G151409


Basic Information

Item Value
gene id G151409
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000029
NCBI id null
chromosome length 9486966
location 183240 ~ 187932 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU171966
GGACACTCTGAAGACACAAAAAAAAAAAAAAGTGGTGGAGATCGGACCATAGGTGGCGCTATAACTGTTGCAAAGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCATACATTTCATATGGTATATTGCCTGTAAATGGTCTTTTCCATCTACATAATCATATTTATATCATTTGTTAGATCTCATTTTGAACAACTTTGCCTCAAGAACCATTGCTGTCGATCAAATTGTTTATTAAATAATCAAGATTATTACCAAAAAAAAAAAAACTTTTGCAAACTAGTCCTAGGTTTTTTGCTCAATCTGAATAAAACCAATGCAGTGGAATTCTCTGGACTCTCTAGATTAATAATTATCAAAAAAGTTGAACTTTTGCATTTATATGGCTATAATAGGGTCATTTCAATATGTAACCTTGATCAAGTGTCACCGAAACTCCTCAAGGAATGCTCAGATCTTCTTGAAAATTAGTAAGGACATGTGACATATGACTCTAAACAAGCATGCCAAATTTCAGGCAGATCGGGCCAAATGTGCCTCTATAACAGTTACAAAGGTGAAAAATGACAATGTTCCTATGATTATAATGGCATATTCACTGAAATTGCCATTAAACCACCAGGTGGCAGCAGAAGACCACTCATTGGCTCATTCTGCTCAATAAATAGTTCTGTTCAAGGTTTTTTCATTTGAAATCACATTTAAACTTTATAAAATTATTATAATAACATTAAAAATCACATTTTGTCAAAGTTTATCACTTCAGTTGTTCATTTTAGGTATCAGTTTCTCCAATAATATCACATTTCGATTGCAATTAGACCTGAAAATGATGTTTTAAATGTGAAACCTGAAATAAGCACATTCTTACCTATCATTTATTTCGAATATCTATATCTACAACAAAAAGTGTGTGTGTAAGCACATTTAATGGAGTTAACAGAGAAAATGTACTTGAGACTGTAGTGAGCCAATGACTGGTCCTCTGCTGCCCTCTGCTGGTCAAAATAGTCATTTTGTCATACTACTCACTAATTTTGTTCTATAATTCATATTTAGACATTATAAAATCACTATTATAACATTTACAATCACATTTTGTCAAAATTCATCACTTAATATCTATTGAAGAATTCGTACTGACAATTGTGCCACATTACGAGTAATGTGAAACCTGAAGGATACTTGCAGTAAACATTTTGTTACCCATGATATATTTGAAAAATATCTGTATTTACAACAAAATGTGTGTGCATGTGTGTTCAAGGATATTGTGTGTGTGGAGGGCCACTGTCCTGCAGAGTTTAGCTCCAACCCCAATTAAACACACCTGAACCAGCTAATCAAGGTCTAGGCATACTAGAAACTTTCCAGGCAGGTGTGTTGAGGCGAGTTGGAGCTAAACTCTGCAGGACAGTGGCCCTCCAGGACTGAGTTTAGACACCCAGATCTTGCATTTGCAACAAAGATAGCTGTAGTGAAACAAAAACAATGTAGTTCACTGTACCTTTACTCACCATATTTTGCATTCAAGTACGACGCTGTCATGACAAAATACTGACAAAATACAAGAGTAAGACGAGCACTATATTTACATAGAGGACTAGCTAAACAAGATGATGAGATAATTAGAGGGTGTGGGAAACACCTGGTGAGAACTAATCAACAGGGAAAGAACTACAAACCATGATGATAGACAGGAAACAGTACAAAAGTCCACAAAACACACAGGGAGTATAAGACAGATCTCTTTAATCTAGCTTCAGAAAAAGAGACAAATATGTGGCTTATCTAGGCACCTATTTTATTCAGCAGAAAATTCTATTATAAATGATAGAATACAATTGCTTTTTTTTAATATTCATGTGATACAGCCAAACAGCATGTGTATGAAATACAGAATCATTTAGAATTACTAAAGTTAAACTATTATCAAGGGCAAGTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTACAACTGTGGTCATTTAACGTAACAATCCTTTATTTCATAAATCATCTGAAGCATTTGGTCCATTGTAATGTATACAGTAAATAATTCACACCACTGTAAAAACATTTCCACTAATATCATCTTAAAAACTTAAGTTCAGTTGCTGCCTTAAAATTTTAAGTATAATCAACATGGTTTTACAAGTCATTTCAACTTAAATTACATTAACTTAGATAAAATAGAGCTGAATCGTGTAAAACTTGCTTAAATTATTTTGATGAGTTAAAGTAATGTAAAAACATAAGTAGCTATGAGTAGACTTACTGATCATATTCTTTACAGTAAACTACTATGGACAAAGCAACAGATGGGATTTCCAGCTTTCTAAACTGCATGTTCATTGCAGCACACTTTTGATGTCGCTCCAAAAGATTCCTTGCAGAAGACAGATACAAAAGACTTTTCTTTTGTTTGAATGAGAAACAAGAGTAGCACATCCACACATTTTTTGACCTACAGTAAGGAAATTAAGCACTCATCAAATGTGCCAAATATTGTGCAGAAAAATGCAGTGTGAAAAGAACCATTACGGTACATTTCAGCCAAACCTTACAAAAAGCACACCTCAACTTATGTCAAGAAAGTTCGGGTTTTGTAATGTTGCCTTAAACGATCTTTCTATAAAAGGGTTTAAAAGAGCAGTTTAAAAAAAAAAGAGACACTAATTTCTCATTTTTACCTTACCTGATAATCTGCAGAGTAAACTAGTAATAATTCTTCTGGGCAAAATGTCAAATGATCAACCCAGAATACTTATGGAAACCACAACAACATATGTAGGTTACCTGTTTAACTTATTTGACTTTATTATTTCCTTGTTCTAGTTTTTTTTTTAAACGACTTTTTGTTTTTAACATTTCTCAGGCACCTCCATCACATTCTCTCCTAAAAACTTAAAATGTCATAAAACAGGGTTCTTTAAAACCAGTTTAAGCTAAACTCTGCAGGACAGTTGTCAGGAAACACGAACCAGAGAGATGGTAAGTAAAGTTCAAGCAAGCTTTATTGAACACAGTAGTATGCACAAGACGATGGATGAACTGGTATGTATAGAAGATGCAGCAGGAGGATAACAGACGGGTACGTTGCCACAGTTTCTCAGTCACTGATGAATAGATAATGTGGAGACATGGGTGAGGAGAGGAAGAGCAGGTAAGGAGGTGTCATGTCAGGTAAGTAACAATCTGGGAGACGCATGAGGGAAGTCTGACGGAACTAGACAATGGCTGCGTCCGAAACCGCCTACTTCTCTACTATTTAGTAGGGGAAAAGCAGTAGGCGAGCGAATAAGTATGTCCGAAGCAAAAAGAGTGAATTTTACCTGGGTGACGTACTAATTCTCGCGAGATTCGGACGTGCGTCTACTTAAAGTGCGTCCGAAACCGCCTACTTCTCTACTATATAATAGGGAAAAAGCAGTAGGCGAGCAATTAAGTATGTCAGAAACCTCAGTAATCATAAATGTCAAGAAGTTCCCGGATGGCCTACTGCTTCCGCCCAGATTCTGAAGTGTTCCTCGATCGATACTTTTCTATCCCAGGAGGCCACGGGAGAGGGTACGTCATAATCGAACACGGAGGAGAAAAGCGGCGCGGATGCTTTCAAATGTGAGTATTGAAAACTGAAAACACGGTTCCTTGTAATAAAATAGCATTTGTTGAACTACTTTAGAGTAAACCGCTGAATGTGTAAAGATGCTAGGCACTATAGTTGTGATTTTACAGTAAAAACACGATTTATTATGATTACAGGGGAGCTCTAGTAAACACACATAACTTAATTCTCCGAAGTGGATTTACATATTCTAAACCACATCTTAAAGGTGCTTATTAAATGTTTATTTAACATCTGACAGGAACATCTTCTTTAAGTATTATGGCTTATGAGTTATGGATTATGTATGAGTGATGTATGTGTGCTATTATGTAGAATTCACTGTTGTCAACACTGCTTACATTACATGAATGAAAATAATGTAAATAAATTAATCTACATAAAATAAACATAAGTTTAATCTATTTTATTTGACCATTAGTACTGTTGGTAAATTAAGGAACGTTTGTATTGGATAAAAAGAGAGTTAACACATCATTAACATGTAAATGTAGATTTAAGCACATAAATCTCAGAGGAAACTTGAATCTTGTCTGGATGTTACAGGGACAGATGATCACACGTGTGTTTATCCGGTGATGAAGGAATGCTGCCATCAAAGGCTTTGAAGCTTTGTGGTGAAGCAGGACCTACAAGACAAGGATGTGAAATGTCCTTAGACTGGTGTGAGCACTGAGGATGGAGAGCCACAGCAGATCCTGGAAATGGTGTAGAGCCTTGGATGAGACCCTCCATCACTCCTCCTTCCAAGTGACTTGATCAAGGACACACTGGAGGTGATGCTGCAGAGATTGAACCAGCAACCTTCTGCTGA
>TU171967
GGACACTCTGAAGACACAAAAAAAAAAAAAAGTGGTGGAGATCGGACCATAGGTGGCGCTATAACTGTTGCAAAGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCATACATTTCATATGGTATATTGCCTGTAAATGGTCTTTTCCATCTACATAATCATATTTATATCATTTGTTAGATCTCATTTTGAACAACTTTGCCTCAAGAACCATTGCTGTCGATCAAATTGTTTATTAAATAATCAAGATTATTACCAAAAAAAAAAAAACTTTTGCAAACTAGTCCTAGGTTTTTTGCTCAATCTGAATAAAACCAATGCAGTGGAATTCTCTGGACTCTCTAGATTAATAATTATCAAAAAAGTTGAACTTTTGCATTTATATGGCTATAATAGGGTCATTTCAATATGTAACCTTGATCAAGTGTCACCGAAACTCCTCAAGGAATGCTCAGATCTTCTTGAAAATTAGTAAGGACATGTGACATATGACTCTAAACAAGCATGCCAAATTTCAGGCAGATCGGGCCAAATGTGCCTCTATAACAGTTACAAAGGTGAAAAATGACAATGTTCCTATGATTATAATGGCATATTCACTGAAATTGCCATTAAACCACCAGGTGGCAGCAGAAGACCACTCATTGGCTCATTCTGCTCAATAAATAGTTCTGTTCAAGGTTTTTTCATTTGAAATCACATTTAAACTTTATAAAATTATTATAATAACATTAAAAATCACATTTTGTCAAAGTTTATCACTTCAGTTGTTCATTTTAGGTATCAGTTTCTCCAATAATATCACATTTCGATTGCAATTAGACCTGAAAATGATGTTTTAAATGTGAAACCTGAAATAAGCACATTCTTACCTATCATTTATTTCGAATATCTATATCTACAACAAAAAGTGTGTGTGTAAGCACATTTAATGGAGTTAACAGAGAAAATGTACTTGAGACTGTAGTGAGCCAATGACTGGTCCTCTGCTGCCCTCTGCTGGTCAAAATAGTCATTTTGTCATACTACTCACTAATTTTGTTCTATAATTCATATTTAGACATTATAAAATCACTATTATAACATTTACAATCACATTTTGTCAAAATTCATCACTTAATATCTATTGAAGAATTCGTACTGACAATTGTGCCACATTACGAGTAATGTGAAACCTGAAGGATACTTGCAGTAAACATTTTGTTACCCATGATATATTTGAAAAATATCTGTATTTACAACAAAATGTGTGTGCATGTGTGTTCAAGGATATTGTGTGTGTGGAGGGCCACTGTCCTGCAGAGTTTAGCTCCAACCCCAATTAAACACACCTGAACCAGCTAATCAAGGTCTAGGCATACTAGAAACTTTCCAGGCAGGTGTGTTGAGGCGAGTTGGAGCTAAACTCTGCAGGACAGTGGCCCTCCAGGACTGAGTTTAGACACCCAGATCTTGCATTTGCAACAAAGATAGCTGTAGTGAAACAAAAACAATGTAGTTCACTGTACCTTTACTCACCATATTTTGCATTCAAGTACGACGCTGTCATGACAAAATACTGACAAAATACAAGAGTAAGACGAGCACTATATTTACATAGAGGACTAGCTAAACAAGATGATGAGATAATTAGAGGGTGTGGGAAACACCTGGTGAGAACTAATCAACAGGGAAAGAACTACAAACCATGATGATAGACAGGAAACAGTACAAAAGTCCACAAAACACACAGGGAGTATAAGACAGATCTCTTTAATCTAGCTTCAGAAAAAGAGACAAATATGTGGCTTATCTAGGCACCTATTTTATTCAGCAGAAAATTCTATTATAAATGATAGAATACAATTGCTTTTTTTTAATATTCATGTGATACAGCCAAACAGCATGTGTATGAAATACAGAATCATTTAGAATTACTAAAGTTAAACTATTATCAAGGGCAAGTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTACAACTGTGGTCATTTAACGTAACAATCCTTTATTTCATAAATCATCTGAAGCATTTGGTCCATTGTAATGTATACAGTAAATAATTCACACCACTGTAAAAACATTTCCACTAATATCATCTTAAAAACTTAAGTTCAGTTGCTGCCTTAAAATTTTAAGTATAATCAACATGGTTTTACAAGTCATTTCAACTTAAATTACATTAACTTAGATAAAATAGAGCTGAATCGTGTAAAACTTGCTTAAATTATTTTGATGAGTTAAAGTAATGTAAAAACATAAGTAGCTATGAGTAGACTTACTGATCATATTCTTTACAGTAAACTACTATGGACAAAGCAACAGATGGGATTTCCAGCTTTCTAAACTGCATGTTCATTGCAGCACACTTTTGATGTCGCTCCAAAAGATTCCTTGCAGAAGACAGATACAAAAGACTTTTCTTTTGTTTGAATGAGAAACAAGAGTAGCACATCCACACATTTTTTGACCTACAGTAAGGAAATTAAGCACTCATCAAATGTGCCAAATATTGTGCAGAAAAATGCAGTGTGAAAAGAACCATTACGGTACATTTCAGCCAAACCTTACAAAAAGCACACCTCAACTTATGTCAAGAAAGTTCGGGTTTTGTAATGTTGCCTTAAACGATCTTTCTATAAAAGGGTTTAAAAGAGCAGTTTAAAAAAAAAAGAGACACTAATTTCTCATTTTTACCTTACCTGATAATCTGCAGAGTAAACTAGTAATAATTCTTCTGGGCAAAATGTCAAATGATCAACCCAGAATACTTATGGAAACCACAACAACATATGTAGGTTACCTGTTTAACTTATTTGACTTTATTATTTCCTTGTTCTAGTTTTTTTTTTAAACGACTTTTTGTTTTTAACATTTCTCAGGCACCTCCATCACATTCTCTCCTAAAAACTTAAAATGTCATAAAACAGGGTTCTTTAAAACCAGTTTAAGCTAAACTCTGCAGGACAGTTGTCAGGAAACACGAACCAGAGAGATGGTAAGTAAAGTTCAAGCAAGCTTTATTGAACACAGTAGTATGCACAAGACGATGGATGAACTGGTATGTATAGAAGATGCAGCAGGAGGATAACAGACGGGTACGTTGCCACAGTTTCTCAGTCACTGATGAATAGATAATGTGGAGACATGGGTGAGGAGAGGAAGAGCAGGTAAGGAGGTGTCATGTCAGGTAAGTAACAATCTGGGAGACGCATGAGGGAAGTCTGACGGAACTAGACAATGGCTGCGTCCGAAACCGCCTACTTCTCTACTATTTAGTAGGGGAAAAGCAGTAGGCGAGCGAATAAGTATGTCCGAAGCAAAAAGAGTGAATTTTACCTGGGTGACGTACTAATTCTCGCGAGATTCGGACGTGCGTCTACTTAAAGTGCGTCCGAAACCGCCTACTTCTCTACTATATAATAGGGAAAAAGCAGTAGGCGAGCAATTAAGTATGTCAGAAACCTCAGTAATCATAAATGTCAAGAAGTTCCCGGATGGCCTACTGCTTCCGCCCAGATTCTGAAGTGTTCCTCGATCGATACTTTTCTATCCCAGGAGGCCACGGGAGAGGGTACGTCATAATCGAACACGGAGGAGAAAAGCGGCGCGGATGCTTTCAAATGTGAGTATTGAAAACTGAAAACACGGTTCCTTGTAATAAAATAGCATTTGTTGAACTACTTTAGAGTAAACCGCTGAATGTGTAAAGATGCTAGGCACTATAGTTGTGATTTTACAGTAAAAACACGATTTATTATGATTACAGGGGAGCTCTAGTAAACACACATAACTTAATTCTCCGAAGTGGATTTACATATTCTAAACCACATCTTAAAGGTGCTTATTAAATGTTTATTTAACATCTGACAGGAACATCTTCTTTAAGTATTATGGCTTATGAGTTATGGATTATGTATGAGTGATGTATGTGTGCTATTATGTAGAATTCACTGTTGTCAACACTGCTTACATTACATGAATGAAAATAATGTAAATAAATTAATCTACATAAAATAAACATAAGTTTAATCTATTTTATTTGACCATTAGTACTGTTGGTAAATTAAGGAACGTTTGTATTGGATAAAAAGAGAGTTAACACATCATTAACATGTAAATGTAGATTTAAGCACATAAATCTCAGAGGAAACTTGAATCTTGTCTGGATGTTACAGGGACAGATGATCACACGTGTGTTTATCCGGTGATGAAGGAATGCTGCCATCAAAGGCTTTGAGTGAGGATACTACAGAAATGAATAAGTCTATTTAAATCTAAAGTCTAGTTTATTTTAATTATTGTAATTTAAACAGAGTTATTACAGCACTTTTCTGAATCTTGATTTCTGTGCATTTGCTGCAGAGCTTTGTGGTGAAGCAGGACCTACAAGACAAGGATGTGAAATGTCCTTAGACTGGTGTGAGCACTGAGGATGGAGAGCCACAGCAGATCCTGGAAATGGTGTAGAGCCTTGGATGAGACCCTCCATCACTCCTCCTTCCAAGTGACTTGATCAAGGACACACTGGAGGTGATGCTGCAGAGATTGAACCAGCAACCTTCTGCTGA

Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU171966 False 4440 lncRNA 0.36 3 183240 187932
TU171967 True 4565 lncRNA 0.35 2 183240 187932

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000029_00263434_00300185 CD2AP coding downstream 75502 263434 ~ 300376 (+)
CI01000029_00321187_00331540 NA coding downstream 132198 320130 ~ 331875 (+)
CI01000029_00443200_00452374 SPATS1, CNIH3 coding downstream 253199 441131 ~ 453072 (+)
CI01000029_00469836_00474738 NA coding downstream 281904 469836 ~ 474946 (+)
CI01000029_00643229_00643768 SRP09, SRP9 coding downstream 454631 642563 ~ 644285 (+)
G151408 NA non-coding upstream 140 181368 ~ 183100 (+)
G151471 NA non-coding downstream 60812 248744 ~ 249084 (+)
G151493 NA non-coding downstream 152056 339988 ~ 340244 (+)
G151418 NA non-coding downstream 153547 341479 ~ 348906 (+)
G151681 NA non-coding downstream 271226 459158 ~ 461878 (+)
G151702 NA non-coding downstream 336977 524909 ~ 525212 (+)
G151495 NA other downstream 178609 366541 ~ 371922 (+)
CI01000029_01526863_01527414 NA other downstream 1338854 1526754 ~ 1527899 (+)
G152451 NA other downstream 2573662 2761594 ~ 2762939 (+)
G153475 NA other downstream 3357193 3545125 ~ 3562004 (+)
G153790 NA other downstream 4545657 4733589 ~ 4740107 (+)

Expression


Co-expression Network