RNA id: TCONS_00012284



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00012284
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.45
exon number 1
gene id XLOC_006289
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 51001059 ~ 51001178 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gaaaaaactcacttcattttgactcatttctgTAAAGACAATATGttgaagctgagcagggctgagcctggtcagtaacCAGATGggggaccacatgggaaaactaggtagctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000160852

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013699 lncRNA upstream 479459 50520625 ~ 50521600 (+) False XLOC_006285
TCONS_00012279 lncRNA upstream 483834 50481817 ~ 50517225 (+) False XLOC_006283
TCONS_00013435 lncRNA upstream 483834 50499520 ~ 50517225 (+) True XLOC_006283
TCONS_00013434 lncRNA upstream 510903 50488157 ~ 50490156 (+) True XLOC_006284
TCONS_00013433 lncRNA upstream 529785 50470860 ~ 50471274 (+) True XLOC_006282
TCONS_00012286 lncRNA downstream 296375 51297553 ~ 51375708 (+) False XLOC_006291
TCONS_00012287 lncRNA downstream 310758 51311936 ~ 51375708 (+) True XLOC_006291
TCONS_00013436 lncRNA downstream 316046 51317224 ~ 51318734 (+) True XLOC_006292
TCONS_00013437 lncRNA downstream 327292 51328470 ~ 51332764 (+) True XLOC_006293
TCONS_00012289 lncRNA downstream 427220 51428398 ~ 51431317 (+) False XLOC_006294
TCONS_00012278 mRNA upstream 623021 50375800 ~ 50378038 (+) True XLOC_006279
TCONS_00012277 mRNA upstream 628038 50368668 ~ 50373021 (+) True XLOC_006278
TCONS_00012276 mRNA upstream 829094 50151407 ~ 50171965 (+) True XLOC_006277
TCONS_00012275 mRNA upstream 1231687 49727333 ~ 49769372 (+) False XLOC_006274
TCONS_00012293 mRNA downstream 578673 51579851 ~ 51584264 (+) True XLOC_006297
TCONS_00012294 mRNA downstream 709547 51710725 ~ 51731298 (+) True XLOC_006299
TCONS_00012296 mRNA downstream 852538 51853716 ~ 51881759 (+) False XLOC_006301
TCONS_00012295 mRNA downstream 852538 51853716 ~ 51881759 (+) False XLOC_006301
TCONS_00012297 mRNA downstream 867847 51869025 ~ 51881011 (+) True XLOC_006301
TCONS_00012283 other upstream 207187 50793756 ~ 50793872 (+) True XLOC_006288
TCONS_00012281 other upstream 398345 50602639 ~ 50602714 (+) True XLOC_006286
TCONS_00012280 other upstream 479459 50520668 ~ 50521600 (+) True XLOC_006285
TCONS_00012271 other upstream 2018259 48982686 ~ 48982800 (+) True XLOC_006270
TCONS_00012270 other upstream 2098000 48902945 ~ 48903059 (+) True XLOC_006269
TCONS_00012285 other downstream 101566 51102744 ~ 51102859 (+) True XLOC_006290