G151070



Basic Information


Item Value
gene id G151070
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000028
NCBI id null
chromosome length 9874160
location 9412238 ~ 9419582 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU171559
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>TU171558
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>TU171562
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>TU171567
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>TU171569
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>TU171570
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Function


GO:

id name namespace
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GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
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GO:0005681 spliceosomal complex cellular_component
GO:0005685 U1 snRNP cellular_component

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU171570 True 1606 lncRNA 0.37 2 9416354 9419523

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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G151292 NA non-coding upstream 387568 9807150 ~ 9807460 (-)
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G149923 NA other downstream 1387994 7974568 ~ 8024244 (-)
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CI01000028_06969947_06983352 NA other downstream 2440341 6965064 ~ 6984084 (-)

Expression



Co-expression Network