RNA id: TCONS_00017071



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00017071
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_008541
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 25667587 ~ 25667701 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCTGGCAGctggctctctgcaactctcacatggtcgcccacggAAGCCAAGCAGAGCTGCGCCCGGTatgtacctggataggagaccacatggaaaagctaggttgctgccggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189625

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018972 lncRNA upstream 96988 25568937 ~ 25570599 (+) True XLOC_008539
TCONS_00017066 lncRNA upstream 138162 25528309 ~ 25529425 (+) True XLOC_008538
TCONS_00018971 lncRNA upstream 268013 25395901 ~ 25399574 (+) True XLOC_008533
TCONS_00018969 lncRNA upstream 290093 25370731 ~ 25377494 (+) False XLOC_008532
TCONS_00018973 lncRNA downstream 228764 25896465 ~ 25902650 (+) False XLOC_008543
TCONS_00018974 lncRNA downstream 1008284 26675985 ~ 26680699 (+) True XLOC_008549
TCONS_00017087 lncRNA downstream 1628975 27296676 ~ 27300833 (+) True XLOC_008552
TCONS_00018778 lncRNA downstream 1664156 27331857 ~ 27332639 (+) True XLOC_008553
TCONS_00018975 lncRNA downstream 2042629 27710330 ~ 27712387 (+) False XLOC_008558
TCONS_00017068 mRNA upstream 11256 25635326 ~ 25656331 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017067 mRNA upstream 11260 25635326 ~ 25656327 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017069 mRNA upstream 11260 25635327 ~ 25656327 (+) False XLOC_008540
TCONS_00017065 mRNA upstream 124995 25528290 ~ 25542592 (+) False XLOC_008538
TCONS_00017064 mRNA upstream 168069 25489406 ~ 25499518 (+) True XLOC_008537
TCONS_00017072 mRNA downstream 13343 25681044 ~ 25690267 (+) False XLOC_008542
TCONS_00017073 mRNA downstream 15368 25683069 ~ 25688468 (+) True XLOC_008542
TCONS_00017077 mRNA downstream 731837 26399538 ~ 26402301 (+) True XLOC_008545
TCONS_00017079 mRNA downstream 905975 26573676 ~ 26593684 (+) False XLOC_008547
TCONS_00017080 mRNA downstream 906049 26573750 ~ 26592561 (+) True XLOC_008547
TCONS_00017070 other upstream 11256 25635341 ~ 25656331 (+) True XLOC_008540
TCONS_00017063 other upstream 197742 25469729 ~ 25469845 (+) True XLOC_008536
TCONS_00017050 other upstream 705335 24962136 ~ 24962252 (+) True XLOC_008523
TCONS_00017035 other upstream 984297 24676913 ~ 24683290 (+) False XLOC_008517
TCONS_00017027 other upstream 1098525 24563768 ~ 24569062 (+) False XLOC_008513
TCONS_00017074 other downstream 229745 25897446 ~ 25897539 (+) False XLOC_008543
TCONS_00017075 other downstream 230014 25897715 ~ 25897799 (+) True XLOC_008543
TCONS_00017076 other downstream 438614 26106315 ~ 26106433 (+) True XLOC_008544
TCONS_00017078 other downstream 772412 26440113 ~ 26440227 (+) True XLOC_008546
TCONS_00017092 other downstream 1807557 27475258 ~ 27475374 (+) True XLOC_008556