RNA id: TCONS_00043339



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043339
length 92
RNA type miRNA
GC content 0.41
exon number 1
gene id XLOC_021866
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 36130001 ~ 36130092 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTAGTCGTCTATATGTACCCTGTAGAACCGAATTTGTGTCCAAAACATCAAAATCGCAAATACGTCTCTACAGGAATACATGGGCGACGTAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115942

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00043323 lncRNA upstream 160256 35969429 ~ 35969745 (+) False XLOC_021856
TCONS_00043317 lncRNA upstream 331722 35790808 ~ 35798279 (+) True XLOC_021854
TCONS_00044872 lncRNA upstream 399939 35729255 ~ 35730062 (+) True XLOC_021852
TCONS_00044870 lncRNA upstream 402479 35723438 ~ 35727522 (+) False XLOC_021851
TCONS_00043342 lncRNA downstream 20338 36150430 ~ 36154411 (+) True XLOC_021868
TCONS_00044680 lncRNA downstream 187257 36317349 ~ 36317913 (+) True XLOC_021871
TCONS_00044681 lncRNA downstream 189086 36319178 ~ 36319588 (+) True XLOC_021872
TCONS_00044873 lncRNA downstream 234813 36364905 ~ 36365917 (+) True XLOC_021874
TCONS_00044874 lncRNA downstream 288027 36418119 ~ 36420278 (+) False XLOC_021875
TCONS_00043337 mRNA upstream 9490 36118738 ~ 36120511 (+) True XLOC_021865
TCONS_00043336 mRNA upstream 13094 36115541 ~ 36116907 (+) True XLOC_021864
TCONS_00043333 mRNA upstream 26366 36101185 ~ 36103635 (+) True XLOC_021863
TCONS_00043332 mRNA upstream 32513 36095260 ~ 36097488 (+) True XLOC_021862
TCONS_00043328 mRNA upstream 43106 36083529 ~ 36086895 (+) False XLOC_021856
TCONS_00043340 mRNA downstream 791 36130883 ~ 36132563 (+) True XLOC_021867
TCONS_00043341 mRNA downstream 14395 36144487 ~ 36149371 (+) True XLOC_021860
TCONS_00043343 mRNA downstream 48012 36178104 ~ 36190988 (+) True XLOC_021869
TCONS_00043344 mRNA downstream 176447 36306539 ~ 36309617 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043346 mRNA downstream 178336 36308428 ~ 36310415 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043331 other upstream 41805 36088091 ~ 36088196 (+) True XLOC_021861
TCONS_00043305 other upstream 660142 35426577 ~ 35469859 (+) False XLOC_021842
TCONS_00043302 other upstream 668992 35402697 ~ 35461009 (+) False XLOC_021842
TCONS_00043297 other upstream 1944987 34053506 ~ 34185014 (+) True XLOC_021835
TCONS_00043296 other upstream 1944992 34047563 ~ 34185009 (+) False XLOC_021835
TCONS_00043345 other downstream 177569 36307661 ~ 36310418 (+) False XLOC_021870
TCONS_00043352 other downstream 361022 36491114 ~ 36491234 (+) True XLOC_021877
TCONS_00043358 other downstream 660131 36790223 ~ 36790332 (+) True XLOC_021884
TCONS_00043361 other downstream 956073 37086165 ~ 37093123 (+) False XLOC_021888
TCONS_00043368 other downstream 1308742 37438834 ~ 37438950 (+) True XLOC_021894

Expression Profile


//