G255691


Basic Information

Item Value
gene id G255691
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000059
NCBI id null
chromosome length 10376574
location 6932138 ~ 7046601 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU290225
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU290225 True 12065 lncRNA 0.37 3 6932138 7046601

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000059_06817935_06848280 NA coding downstream 83858 6817890 ~ 6848280 (-)
CI01000059_06743553_06768560 KIF1C coding downstream 163578 6743261 ~ 6768560 (-)
CI01000059_06668658_06675615 SLC25A11 coding downstream 256523 6666920 ~ 6675615 (-)
CI01000059_06656629_06660298 SPAG7 coding downstream 271840 6656387 ~ 6660298 (-)
CI01000059_06642665_06650346 RNF167 coding downstream 281140 6642309 ~ 6650998 (-)
CI01000059_07144283_07150061 NA coding upstream 97245 7143846 ~ 7152701 (-)
CI01000059_07156085_07160233 NA coding upstream 109115 7155716 ~ 7160233 (-)
CI01000059_07212957_07217869 SLC25A45 coding upstream 166356 7212957 ~ 7217869 (-)
CI01000059_07222636_07225677 NA coding upstream 175852 7222453 ~ 7225677 (-)
CI01000059_07226610_07230853 NA coding upstream 180009 7226610 ~ 7230853 (-)
G255719 NA non-coding downstream 28671 6901490 ~ 6903467 (-)
G255238 NA non-coding downstream 121113 6810802 ~ 6811025 (-)
G255158 NA non-coding downstream 130533 6797770 ~ 6801605 (-)
G255209 NA non-coding downstream 235795 6696050 ~ 6696343 (-)
G255205 NA non-coding downstream 242193 6689711 ~ 6689945 (-)
G255735 NA non-coding upstream 120905 7167506 ~ 7168853 (-)
G255740 NA non-coding upstream 185187 7231788 ~ 7231999 (-)
G255742 NA non-coding upstream 187514 7234115 ~ 7234338 (-)
G255697 NA non-coding upstream 227821 7274422 ~ 7327314 (-)
G255681 NA non-coding upstream 274918 7321519 ~ 7325568 (-)
G255092 NA other downstream 689346 6236106 ~ 6242792 (-)
G254203 NA other downstream 1693839 5237786 ~ 5238299 (-)
G253914 NA other downstream 2178056 4753538 ~ 4754082 (-)
G253013 NA other downstream 3460229 3471475 ~ 3471909 (-)
CI01000059_02096875_02098872 CDC26 other downstream 4832471 2094279 ~ 2098985 (-)
G256890 NA other upstream 1935095 8981696 ~ 8982117 (-)
G257014 NA other upstream 2407615 9454216 ~ 9599008 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G108050 NA unknown CI01000019 null 2340999 ~ 2341333 (+)
eurasian perch (Perca fluviatilis) G158187 LOC103376870 non-coding NC_053126.1 CM020923.1 26040679 ~ 26048461 (+)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G103817 NA non-coding NC_047600.1 CM018546.1 23512157 ~ 23513328 (-)
bowfin (Amia calva) G34938 LOC103376870 non-coding CM030124.1 CM030124.1 28329317 ~ 28329834 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G32556 NA non-coding NC_035899.1 CM008302.1 72242485 ~ 72242811 (+)