RNA id: TCONS_00072905



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00072905
length 301
RNA type processed_transcript
GC content 0.46
exon number 2
gene id XLOC_037042
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 18163629 ~ 18164027 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


acttatccagcaaatgtttatgcagcggatgcccttccagctgcaaaccatctctgggaaacatccatacacactcattcacactcatacacaacggacaatttagcttacccaattcacccagccaaggctcgaaccagagaccttattgctgtgaggtgacagcactgccTACCGCGCCACCGCATCGCTCCGATTAAAGAATATTTTTAGGCAAATCCGTGGTTCTTGGTAAGTtgtataatggcagtgaatgatACGTATATACACTACCTCACAAatgtcttgtcgtcaatcccag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000147954

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074890 lncRNA upstream 526955 17636381 ~ 17636674 (+) True XLOC_037037
TCONS_00072895 lncRNA upstream 723469 17438775 ~ 17440160 (+) True XLOC_037036
TCONS_00074889 lncRNA upstream 820085 17337151 ~ 17343544 (+) True XLOC_037032
TCONS_00072890 lncRNA upstream 829106 17331502 ~ 17334523 (+) True XLOC_037031
TCONS_00072887 lncRNA upstream 851948 17309058 ~ 17311681 (+) False XLOC_037031
TCONS_00072907 lncRNA downstream 51938 18215965 ~ 18248542 (+) True XLOC_037043
TCONS_00072918 lncRNA downstream 747670 18911697 ~ 18914987 (+) False XLOC_037050
TCONS_00075080 lncRNA downstream 747699 18911726 ~ 18914987 (+) True XLOC_037050
TCONS_00072922 lncRNA downstream 931066 19095093 ~ 19101825 (+) False XLOC_037052
TCONS_00074891 lncRNA downstream 1064792 19228819 ~ 19229066 (+) True XLOC_037053
TCONS_00072904 mRNA upstream 120331 18023288 ~ 18043298 (+) True XLOC_037041
TCONS_00072899 mRNA upstream 156997 17971935 ~ 18006632 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072900 mRNA upstream 161858 17982737 ~ 18001771 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072901 mRNA upstream 165155 17983463 ~ 17998474 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072902 mRNA upstream 166375 17984358 ~ 17997254 (+) False XLOC_037040
TCONS_00072906 mRNA downstream 51913 18215940 ~ 18278580 (+) False XLOC_037043
TCONS_00072910 mRNA downstream 408943 18572970 ~ 18587754 (+) False XLOC_037046
TCONS_00072911 mRNA downstream 412020 18576047 ~ 18584555 (+) True XLOC_037046
TCONS_00072916 mRNA downstream 552458 18716485 ~ 18721416 (+) True XLOC_037048
TCONS_00072917 mRNA downstream 665333 18829360 ~ 18905317 (+) True XLOC_037049
TCONS_00072903 other upstream 165153 17988466 ~ 17998476 (+) True XLOC_037040
TCONS_00072896 other upstream 500564 17662950 ~ 17663065 (+) True XLOC_037038
TCONS_00072889 other upstream 836123 17317167 ~ 17327506 (+) False XLOC_037031
TCONS_00072882 other upstream 2177832 15982344 ~ 15985797 (+) True XLOC_037025
TCONS_00072881 other upstream 2255809 15907033 ~ 15907820 (+) True XLOC_037024
TCONS_00072908 other downstream 152376 18316403 ~ 18316520 (+) True XLOC_037044
TCONS_00072909 other downstream 186340 18350367 ~ 18350483 (+) True XLOC_037045
TCONS_00072912 other downstream 441433 18605460 ~ 18607993 (+) False XLOC_037047
TCONS_00072913 other downstream 441537 18605564 ~ 18608269 (+) False XLOC_037047
TCONS_00072914 other downstream 441544 18605571 ~ 18607805 (+) False XLOC_037047

Expression Profile


//