G287342


Basic Information

Item Value
gene id G287342
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000073
NCBI id null
chromosome length 1307889
location 81177 ~ 83765 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU325732
CGGCATGAAAATCAGTGCATAAGTGCATTTCTATGTGACAAAAGTGCAATATTAAATTTAACTGCATTTGTAGTAAATTCAATAATATCCATCATTATTTGTTTTATTTATTAATTTTGCATCTGTCATGTGACAAATGAGCAAAACACTCAGACTTGAAGACACGGTAGGGATGATGGTGAATACAACATCTTACAAAATCATGTCTTTAATGAAACATTTTATTCATGCAACATGTTTGGCTGTGGTATGGATATAGCTAATGAATACAAACATGAAAAAGTGCCACAGTAGCCTACAGAATCACAAAAATTCAAATGTACATGTTAATTAAACATTAGTCTATTGTTGGTCTTGCATTAGTTAGTAGTTCTACTAATGTATACAGTATATGTGTGACATGCACTCCTTAAATGCCACCAGTTTGAGTCATTTTCCCTTTAAGACTGTGTTTAAATGACAGGGGTATTAATTGCACAGGTCCGTCTGACAGCACCTGGCTGTAATGTAGGGGCTGGACTGAAGAATCAAGCAATCTCCCATTTTACTGCACCTCCGGAAGTAGGAAAGGGATATGTGGTGAATCTGGCAGATACACAGGCATCTTGCCCATAGCCACACGTCTCCTTTGTGGTCACACAACTTCCTCCAGGTCTGCCGGGGACACACCTGTTACATTTCAGGGCAGAGCCTACAACACAGTTCAAGAAATTATCACTATTGCATCAAGATGGAAACACTAAGCTTTTAATGTGAATGCAGTCAAAACATGACAGATTATTGGTTTGCACAATCAGACTTCTCAGATAAAGGACACTGTTGTGGCTGTGCTAAGACACTGGACTTCTGTGGTACTAAAACAGTTCAGAAAAAGCAGTTTGGCTTTAAACATGCAAACCCACCATTCGCCAACACCAGGGTGAGAACAAGAGCCAGCAGCAGAACCTTCATCATTCTGTTGATTAAAGTGGAAAATTAAGCAACTGACTAATCGATATTGGTTATTAAAACAGAAAGTATCAGATATGCTAATTATCTGACAATTTATGAAACATTTAATGCACCCTTATATTTCAATGAGCAACTGATTCATTTAGTTTACTTATTTACCTTAGTCTGTTGTGTGCTGTATTCTTATGTCCTTTGTTTTCTTTGAAATTGCAGCGCTTAGACAGCAAAATATGAATTTAATCATTATTTATATATTATTTATTATCATTATTTTATATATATTAAAAAGCAAACTTAGTTAACTTACCTTGACTGTGAAGCAGAGATGAATGTAGTTCATACA
>TU325733
CGGCATGAAAATCAGTGCATAAGTGCATTTCTATGTGACAAAAGTGCAATATTAAATTTAACTGCATTTGTAGTAAATTCAATAATATCCATCATTATTTGTTTTATTTATTAATTTTGCATCTGTCATGTGACAAATGAGCAAAACACTCAGACTTGAAGACACGGTAGGGATGATGGTGAATACAACATCTTACAAAATCATGTCTTTAATGAAACATTTTATTCATGCAACATGTTTGGCTGTGGTATGGATATAGCTAATGAATACAAACATGAAAAAGTGCCACAGTAGCCTACAGAATCACAAAAATTCAAATGTACATGTTAATTAAACATTAGTCTATTGTTGGTCTTGCATTAGTTAGTAGTTCTACTAATGTATACAGTATATGTGTGACATGCACTCCTTAAATGCCACCAGTTTGAGTCATTTTCCCTTTAAGACTGTGTTTAAATGACAGGGGTATTAATTGCACAGGTCCGTCTGACAGCACCTGGCTGTAATGTAGGGGCTGGACTGAAGAATCAAGCAATCTCCCATTTTACTGCACCTCCGGAAGTAGGAAACTAGAGGAATGTAAAAGAATTTAAAAGTAAATGAATGTCCTTGTTCATCTTGACATATTTTTCTGTCTTTCTAAACATTCTATATTTTTGTGTAAAATCCATTGCACACATGATAATTTGAGATAGGGACTCACAGGGATATGTGGTGAATCTGGCAGATACACAGGCATCTTGCCCATAGCCACACGTCTCCTTTGTGGTCACACAACTTCCTCCAGGTCTGCCGGGGACACACCTGTTACATTTCAGGGCAGAGCCTACAACACAGTTCAAGAAATTATCACTATTGCATCAAGATGGAAACACTAAGCTTTTAATGTGAATGCAGTCAAAACATGACAGATTATTGGTTTGCACAATCAGACTTCTCAGATAAAGGACACTGTTGTGGCTGTGCTAAGACACTGGACTTCTGTGGTACTAAAACAGTTCAGAAAAAGCAGTTTGGCTTTAAACATGCAAACCCACCATTCGCCAACACCAGGGTGAGAACAAGAGCCAGCAGCAGAACCTTCATCATTCTGTTGATTAAAGTGGAAAATTAAGCAACTGACTAATCGATATTGGTTATTAAAACAGAAAGTATCAGATATGCTAATTATCTGACAATTTATGAAACATTTAATGCACCCTTATATTTCAATGAGCAACTGATTCATTTAGTTTACTTATTTACCTTAGTCTGTTGTGTGCTGTATTCTTATGTCCTTTGTTTTCTTTGAAATTGCAGCGCTTAGACAGCAAAATATGAATTTAATCATTATTTATATATTATTTATTATCATTATTTTATATATATTAAAAAGCAAACTTAGTTAACTTACCTTGACTGTGAAGCAGAGATGAATGTAGTTCATACA
>TU325735
CGGCATGAAAATCAGTGCATAAGTGCATTTCTATGTGACAAAAGTGCAATATTAAATTTAACTGCATTTGTAGTAAATTCAATAATATCCATCATTATTTGTTTTATTTATTAATTTTGCATCTGTCATGTGACAAATGAGCAAAACACTCAGACTTGAAGACACGGTAGGGATGATGGTGAATACAACATCTTACAAAATCATGTCTTTAATGAAACATTTTATTCATGCAACATGTTTGGCTGTGGTATGGATATAGCTAATGAATACAAACATGAAAAAGTGCCACAGTAGCCTACAGAATCACAAAAATTCAAATGTACATGTTAATTAAACATTAGTCTATTGTTGGTCTTGCATTAGTTAGTAGTTCTACTAATGTATACAGTATATGTGTGACATGCACTCCTTAAATGCCACCAGTTTGAGTCATTTTCCCTTTAAGACTGTGTTTAAATGACAGGGGTATTAATTGCACAGGTCCGTCTGACAGCACCTGGCTGTAATGTAGGGGCTGGACTGAAGAATCAAGCAATCTCCCATTTTACTGCACCTCCGGAAGTAGGAAACTAGAGGAATGTAAAAGAATTTAAAAGTAAATGAATGTCCTTGTTCATCTTGACATATTTTTCTGTCTTTCTAAACATTCTATATTTTTGTGTAAAATCCATTGCACACATGATAATTTGAGATAGGGACTCACAGGGATATGTGGTGAATCTGGCAGATACACAGGCATCTTGCCCATAGCCACACGTCTCCTTTGTGGTCACACAACTTCCTCCAGGTCTGCCGGGGACACACCTGTTACATTTCAGGGCAGAGCCTACATTCGCCAACACCAGGGTGAGAACAAGAGCCAGCAGCAGAACCTTCATCATTCTGTTGATTAAAGTGGAAAATTAAGCAACTGACTAATCGATATTGGTTATTAAAACAGAAAGTATCAGATATGCTAATTATCTGACAATTTATGAAACATTTAATGCACCCTTATATTTCAATGAGCAACTGATTCATTTAGTTTACTTATTTACCTTAGTCTGTTGTGTGCTGTATTCTTATGTCCTTTGTTTTCTTTGAAATTGCAGCGCTTAGACAGCAAAATATGAATTTAATCATTATTTATATATTATTTATTATCATTATTTTATATATATTAAAAAGCAAACTTAGTTAACTTACCTTGACTGTGAAGCAGAGATGAATGTAGTTCATACA
>TU325734
GAATTCCAAAACACAGTCTTTAATAAATCCACAGAAGAGAAACACAGGAGACAGGCAAATACATTCACGTTATACATAGACAAGATTAGACAAGGAACTGAACGAATCAGGGAATATATATATACTAGAACCAGTAAGGAAGCTAAACTTGATAAGTGATGAACAGGGCACAGGTGAATGAAATGACTGATTAGGAAAACTAGTTCACCAGGACTGAACCAAAAACACAATGAAGGGGGAACACAACATACATGTTACATCCGAGTGTGAACGCACTCTTAAAAATAATGGTTCCAATGGGGTTTTTGCGGTGATGCCATAGAAGAGCTATTTTTGTTTCCCTAAAGAACGTTTTAGTGAACAGTTCTTAAACAACCATTTTTTCTTAGAGTGAAAAACATTTTATAATCTAATGAACCTTTTTTTCACTATAAAAGTTCCATGGATGTTAAAGGTTCTTAATGGAACCATAGATGCCAACTTTATTTTTTTAGAGTGTGAATCAATAGAACAGTATTGCATACTACCATACTAGTCTTACTAGTTCTGCACTATATTGTACACAGTATTCTCATTTTCATTATACATGCAACACCAGACCTACTGTATAGTAAATGGTCATTTATGAATGATTTATTCATTTTGCATCTGTCATGTGACAAATGAGCAAAACACTCAGACTTGAAGACACGGTAGGGATGATGGTGATACAACATCTTACAAAATCATGTCTTTAATGAAACATTTTATTCATGCAACATGTTTGGCTGTGGTATGGATATAGCTAATGAATACAAACATGAAAAAGTGCCACAGTAGCCTACAGAATCACAAAAATTCAAATGTACATGTTAATTAAACATTAGTCTATTGTTGGTCTTGCATTAGTTAGTAGTTCTACTAATGTATACAGTATATGTGTGACATGCACTCCTTAAATGCCACCAGTTTGAGTCATTTTCCCTTTAAGACTGTGTTTAAATGACAGGGGTATTAATTGCACAGGTCCGTCTGACAGCACCTGGCTGTAATGTAGGGGCTGGACTGAAGAATCAAGCAATCTCCCATTTTACTGCACCTCCGGAAGTAGGAAAGGGATATGTGGTGAATCTGGCAGATACACAGGCATCTTGCCCATAGCCACACGTCTCCTTTGTGGTCACACAACTTCCTCCAGGTCTGCCGGGGACACACCTGTTACATTTCAGGGCAGCCATTCGCCAACACCAGGGTGAGAACAAGAGCCAGCAGCAGAACCTTCATCATTCTGTTGATTAAAGTGGAAAATTAAGCAACTGACTAATCGATATTGGTTATTAAAACAGAAAGTATCAGATATGCTAATTATCTGACAATTTATGAAACATTTAATGCACCCTTATATTTCAATGAGCAACTGATTCATTTAGTTTACTTATTTACCTTAGTCTGTTGTGTGCTGTATTCTTATGTCCTTTGTTTTCTTTGAAATTGCAGCGCTTAGACAGCAAAATATGAATTTAATCATTATTTATATATTATTTATTATCATTATTTTATATATATTAAAAAGCAAACTTAGTTAACTTACCTTGACTGTGAAGCAGAGATGAATGTAGTTCATACA

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU325732 False 1294 lncRNA 0.36 3 81177 83765
TU325733 False 1429 lncRNA 0.35 2 81177 83765
TU325735 False 1221 lncRNA 0.35 3 81177 83765
TU325734 True 1606 lncRNA 0.36 4 81622 83765

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000073_00048073_00049706 NA coding upstream 30665 47933 ~ 50512 (+)
CI01000073_00104834_00107807 CRYGN, CRYGN2, CRYGN1 coding downstream 21069 104834 ~ 107877 (+)
CI01000073_00116439_00125912 ACVR2B coding downstream 32674 116439 ~ 126102 (+)
CI01000073_00249780_00250877 NA coding downstream 166015 249780 ~ 251150 (+)
CI01000073_00262918_00263376 NA coding downstream 179153 262918 ~ 263617 (+)
CI01000073_00275690_00276754 NA coding downstream 191925 275690 ~ 277825 (+)
G287347 NA non-coding upstream 4458 61275 ~ 76719 (+)
G287337 NA non-coding upstream 48134 31230 ~ 33043 (+)
G287335 NA non-coding upstream 68314 12507 ~ 12863 (+)
G287358 NA non-coding downstream 9012 92777 ~ 93004 (+)
G287359 NA non-coding downstream 10606 94371 ~ 94712 (+)
G287360 NA non-coding downstream 15078 98843 ~ 99862 (+)
G287364 NA non-coding downstream 25624 109389 ~ 109929 (+)
G287365 NA non-coding downstream 26340 110105 ~ 110415 (+)
G287391 NA other downstream 107179 190944 ~ 199772 (+)
G287638 NA other downstream 625279 709044 ~ 718401 (+)

Expression


Co-expression Network