G474666


Basic Information

Item Value
gene id G474666
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000330
NCBI id null
chromosome length 4651236
location 1892495 ~ 1897748 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU544674
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU544674 True 5254 lncRNA 0.39 1 1892495 1897748

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000330_01761592_01770386 NA coding upstream 121585 1759205 ~ 1770910 (+)
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CI01000330_01525860_01549760 STRA6 coding upstream 341961 1525860 ~ 1550534 (+)
CI01000330_01406033_01412800 CYP11A2, CYP11A coding upstream 479695 1405958 ~ 1412800 (+)
CI01000330_01943089_01981418 TJP1B, TJP1 coding downstream 28943 1942696 ~ 1981682 (+)
CI01000330_02046876_02054740 NA coding downstream 133123 2046781 ~ 2054740 (+)
CI01000330_02102781_02112531 SQRDL coding downstream 187703 2101456 ~ 2112705 (+)
CI01000330_02116696_02127182 CTDSPL2A coding downstream 202827 2116580 ~ 2127231 (+)
CI01000330_02133497_02266195 SCAPER coding downstream 219744 2133497 ~ 2266241 (+)
G474639 NA non-coding upstream 2807 1880127 ~ 1889688 (+)
G474681 NA non-coding upstream 41386 1850753 ~ 1851109 (+)
G474677 NA non-coding upstream 46618 1845582 ~ 1845877 (+)
G474617 NA non-coding upstream 75493 1816346 ~ 1817002 (+)
G474483 NA non-coding upstream 143071 1747516 ~ 1749424 (+)
G474654 NA non-coding downstream 10167 1923920 ~ 1930143 (+)
G474687 NA non-coding downstream 89692 2003445 ~ 2004010 (+)
G474710 NA non-coding downstream 166993 2080746 ~ 2098190 (+)
G474715 NA non-coding downstream 185026 2098779 ~ 2098983 (+)
G474724 NA non-coding downstream 351393 2265146 ~ 2265433 (+)
G474750 NA other downstream 480404 2394157 ~ 2399678 (+)
G474771 NA other downstream 586349 2500102 ~ 2510170 (+)
G474777 NA other downstream 597703 2511456 ~ 2514764 (+)
G474807 NA other downstream 681293 2595046 ~ 2598105 (+)

Expression


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