCACTGGCACAGCATTTCATTGCATTTTGCTTCCACAGCGGCAATTCAAATACTTGCCCTGGCTGTACAGTTACTTTGCTCCCACATACAAAGAGTCTCAAATTACTGTAAACAAGCCAGTACATATGTAGATACATGTCTGGGTAATAACAGCAAAACTAGAGAGAGACATTTACTCTCTCCCTCACACACATTTTATCCACTTTTTCAGGAACTATGTGCCATGCTACATTTATATATAATATTTATATTATAAATATTATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATTTATATATATGCGTTTTTGAGCCATATAAAAAGTCAAATATACAGTACTGTGCAAAATCTTGTTAGATTTAAAAAATAAATAAATAAATAATAATGTAATTATCCAGTGAGTTTTTTGTATGCACAAGGTATGGTCAAAACAGAGATTTGGTATCACCGTCATTGAGCCAGTCTGGGACTACATGAAGAGACAGTCAAAAACTATGACAGATTAAATCCATAAGAACATCTTAAACGCCTGGAGATATCTACCTGCAAACTACTGTGAAACATTTTAGGCACTTGTGAAAAAATGCTGCACCATAATGATGTTTTCAAAAATAATGCCATAAATAGATTTTATTTATCATATATCATATATTAATCAAATCAATATTTGTTATGACCTCCTTTTGCTTTTAAAACAGCTTTTGTATACTTGCACGCTGTTTTTAAGGTAGCTTTGCAGGTAGAGATAAATAACCGTCTTTTGCACAGTACTGTACACACTAAACATACATATTCTCCTTGGTGTCCATAGAATGAGATCTTGATAAGTAGAAATTAAAAAATATTTTCCCCTTAATTTGCATACTAATTATGTCATGCTACATAGTAACTCAGTGATCTCTATGGAATTTAGCATCATCACCATAGTGAGTCAGAATGGGAAATTAATTTACCTATACTTTCTTTTTCAAGAAAACCTGTGCTCATTTGGGGGAGGGGTACATGTAGTTAGTATATTTATGTTTTATATATAATAGAGTTATATTAAAGCTTCATTATCATTCTTTCAATAATTGATAATGTAACGTCATTTTTGTGTCAGTGCCCTCTTTACAGTATTTCTGCCTTTGGTGTAGCACAAGACAGAGTCACAATTTCTTTTGTATGTAAAAAAGACAAAAACACAAAGCACTAAAATCTATAAAGCTGTGAGAGGCTAAATGCTGCTAAAACAGTAAAAACTCTGACAACAGATTACTCTAAATTGTAATGCTGACATGCACTCCCTGTAAAGCTGCTTTGAAACGATATGTATTGTGAAAAGCGCTATACAAATAAATGTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGTGACTGTTTAAGATCCTCCCTTATGGTTGGCAGTCCAGATTTTTATCAGCTACACCACACCATTCATTCCAGTGTCACTTGCCCTGTGGTAACCTTTCGACAGTAAAACCAAACAGTGATCAATGCACCAACAATCCCGATCCCAATCACAATTAAAGCAGTACCCCAGTCAGGTAAACCAGCTTAAATACATGCAAAAAGAAAACAGAAAATGTAATTATGGTATTATAATGAATAACAAATAGCATCAAAACTGACTTTCAAAAGGCAAAACACTACCTTTTTTGTTGTCATCTTGTTTTTCCTCAGGTTCTATAACTTTAGACAAAGACACAAACATGCACACTTTATATACACTGAAAAACAACAGAATTAAAAATGGCCTAAAACAGCTTCCAGAGCATGTATGGTGTGAGGCTTTATCAAGTTTACCTGTATAATTGATTGCACAGTGAAACTGTAACAGAAGAAAAAGACATTGTTAGAACCTCACATGTCCTCATGACAATGCATTTAGCGTAGGGGTGGGCAACTCTGGCCCTCAAGAATCACTTTCCCCTTACGACTGTTTCACACATACTCCGTTTGCAGCGCGTATGCGATGCAGGAGCAGCACGCACTATTGTGCTTTCACATAGGCTATGCCGCGTTTGCAGTGCGCAACTGATCCGTGGCTGTATATCACAAACACAAATCCAAAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTCAAAAATTGTTACTGAACATGGCTCGTCAGGATTGCGATTCTCTTTGTATACACTCTTTCTTAGATGTCACGTTTAAACTGCATTTAAACATCGTTTTATTCAATTCATTGGGCCTACTAAACTTTTATATAGGCTACTTTAGATGTATATATTACGTTGCTCACATTTAAAAAGAGGCTATATGTTAAAATCACAAACATTTTAAATTAAAACTTTCAATAGACAAAAAAGGGCCTTCTTTCGCTTTAAATCGTTTTACAAGAAATCCTACAGGTCATAAAGGAACTTTTTCCCACCTCCACAAAGAGACGAGTGCTATCCATTATGTCTCCTTGTTTAAAGGTAAGGTGTCATTTTCTTGTCATCGCGAGATAACAAAAGTTGTTTTCTCAAGATAACGACTTAATTTTCCCGTCATCTCGACATAAAAAAAGATATTTTACAATGATTGTTTGATTCTGAAACACACTGCACCCGGCCGGAGTCTGCTGGTAACGAACACAATTTTCACGCATCTGATCGACAGATAATCCGCGCGCTCTAATAGGCCTATGTTGTGGATATTTCAGCTGAATGTTTACATCGCTTAATAATAAAGTCTACAATAAATAAATAAATAAATATTATCAACCACTGTTTAATCAAATGTACGCTCATCATTTTATTTAACGTGTTTAAACTATCAACCGAGCATTCAACACCTCAAGCGCAGGCGGAGCCTTCAGAAGGATGCCAGATTATTCTATAACTATTCTAAAAACTTTTAACACTGCTTGGATTCAACCCACTTTATTTTACTCATTCCTTTGAAATAAAATTATATTACATAATTTGTTATTTTTATTCATTATGATAGGCTGTGACTGATATCATGGCTTCCTCCTTCTAGCCATGCTCTTCCATTAAAATGAGGTGCAACAGTCCAGATTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAACAAAAAAATGAATCCAGCTAATACAAGCTAAGTACAATCTTGGGATGCTGTTTGAGAAGAGTGTTTATGTGTATGTGTTTGGTTTCTTACAAAGAAATGTAGAGAATACAATAGGATACACACTATCACTGAACTAAATGCATAGGCTATAAATCATATTTCTTATCAATATACATTATGTGACAGTGAGGTAAACTAACAGTTTACTGAAACTGCGATGATTAAAATGGAGTCTTAAAGATGCACAATAAGGTGCAAACAGAATACTAGGCGACATCAAAATTAATTTTAATAAACAATAACTTTAGTATCACACCGAACACTATTGTGGTAGTGAAACTGTGATGAGTCATAGCAGTCAGAACGTAACGATAACATTTACACTTTCAAACAAACAAACAAATAAACAAAAAAAAAATCATATTCAAGCAACATTAGTTAAGTTAATTAGCCTACTTAACGCACAAATTAAAGCGATCACGAAGTAGCAAGTTCTTCACTCTCTCTGTCCCAAACGCGTACTGGGCCAATATGAACTAACAGTAGGCCTAAGGTGGATATACCGCACCCCATCAGTTACATTTGTTTCTATACTGTCACCTGTTGGCACATTTGTTTAACTTAGAGAAGATAAGTCGTGATAATGTTATGTGCTTTTGTTATGTCGAGATCACAAGAAAATAAGCCTGATTTAGAGATTTTTTTTATTGAAGCATAAATGAAACGGACACATTTGTTGCTGGTACCTGAATGCTGTCACAGCGAAGCTCCCACTGCAGGTCCTCACAGGCGCTGACGGTCAGATTTCCAAGTGTCACTGCCACTACAAAATCCATTTTCTCTTTGCCG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>TU108666
AATGATTAAACAGATTTTATTGACAGAAAACAAAAAGCTGATATGATAAACAATAGAAGCTTTGCAAATATCAGTATATAATATGATATGATATAAATTCATAAGTAGGCTATAATGCTTACAGCTTTCTCAAAACCTGACAAATGTACTATCAGACAAACATTTACCAACTTTTACCATTATTTATTATCATATTACTACACATAATATGACATTTAAAATGCAATAGCATTATTATTAAATACGTTATGATATTCATTATAACAGGGTTTCTGCAGGTTTTATAAAGTTAGATTTAAGACTTTTTAAAAACCAAGTAAAGAAAATGTAAGGAATGAAGTGAAGGGAACACAACATGTCAAAATGTCTAGATATGAATTGTACTAGTAACACTACAAAGTTTCAAAATACAACTTCCCACTGATCTCCATTACTAATTCATTTAAAAAAAAATTATAAAACATCATATATTCTTGATGTTCTCAGTATTCTCAGTCTTGTTTTCAAGTGCAAATGTCAAAAGAGTCTTAAATCAAGATACATTTACTTCACAATCTGCCAATGGGCTCAGAAAAATTAGAAAAGTTAATTCAAAGAGAAAACAAGTTTTCATACTCCATTGACATTTGTTTTTGTTTTAAGTGTAAACTTAATTTTGCTTAGACTTTATTTCTTCATTTTACATCTCAAGCAAATGTATCTTGATTTAAGGATGTTTAAATATTTGTATTGGAAAACGACAAAAATACTGAGATACTGGGAACTAAAAAACACTAACATTTATTTTTCGCTCTGCATGCAACATTTAATGCAGGAACTTGATGAATGTAGTCTAAGTTTTTCTGTTCTGATATAAAACCTGCAAGAACCCTGATAAAAAAAAGATACCCTACTCAAAGTAGTGAGTACTTTAGATAGCATGGCACACAGCAACAACCAATTCAATCCTTACAAAAACTTTTGAGTGTTTTTATTCATATAAGAGTATTTGCTAAGGTTATGCCTTTATCATAACATCACTTTCTCTGTTAATTAAGCATTTTATGTTGAGTGGATTAAACTATAGTAATGCATTAGATGTGTGTACTCACTGGCACAGCATTTCATTGCATTTTGCTTCCACAGCGGCAATTCAAATACTTGCCCTGGCTGTACAGTTACTTTGCTCCCACATACAAAGAGTCTCAAATTACTGTAAACAAGCCAGTACATATGTAGATACATGTCTGGGTAATAACAGCAAAACTAGAGAGAGACATTTACTCTCTCCCTCACACACATTTTATCCACTTTTTCAGGAACTATGTGCCATGCTACATTTATATATAATATTTATATTATAAATATTATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATTTATATATATGCGTTTTTGAGCCATATAAAAAGTCAAATATACAGTACTGTGCAAAATCTTGTTAGATTTAAAAAATAAATAAATAAATAATAATGTAATTATCCAGTGAGTTTTTTGTATGCACAAGGTATGGTCAAAACAGAGATTTGGTATCACCGTCATTGAGCCAGTCTGGGACTACATGAAGAGACAGTCAAAAACTATGACAGATTAAATCCATAAGAACATCTTAAACGCCTGGAGATATCTACCTGCAAACTACTGTGAAACATTTTAGGCACTTGTGAAAAAATGCTGCACCATAATGATGTTTTCAAAAATAATGCCATAAATAGATTTTATTTATCATATATCATATATTAATCAAATCAATATTTGTTATGACCTCCTTTTGCTTTTAAAACAGCTTTTGTATACTTGCACGCTGTTTTTAAGGTAGCTTTGCAGGTAGAGATAAATAACCGTCTTTTGCACAGTACTGTACACACTAAACATACATATTCTCCTTGGTGTCCATAGAATGAGATCTTGATAAGTAGAAATTAAAAAATATTTTCCCCTTAATTTGCATACTAATTATGTCATGCTACATAGTAACTCAGTGATCTCTATGGAATTTAGCATCATCACCATAGTGAGTCAGAATGGGAAATTAATTTACCTATACTTTCTTTTTCAAGAAAACCTGTGCTCATTTGGGGGAGGGGTACATGTAGTTAGTATATTTATGTTTTATATATAATAGAGTTATATTAAAGCTTCATTATCATTCTTTCAATAATTGATAATGTAACGTCATTTTTGTGTCAGTGCCCTCTTTACAGTATTTCTGCCTTTGGTGTAGCACAAGACAGAGTCACAATTTCTTTTGTATGTAAAAAAGACAAAAACACAAAGCACTAAAATCTATAAAGCTGTGAGAGGCTAAATGCTGCTAAAACAGTAAAAACTCTGACAACAGATTACTCTAAATTGTAATGCTGACATGCACTCCCTGTAAAGCTGCTTTGAAACGATATGTATTGTGAAAAGCGCTATACAAATAAATGTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGGTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU108664 False 1533 lncRNA 0.29 2 3669705 3727497
TU108665 False 5659 lncRNA 0.34 2 3669705 3675574
TU108666 True 2479 lncRNA 0.30 2 3669705 3687594

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_03638070_03640560 NA coding upstream 28506 3636790 ~ 3641199 (+)
CI01000016_03628266_03631245 NA coding upstream 37778 3628266 ~ 3631927 (+)
CI01000016_03592692_03617887 ATP8B2 coding upstream 51746 3592620 ~ 3617959 (+)
CI01000016_03572467_03575117 AQP10A coding upstream 94518 3572467 ~ 3575187 (+)
CI01000016_03565923_03571228 NA coding upstream 98068 3565000 ~ 3571637 (+)
CI01000016_03767260_03771612 NA coding downstream 39763 3766998 ~ 3771828 (+)
CI01000016_03780734_03792228 NA coding downstream 52950 3780447 ~ 3792416 (+)
CI01000016_03798165_03803686 NA coding downstream 70540 3798037 ~ 3804627 (+)
CI01000016_03809704_03831736 NA coding downstream 82207 3809704 ~ 3832400 (+)
CI01000016_03845787_03847359 NA coding downstream 118290 3845787 ~ 3848448 (+)
G95494 NA non-coding upstream 35707 3633635 ~ 3633998 (+)
G95524 NA non-coding upstream 138768 3530583 ~ 3530937 (+)
G95522 NA non-coding upstream 141150 3528024 ~ 3528555 (+)
G95521 NA non-coding upstream 145617 3523721 ~ 3524088 (+)
G95520 NA non-coding upstream 146345 3523150 ~ 3523360 (+)
CI01000016_03965750_03967383 NA non-coding downstream 206740 3965498 ~ 3967397 (+)
G95500 NA non-coding downstream 259275 3986772 ~ 3989111 (+)
G95621 NA non-coding downstream 265540 3993037 ~ 3993261 (+)
G93406 NA other upstream 2742173 905400 ~ 927532 (+)
G95439 NA other downstream 134678 3862175 ~ 3862305 (+)
G95648 NA other downstream 545139 4272636 ~ 4273905 (+)
CI01000016_04829592_04837305 NA other downstream 1107061 4829592 ~ 4837457 (+)
G95792 NA other downstream 1492383 5219880 ~ 5225941 (+)
CI01000016_05405791_05407797 AICDA other downstream 1678372 5405791 ~ 5407963 (+)

Expression


Co-expression Network