G312877


Basic Information

Item Value
gene id G312877
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000097
NCBI id null
chromosome length 390960
location 335227 ~ 343029 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU355714
TATGGAGAAAAACCCTGGAATGTTTTCCTCAAAAACCTTAATTGCTTTCCGACTGAAGAAAGAAAGACATGAACATCTTGGATGACATGGGGGAGAGTAAATTATCAGGAAATTTTAATTCAGGACCACAAACCTATGCTTTCAGGCACCCATTTTGTCCGTTCACCAGACATTTCTTGTGTTCAGAGTGTCCAACTTCTCCCTTACAGTGACCAGGTGCCTCTCAGAGCAGCTTAACATGCAGAAGCTGTAAATCAGACACTAACTCTCTCTCGGTCACACTTGGCTCGGTTTGCTGGAATGTGAACACATGCGATCCTTGATGGCTTTCTCTCATCAGAATGGAATATGTATGTTCTGGAGCACTGCAAGTGACGTTCATTAATGTTTCGCAGGTTGCGTTTCTGCCTGCCTTATTATTATACAAATAATTGGCAATGCATGTGATGAACGTAGATCCTGAATAATCCAGTGCCAGTAATTTTTTGATGAAATGCCAGAGGGTTGGCACTCGCGTTTGTAATTCCATAGTTGACTGGCATGCTGGTTTGTACTGTCTCCTCCCATTGATTAGGACCTCAATCACTCACTCACTTTGGCCTAGAGGCATCAAGGCAGAAAGAGACCCAGCATAGATTTTCTATACCAACATCATGTACACAGAGCAATTAAAGTTACCTGACTTGAAACCTCCAGTGAGAACACACCGTCCCCTCAACAAAAAGAAATGGTTTTTCTGCGAATGTGGCATGAGAATGACCTCTGCTTTCTCTGAAATTGTACGCTACGGACCGGTCAGAGTTGTGTTGTCTGCGGTCAGATGTTCGACCTTGTAATTTGCATGATGTTTTGGTGGGAAGTGTGAACACCGCCTTCGTTCGAAATGGAGATTTTATTCATTTAAGGTCACTGCACCCTTGTCTCAAGGGAATCGTGTTTAGAAAGAAACTAGTGTCAGAAATAAACCACTGATACAAACATGTTTTGTCACTATTTTACATTCTATCCAGTGCGTCGTGCTTTATATGATGGTTACATGATTAAATGAATGAAATGCTGACCGTATTCTCTCAGCTGAGGCTGTTTTTCTATTCCTGATTAGCAAGGCGGATGGTCACACATCCGCACTAACTCTGTGTGCTGAAAAATGTATTGAGTCTGCGAGATAAGGGCCCAGAAGTGTTCTGTAAATATTAATGGTTTAGGGTGGAATATTGGCTTTGGCTTATGAAATAATAATAGTGTAACATGTTGTGGCATTTGGCAGATGCAGTGTACAGGTTTTGATTGCAAGTGGTGATGAGTGTGTTAATGAAAACAGATCCGTGAATCAGCGAGGAGGTTGTCAGCACCTTTAAACAGCGAGGAAATAAAACATCTTTAAAAATGACAATCATTGAAACGCAGTCTTTCAAATCAGCTTGGCACTGTTGTTTTGCATGCAATATAAGCATTAATACAAACAAAATTGTGTTGTTTTTTTTTTGTATAACACTAGCTATGTTTCCATCCACCTTTTTTTTTGTTGCTCATTTTTTTTTTGATATTGCATAAAAAATCTGGATAGAAATGCCAAGATGTGCATAAATTTTAAAAATGCACTCAATTGAGGCGGATACAATAAGAAGACGTGCACATAAACTACGATGGAAACACATTTACCGAATAAATCCCTCAAAACCTCACGTGACTTTGGCTCAGCAGAGGCTGTGATTGGATAACTGGACTAACCAGCGGACCAATCACATCGCAGCATCTCAAATGTTGGTTTGCTGGTTCTGAGTCAAAGTCTGTCATCAGAATGATTTGGTTTAATTCCCTCCAGAAGCGTCTCACACGATTGTGTTCCCAAACACCAGCATCCGAGCGCAAGAGAACATGACAGCGTTCTGAGACGCTCTGAGACAAACTCATTTATGATGGAGGGAAAAAGAGCCCGATTGAAGCAACTTACATTTTTATTACTGATATTTTGCACCAATTTCCCTGGAAGTGATGATTTTGTTCTCTTGAACACAGGGAATGGAAATGCTGCTTTATTCACAAGTTAAATTCACAACTTTGGATGGAGACATGTGCTCTGTTATTGTTTAACGCCTTTCTGAATGAATAAATTTGGAATCTCATAATTCAAAGATTTTCAAAATATATCCAATATTGCATCACACACTCTAAAAAATGCTGGGTTAAAAAACAACCCAAGTTCGGTTGAAAATGGACAAACCCAGCGAATTGGTTGTTTTATAGGGCTGGGTATTGGCACAAATTTCAAAATTCGATTTGATTTCGATTTACAAGCTTGCAATTCGTTTCGATTAAATTCGTTTTGATTCAATATCGATTATTTTGGATATATATAAGGAACAGTACATATCTTCATTTATTTATATAGCGCTTTTCGATATTTTTTTTACCCAGCCCTATTGTTTTAACCCAGCAGTTGGGCTGTTTTAACCCAGCAGTTGAGCTGTTTTAACCCAGCAGTTGGGTTGTTTTAACCCGGCGAATGGGCTGTTTTAACCTGGCGAACGGGCTGTTTTACCCCAGCGGTTGGGTTAAATGTTTGCCCAACCTGCTGGTAGTTTTATTTAACTCTATTGTTTAAAAATTACTGTATTTCTTGCTTAAAATGAACCCAAAGTATGTTGGAAATGAACATTTATTAAAAAATTTAACGAACAACCCAATTGTTGGGTTAAAACAACCCAACCGCTGGGTTTGTCCATTTTCAACCCAACTTGGGTTGTTTTTAACNCAGCATTTTTGAAACAAATCTGTTGAATGAATGATTCAGTGACTCACTCATGAAGACTTCAGGCTTGTTCGAGTTGCATCTGCGCTGCACAGACCGATTGGCATATATATTACATCAATGTACCGCGATTCAAAAGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU355714 True 2893 lncRNA 0.39 3 335227 343029

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000097_00115317_00182129 ANGPT1 coding downstream 153098 115317 ~ 182129 (-)
CI01000097_00095560_00100777 NA coding downstream 234432 95266 ~ 100795 (-)
G312879 NA non-coding downstream 4594 323791 ~ 330633 (-)
G312878 NA non-coding downstream 11636 319525 ~ 323591 (-)
G312838 NA non-coding downstream 244258 53946 ~ 90969 (-)
G312875 NA non-coding upstream 118 343147 ~ 343961 (-)
G312909 NA non-coding upstream 34836 377865 ~ 378260 (-)

Expression


Co-expression Network