G146386


Basic Information

Item Value
gene id G146386
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000028
NCBI id null
chromosome length 9874160
location 2893370 ~ 2900789 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU166342
ATATATATATATATATATTTTTTATTTTTATTTATTTATTTTTTTTAAATAGTAAATAGGATAAATAGGATTCCAAAAAAAAATAAAAAATTTGTTATGAAGAGTTGACTTGGTCATAGTCACAACTACAATGTGTTCTGAGTCCACTTTTAAGTTCAAAGTCCCTAAAATTGCAAAGAGATATTGGTTCTTTTCCACTTGGTTCATGTTTTGGTCCACTGAATTTGATTTTGTTTTAAAGAGGGCTGTTGTGTCTATTTTAGTACTGCCCTGATATTTTTTTTTTTTTTTCATTAGAAAACATATCACACCCAAAGTGCTCAGTAATGTATCCTCAAACACAAGATGGCATCCAAAAAAGCTTTCATATCTGGAGTTCCTGCTAGTGCTAACTGGCTCCTCTGAGATCCAGCAAAATCCTTCAATGTCTAAGCTGAAGTGTGTGTGTGTGTTATTGATGTGTAGTGGTGAAAGAGAGTCAGAGATGCTGTTTGTAAATGAGAGATGACAGTGTGAGACATGACAGCTCCCTCTCGGTTTTTATCCTGTTCGTATTTTTATGTGCAAACAGGTTCATGAATAATGCAAAGGAAGGTTAAATGATGTCACAGATGCAGAATAAGCTCAGTGTTTGTTATTGAAATGCATGTGCTGTTTCCGTGAATGTGGGTGTGTTTACTGTGAGGGGAAGTGAGTGCATGAAGCCTCCTGCTATTTTGTGGGCTATGAAACTGGGAGACATATATGCCTCGCTTGGCTAGAGAGATCGAGAAGATTTATAGAGGCAAGTTAGTCTCAGCAGCCAGAGATGTAGCGTCTGAGTAGATGGTGAACCCAAGGTCTGGGTGAAAACAATATTGGCAGCTTCCCGTTCCCCCGCTCACAATCTGCTGTCTATTTACCAAGTCGAACTCCCAGGTTCAAAACACTGTTGTTATGTCGGAGCGGTTTCAGCTTTTCTTTGTGGAAAATGAATACATAAGAATATAGATTAAGATCTACTCAGGGTGAGATGGAAAGTCCAATGACCTTCAAGACTGCCGACTCATTCTTATACAATAGACTTTTTAAACAGCTTGTGAATGTATGTATCGACTTCTGCTGTGAAGCCCGTGTAGTCTGATTGGATCTTGCACCACACCATCTGGGACCAGAACAAAAGAAATTCCTCGTAAGTGGTCATGATTAATTCTCAGAAGGTCACAGCAGACGCCCAGCAGTGCTACAGCCCTGGACGTGATGTGTGAGCACCTTTCCAAAGCCTCCACAGCCATAATATGTGTTTGGTGCTGGTGCCTCAGACATCCTCAGGTTTCATTTTTCATTTGGGAAATTGCAATTCCCTGATGTCTCCTGGTATTCCATAACCGTAGGAGCCCTGTCAGGGAATAGTGAACATGAAGTCAGAAGAAGAACCTTTTGTGTATGAGCTCAATGTGACAGATGGAGATGGTGAGTTTGCATTTGTCAATAATTATTCAACCCAGTCTCATTAGAAAAAACATGTGAAAACTCCAAAAATGTACCTGTACATACAATTCACTGCAGCTTCCAGCTGAAATGAACACAAGTGGCAGCGAAACACCAACTAAGGGGCCGCTTACGTGACACCGTTTTCAACTAAAAATGGAAAATGTTTTATGTGTTTTGGCCGTTCATTTACACGACAACAGTGTTTTGGGGGCATGAACATGCAAACTTTTGAAAACATGTTTCAAAGTGCAAGTTTTTGAAAACAATACCATTATCATCTCTGTGTAAACTACAAAAACACAAATCTGTGAAAACGGTGATGGCATGCACATGCGTATTAAGTGTTTAGTCTATAGGTATGCGCATTTGGCGCGAGTGCTCTGTAAAAAAAATGCATATATAAAGTGAAATCGCAACCTAATGGCCGGGCAGCATAATACAATGTTTTTAGTCCTTTTTGCGGATTCTTGTGAATGGCAATTGTTTTGATAATGTTGTCATCTGTACAAAGAAAAAAACCTTTCCATTTTTAGTTAGGGGTGGGAAACGCAGGGTACGTCACAATATAACACGATCACGATACATGGCATACTATAACGATAATATCACGATACGGCGATTCTGTGATAATCGATATATTGCTAGACAAACCTAAAATGATATATCACGATATCTGTCTAACTATGAAAACAAAATGCCAGTGAAAAGGTTAAGTGCAGGTTCTCTCACTTTATTAAAGTCCAAACTGTTAGAAACAGCGCAAAAATTTTTCAGTCTGTAAATTACATTTAACATTTTAAGTGAATTAAACATTTTATGCTTATACTTTTTAAAAGCTTAAACTTTTCTTTGCATGTAAACTGACACATTTAGCTTAAGTTAACTGCTTATCAAATTGTTTTATATAAACCTGGTACGTTTAATAAATTACCAAACTCTTTTATTTAAACCTGGGAACATCTCAGTGTTTACCAGCTTCCTTAAATAATCCTGGGAATAGTGTTGTAAAAGGTACCGGCCTGGGTAACATTATTTGAAAATGTTAAAAATGTGATGATAGCAGCATAGCCAAGCATGTTGAGCACTGTTGAGCGGATTCTTAGTAAGGCTGGGTAAAAAATTTCGATTTCACGATTTTAATTAATTCTCATTTTTACGAACCGATATCGATTCTTAAATCCCAAGAATCGATTAGTCTAGTCTGTTTTCAGTTGATGAATGAACAGAACATGTAGCGCGCCTCCCATCCAATAAATCGCAATAATCTTTGTGCTTTGTAACTTTTGATATGAAGTGAAGTCTCAGATTTCAAATGACGTCCATCTTATTATAAGATTCAAAAAATAAATACCGTTTTGGCGCTGTTTAATGTGGCGTGACAGATCGCTTTAGCGCCTCAGTTAAAGAGAAGCGGCAGCACGGCGCGCATGTGAACATCTTCTTCTCCGCTTTAATACCAGTTACAGCGTAAACATGAATAAACATCTGAAGGTATGTTGAAAGATACAGTACAACTTACTGAAATCCGTATCATGTCTCGTGTAATAGCTCAATCAGTGTTTCAACCTCGGAAAGACGTCAATAAAACAGCTTGTAAACAATGTCACGTAACGTCACATTTACCTCAGAAAAACATATTCAGTGACCATAAACTCATTAGTCAGCTAGAAAAATGAACTCTAGAAAGTCAGCTATCTGAAAAATATAGCTATGCACCGTTACATATTCATTGTAATTTTTAATGTTCTTCAATATTTAATGCATGTTTGAATAAATCAGTTATGACAGCCACAATTTAAATGTTTATATTTCAAAAAATTGAATTGGAGTAGAAATATGACTATGTAATTCTAAATTTTAGTTATTATAAAAAACATCATTGAGTGTAATTTAAGTGTTTAAATATAAATAAGTTAATTATAAATAAGTTAATTTTAACAATATTATAGTAATGGTACCAACTGACTCCCATGTGTAGTTTACAGCATTAGTTGAGATTTTTTTCCTCTAGAAAATTTGCCATGTATTGTATCAGATATACTTCATCCAAAATAATTTATATCGAATCAAATCGAAATCGTAATTGAATCGAATCACAAGCATGTGAATAGAAATCGAATCGAATCGTGAAAATTGTGTCAATACCCAGCCCTAATTCTTAGACACCTATTGTGTGTTCACGCAATCAACATATATGTCTGTGATTGGCTACAATGATCAACGCTTCAAAAACATATTGTAAATAGACATCTTTGACGCTCGGTGAAGAACATCAAAGATATCTACGTTTGTCACATCAGTGGTATAAAAGTGCGTCCAGACTGAACTTAAACATGGCTGAGGCATCTATTATTTTACTCACACTGCTGTCCGCCAGCCTGGTAAAAACCTTTTTTTTTTTTTAAGAGGCTAGTTAACTTATGTTCGCATTTCCCTCATTCATGTGTTGAGCGCCGCCTTGAAGTAGCGACGCTGGGAGCAGGGAAATCTATTCATAGCGCCTTATTTTATTAATTAAAATATCGATATTTGATGCCAGCGTATTGATTCTCGTATCACACAGAGAAGGACGCCGATTTATCGCCATAACAAGATTTTGTCCCAACCCTATTTTTAGTACATCGTTGTCGTGTAAACGTACATTTAGATTATGATTACAGCGGCAGAATATGGAGTTTCTTTTACAATATTATATTATGACCTCAAAACACTTTTTAATTTGTAAACTAATACATTTTACATTTGCATCACACATTTATGTCTTTTCCATATGTATAGTAAACTTGCTTGGTGACTTGTAGAAGCAATCTAAAATGGCATGGTTGCTTCATGTTTGCTTCTGTTAAAGTCAGAATGAAACGTAAGTTGCAATCGTCTTTTCTTTCCTATTTTGATGTATATATGAGTGAAGTGGCTTCTCAAATGAGAAGAATTTAGGGCAGAACTTGATTTTGTCTATGAGAAATTGATTAAATGGTTAGATGGTTGTGGTTTGCTGTTGGTGGATCTCATATGAGTGACAGGTTGTCCTGCTTTCGCACCAATAAACACGTCAGAGAAGAGAAGAGATGTCGCTGCAAGATGGAGGGGAAGTTATTTACATTAAAAATTACAAGGGCACATGAAATATTTAAAAAAAGTAAAGATGTGCTCGGATAAATCATTTAAAACAAACACTGCAATATCCTATTAATAAATAAGATTTGTCTGTTTTGATTTCATGGTGACTTTAACTCTATCAGTTTAGATAGAGTTAAAGTTTAACTTTATCAGTTTAGGTTTAGAGTAGGGTTTATTGTAGGTGGTATGTTATTTTTAAGTGGTACTCACCGGACATTTCATTGCCGAACTTCCATGATATGTACAACAATAAACATCATAAAACGTTACAGATTTATGTAATCTTTTATGGATAAAACTGAACGTGCTTTTAGTGCCACTCACTGGACTTTAAAAGAGTTGCGAAACATGCAAGAAGCAATGTAATATCATTTTCCATAAATGTCGCCCTTAGCATGGTTTTCCAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU166342 True 7293 lncRNA 0.37 2 2893370 2900789

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000028_02869789_02878890 NA coding downstream 13857 2869236 ~ 2879513 (-)
CI01000028_02851718_02864581 LARGE1, LARGE2, GYLTL1B coding downstream 28789 2851718 ~ 2864581 (-)
CI01000028_02669701_02678061 NA coding downstream 215309 2669256 ~ 2678061 (-)
CI01000028_02640566_02655871 NA coding downstream 237499 2640497 ~ 2655871 (-)
CI01000028_02622413_02622621 NA coding downstream 270749 2622320 ~ 2622621 (-)
CI01000028_03083682_03096529 ARFGAP2 coding upstream 182811 3083600 ~ 3096529 (-)
CI01000028_03120344_03126349 FAM118B coding upstream 219485 3120274 ~ 3127279 (-)
CI01000028_03128741_03141144 ILVBL coding upstream 227105 3127794 ~ 3142533 (-)
CI01000028_03144425_03151778 GLB1L2 coding upstream 242794 3143583 ~ 3151778 (-)
CI01000028_03182285_03183550 NA coding upstream 281396 3182185 ~ 3183749 (-)
G146380 NA non-coding downstream 26076 2866263 ~ 2867294 (-)
G146473 NA non-coding downstream 69961 2823128 ~ 2823409 (-)
G146469 NA non-coding downstream 86325 2806734 ~ 2807045 (-)
G146466 NA non-coding downstream 98264 2794892 ~ 2795106 (-)
G146461 NA non-coding downstream 117534 2775602 ~ 2775836 (-)
G146483 NA non-coding upstream 71527 2972316 ~ 2974185 (-)
G146486 NA non-coding upstream 86920 2987709 ~ 2987994 (-)
G146487 NA non-coding upstream 87323 2988112 ~ 2988460 (-)
G146491 NA non-coding upstream 99464 3000253 ~ 3000472 (-)
G146497 NA non-coding upstream 112503 3013292 ~ 3013678 (-)
CI01000028_02441408_02445596 RPL35A, GM10247 other downstream 447057 2441332 ~ 2445596 (-)
G146238 NA other downstream 733332 2147378 ~ 2160038 (-)
G146190 NA other downstream 782105 2097570 ~ 2111265 (-)
CI01000028_00474810_00475211 NA other downstream 2418024 473609 ~ 475211 (-)
G144855 NA other downstream 2757494 135392 ~ 137202 (-)
G149329 NA other upstream 3798724 6699513 ~ 6701240 (-)
CI01000028_06969947_06983352 NA other upstream 4069968 6965064 ~ 6984084 (-)
G149474 NA other upstream 4329002 7229791 ~ 7232783 (-)
CI01000028_07527725_07535631 ARPP19 other upstream 4625173 7525962 ~ 7535743 (-)
G149923 NA other upstream 5073779 7974568 ~ 8024244 (-)

Expression


Co-expression Network