RNA id: TCONS_00012270



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00012270
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_006269
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 48902945 ~ 48903059 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTCGGCAGCTAGGTCTCTGCAACTCGCACATAGTCACCCacagaagctaagcagggctgcgcccggtcagtaacttgataggagaccacatgggaaagctaggttgctgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182033

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013427 lncRNA upstream 61188 48766220 ~ 48841757 (+) True XLOC_006267
TCONS_00012269 lncRNA upstream 135471 48765887 ~ 48767474 (+) False XLOC_006267
TCONS_00013690 lncRNA upstream 169912 48729645 ~ 48733033 (+) True XLOC_006266
TCONS_00013426 lncRNA upstream 285421 48615112 ~ 48617524 (+) True XLOC_006264
TCONS_00013425 lncRNA upstream 315535 48578934 ~ 48587410 (+) True XLOC_006263
TCONS_00013431 lncRNA downstream 380714 49283773 ~ 49287310 (+) True XLOC_006272
TCONS_00013691 lncRNA downstream 405491 49308550 ~ 49313340 (+) False XLOC_006273
TCONS_00013692 lncRNA downstream 405802 49308861 ~ 49313340 (+) False XLOC_006273
TCONS_00013693 lncRNA downstream 407432 49310491 ~ 49313340 (+) False XLOC_006273
TCONS_00013694 lncRNA downstream 407637 49310696 ~ 49313340 (+) True XLOC_006273
TCONS_00012268 mRNA upstream 250360 48617974 ~ 48652585 (+) True XLOC_006265
TCONS_00012267 mRNA upstream 351135 48482256 ~ 48551810 (+) True XLOC_006261
TCONS_00012263 mRNA upstream 521890 48358467 ~ 48381055 (+) False XLOC_006260
TCONS_00012264 mRNA upstream 532362 48358538 ~ 48370583 (+) False XLOC_006260
TCONS_00012265 mRNA upstream 537047 48359573 ~ 48365898 (+) False XLOC_006260
TCONS_00012272 mRNA downstream 272565 49175624 ~ 49206649 (+) False XLOC_006271
TCONS_00012273 mRNA downstream 272888 49175947 ~ 49206713 (+) True XLOC_006271
TCONS_00012275 mRNA downstream 824274 49727333 ~ 49769372 (+) False XLOC_006274
TCONS_00012274 mRNA downstream 824274 49727333 ~ 49769372 (+) True XLOC_006274
TCONS_00012276 mRNA downstream 1248348 50151407 ~ 50171965 (+) True XLOC_006277
TCONS_00012262 other upstream 856717 48046112 ~ 48046228 (+) True XLOC_006258
TCONS_00012261 other upstream 998763 47904068 ~ 47904182 (+) True XLOC_006257
TCONS_00012254 other upstream 1767091 47120482 ~ 47135854 (+) True XLOC_006247
TCONS_00012252 other upstream 1852919 47049912 ~ 47050026 (+) True XLOC_006248
TCONS_00012251 other upstream 1859982 47039477 ~ 47042963 (+) False XLOC_006247
TCONS_00012271 other downstream 79627 48982686 ~ 48982800 (+) True XLOC_006270
TCONS_00012280 other downstream 1617609 50520668 ~ 50521600 (+) True XLOC_006285
TCONS_00012281 other downstream 1699580 50602639 ~ 50602714 (+) True XLOC_006286
TCONS_00012283 other downstream 1890697 50793756 ~ 50793872 (+) True XLOC_006288
TCONS_00012284 other downstream 2098000 51001059 ~ 51001178 (+) True XLOC_006289

Expression Profile


//