XLOC_008267 (CABZ01061591.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_008267
gene name CABZ01061591.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 3825117 ~ 3925989 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00016644
acattactgtaagggtTGGGTATATAgttggggttggggtagacgttaataaaatacaattaatagctaatttaataaacaaattggCGTTAATTtcggccgcagctgtatcccgTCTTCCGTCCAAAACTCCTCAAGGTTGATTCAGATAAAAAGCCTTCATGTAGTTCACCATTATCACCACCAGAGCCTGCAAAATGACAGCTCTCCAATCGCAGGGTTTCTGTCGAAAACATGAGGAAAAGCTCATACAATGAGGGTCTGTATCAGCCTGCGGTAAACCAGCCTCTCCGGACCAACTCCGTACGCGCTCGGACTGCTGACAATCCACTGCGCGAAAAACCCTCCGCAAATCCACTTTTATCCAGCTTGTTTTGGGAATCACCACAAGGAGCCTATTTAAAATGCCAACAATGGGAAGTGCGTCCACAAAGCTTGAACTCTCTGGAACTTTACGGATTTCTATCCCCCAAGTGAATGGATTATAATTGCGTGCATTATTCGTCAGCCGACAGGAGCGCTTGGTTTTTAGCCATAAGTGCGTTTTTGGATATGATCGACTGATAGCCGCGTGCATTAACGTGATTGCGTTGATTCCTCGCTGCAGGACTGTGTTAAGCCGTCATTCGCACTCTGTGGGATTTGTTACACCTTGCATGGAGTTGAATGAGCGCACGCTGCGATTTTGGCGATCTGGCAAGCTGGTTAACGAAGTGGGTAACTGAAGGTCATGGGAGAAGCAGCTCCGACCCAGGCCACCCCTAGTGGTTTTGCACCCATGTTGGGCGTCGGGATGGGAGGATCAATCACACCGATGGCCACTTCAAGAGGATCAGCCGTTCCTCAGCTCCACAGCGCCATCGTGGAGCGCCTGCGTGCCCGGATAGAGCTGTGCCGGCGCCACCACTCCACCTGCGAAAACCGCTACGAGCGCGGCCTGGCTGAAAACTCAGACCGGGAACACGAGAGCACACTCCAGCTCCTAAACATCGTCCATCAGGGACCGGGAACCAGGAAGACCAAGGGCAGCAGATCGGCCTCTCAGCATCCTTCTGAATTCATCAGAGGGAACGGAGAACATAAAGGCCACGGAGCGTCAGACGCAGAATCCAAAATCTCCTCGCAGATAGCAcaGGGACTGAGGAGAAAGATTGAAGCGCAGTCTCCTGGATATACGCCCAAGCAGAATGGCCTCTCCTGTGGTGCATCAGGATCCAACTTCAAGCGTCTCCGTATGGAATCAAGCTCCTTTCGTCCTGGAACTTGTGCTTTAGCTGCAGGTCAGACACAACGATTGGTTGGAGATTCCACCCATGGTAACATCCTTCAAAGAAAGGACACTTTCATGACGTCTCATGGAATTGACGTATTTAACATAACTCTAAAGGACATAAAGAAGGAACCAATTGAAGTTCAGACTTGTGGCCAGGCAACCACAGATCCTTCGATGTTGGTatttgattttaaagatgaagtaATCGGACAGATTGACCCAGATCTCCAGGACTTGTTTGATGAGCTCACCAAGAGCGTGCCATCGTTCAACGAGCTAGAGTTTGAGAAGATGCTAAAGCAAGATGATGACTTTGGGCTCGATCTAGGTCGACCAAGTTCTGCAGGAGCAGCCCCTCCTTGTGTTCATCTGGATAAGCCAATCAAGACTGAGTACTCATCAGATTTAAGCCACACAACCGGAGGCTCTCAGCAACTTAGACCAGCCTCTGCTGGACCTTCCTTCTCCATGGCCAACACTACTTTATCCACCTCGCCCATTACATCAGGTCTCCATGGACAAGTACCTTCTGGCGGTGCTTCTCGAGGTCATCCAGCATGGCCTGAGATCTCACACGCAGAGCAACTCAAACAAATGGCTGCTAACCAACTGCAGCCCAACTCCATTCTTCACAACCACCAGCAGAGTCAAGTTAGAAACTGGTCTTCTACCTTAGGTGTGCACCAGACACTTGGCTCCTTCCCTCAGGAGACTCTTCCCGGCAATGCTTCCCTTTCTCAGCAGAGGCTCAATCCTCAGAATACTGGTCAGCCCAAAGGCTTAACAAATTGCTTTCTGAAGCCCAACGGGTTCAACCAGTCTCATAACGTTGACGCAAAGATTCTCAGCAATAAGCCTCTACTGCATTTCAGCCCTAAAGCACCACCTTCCACCACAGGCCAACAGATGCCCGTAATGACTGTCCCACCAAATAAAACAACCATGCAACAACAGCAGGCACCTTCAGCAGGTCAGGGTAGGCACTTTCAGAACTGCCAGCTGCCCATGCAACCATCTTCATGTCTGCAAACTAAGCCTCCAAGTCAAAGGCCGCTGCTCAATCAACATGGAGCTGGAATCAGTTTTAAATTGACACAGCAGAGACAGGGGATTTCTTCAGCACCGCGTTTACCGGTGAACGGCCGTCCTGTGGATTTACCAAGTCAGGTTCAACAGCAGAGGCCTCCGCAGAAGAACCCGAACCAGGAGCAGAACCTGCAGAGACAACTGGGCCAGCCACAGCCTAACATTGCTGATATGGAGAAACTGAACACGCAGGATCAGTTCAGTCGTCATCTAACACGACCTCCACCAGACTACAAACACCCTCGCAATGGAGTTGGAGCTCCACAGACAAGCTTATACTCAGGCAATGTGTCAGACCAAAGTGACATCCAATCCTTGTCCTGCCAGCTGGCCAATGCACCAGGTGCCAAGATGGCTGCCTCAGGAGAGAGGAGGTTTCCTCTTGGACAAGATCCTAATTCAGGGCCCACGGGAGCTCAAGCTTGTGCGAACCAGCAGCCCGGTGGCCTGAGCCGAATGGGTCTCCAGCCAAACAAGACTCAGTTTCATGGGACAAACAGTCAGGGTGGCGCTTTTCAACTGGTGAGGACCAGCGTCAGTCAAGATTCCCTGCTGGGGCAAAGACTGAGTGACAGCAGGATGGACGCTGCTTTAAACTGGGCGACAAGTGCCAAACAGAGTGGATTAGATGTCAAACGTCTCCCCAATGCAGTGGCACCCCAAAGTGACGTTCATTTCGCTCCTAGGTCTATTTGCCCTCCCAACCAGGTGGCACCTCATTCAAGCCTTCTACCGCTAAACCCTGCTAACAGAAGCTCTGCTCCCAGATCCAGCCAGCCTAGGATACCCCCGTTACCCGGGGTGAACCAGTCGTCTGTCGAACAGCAGGGTTGTCCATCCACATTTGGAGGGATGAACCAAAGCCCGGTGACGTACCAGAACAACCGGGCAGGACGTCTGACCTTTGACTTCCTACCAGAGGACGATAACACGGTACCAGGGATCAATGCGGACTCTGATTTCATCGACTCTCTGCTTAAATCAGGCTCAGGCAACGATGACTGGATGAAAGACATCAACCTGGAGGAAATTCTAGGAGGACAttcataaaaaactaaacaagggACCGTTGTTGGAACTTTGTTCTCTACTTGAAGCCGTgcattaaaggaacactccacttttttggctcattttacaagtcacctagagttaaacagttgagttttagaatttttaaaactATTCAGACGATtttgggtctggtgggagcacttttagcttagtttagcataaatcattaaaccggatcagaccattagcatctaacccaaaaaaattttttttaaagagtttggatagcttagcataaattatttaaTCACATTGCACTGTTAGCAACTTAGCATTCTTTTCctaaattaaaaacaagtttcaatagcttagcataagtcattgaatcggattaggccattagcatctcactcaaaataaattcaaaaatgagttttgatagcttagcataaatcattgaattagattagactgTTAGCATCTCAGTCaacaaaaattcaataaaaagttttgatagcttagcataaatcattgaatcggattagaccattagcatcttactcaacaaaatataaaaaagagtttggatagcttagcataaattattgaatcacATTAGACTGTAAGCAACTTAGCATCCGtttccaaaattaaaaaaaaagtttcaatagcttagcataaatcattgaatcgtataagactattagcatctcactcaacaaaataaaaaaaaaagagtttggaTAGCACATAattataatacactgaaaaaagtgttgcatgcaaaactgttgcaaacaatttatttgtgttgaatttaaacaaacaaattaagtttaataatgttcaacctaatttgtttgtttaaattcagcgcaaataaattgtttacaacaacttaacgtaaaaaaatttagtaaatccaaggaatcatctttgaatgatttttttcagtgtacctttAAATAGTCCCAGCTAGCAATCTAGGTTGACTTTAgcttagggatggctgacgtgaattGATGTTTCAACACAGTTTTAAGGTCCTGAAGtctttcgaaacactgcaccgaagcatgatctgaaacagccaggtcatgtgactaaggtgattcgaaacaccaggTCACATGATTGAAGCGATTGAAAGCATCGGCCATTTCAGAAGCGTTTGAAGACCTGCCAAATCTGCCTTTGACtgacaggggaaaaaaaaactgtttcatgTAGTCTAGTGGACCGCATGGAtgttgctaggcctattttagggggCCTGTAGCCCcctatatttctactcagcccccctATAACTTTTGCaattagctcataaactgtacactaaattatctCCTCAGTCCtctttaaatttgataagaaAACGGCGGCAGAATTCGGCTCTTTTCcgtctttttatttttcatttgatcagcaaaccaaggccgTGGACAGCAAGAGAACGAGGTGTGTGTTTATCGATAATTTGTTATAATATCTGACATTTTGCAGTTCTTTGATAAAGATAACCTTATATCCTCTGTATTCCAATGTCACGGAGGAGCAGTCGGGTTTTCTCTGCATTCACCTTATCAGTTGGAGTAACTCTTAACGaacatttttctatttttgt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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112977

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00016644 True 7893 mRNA 0.41 6 3825117 3925989

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_008266 CABZ01061592.1 coding upstream 8360 3808996 ~ 3816757 (+)
XLOC_008265 RNF14 coding upstream 20697 3766101 ~ 3804420 (+)
XLOC_008264 NA coding upstream 106734 3682312 ~ 3718383 (+)
XLOC_008263 CABZ01040556.1 coding upstream 135998 3674765 ~ 3689119 (+)
XLOC_008261 LHFPL6 coding upstream 172966 3539044 ~ 3652151 (+)
XLOC_008268 NA coding downstream 23891 3949880 ~ 3954691 (+)
XLOC_008269 NA coding downstream 387102 4313091 ~ 4321015 (+)
XLOC_008270 NA coding downstream 602560 4528549 ~ 4531965 (+)
XLOC_008271 NA coding downstream 627907 4553896 ~ 4554428 (+)
XLOC_008272 si:dkey-35i13.1 coding downstream 706793 4632782 ~ 4635819 (+)
XLOC_008463 BX663520.1 misc downstream 17326202 21252191 ~ 21252282 (+)
XLOC_008262 NA non-coding upstream 229858 3593339 ~ 3595259 (+)
XLOC_008260 NA non-coding upstream 295336 3527405 ~ 3529781 (+)
XLOC_008259 FO704837.1 non-coding upstream 318694 3506309 ~ 3506423 (+)
XLOC_008258 NA non-coding upstream 442003 3382814 ~ 3383114 (+)
XLOC_008278 NA non-coding downstream 1330512 5256501 ~ 5256782 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000092_01034513_01049419 MAML2 coding CI01000092 null 1034513 ~ 1049419 (+)