G518144


Basic Information

Item Value
gene id G518144
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000360
NCBI id null
chromosome length 778440
location 301795 ~ 309690 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU594301
TAAATTATCAGGAAATTTTAATTCTGAAGTGAACTAATCCTTTAATATTTTGAATCAATAGTTTTGTGTTTTTGTAACTTTTAACAGTTTTTTTTTTTTAAATATGTCTATAGTTTTTATTTTTTATTTCAGTTGCAGTTATTTTATTGCATCAAATTAAACTAAATGAAAATGATGATTTATTATTTAATTTCAGTTTAATTTCAAATGTTTAATCTAGTTTTAGTGGACTACACTAGCCCTGCGGTCTCTCTCTGTGCTGCACACGGGCAGAATGATGACTGAAGTTGTTGGTTATCCATTTAACTTTGACCTAGATGAGACTGTCGAGTCTTTTTTTGGACTCTCACGGGACGCGGCAGTGTCCGTTCTCTCTTAATATACAGCGCGAGAGGACGAGTGGAGACGAGCTGCTGCCAGAGAACATCATCGGCATCGCTTGCATTTAGGGACCGCTAATTGGCAGTTAATTAGCAGAATTGACTCAGTTGTTGGTTCCCAAGTGCCAGCCTCCGCCCGCTCCAGCTTCATTTGATCTGATATCTCTCACAGCGCCAGAGCACTGATCCGCTTTTAGCATACGAGTCTACATCTGGCCAATGTGCGGCTCACATTCAGGCCAAACCGTCACTCGAAGTCTCTGACGTCACGTTCACTCTCAGCTCTCGGAGAGGGAAACTCCTGCTGCTTACTGTCATATCTGAATGTGCTGGTCTGATGTTCTTCCTCAGTATTTCTGCCTTGTTTTCCAGTACAAATATCTACACATTCTTAAATCAAGATACATGTTCTTATGACATAAGACAAAAAGTCTTGAATGTATCAAAATTAAGTGCATTCATGCAGTAACAATTTACAATTGGTTAACATTAGTAAATGCATTATTAACGTTAACTATGAGAAATATATTTTTACAGGATTTAACTTTTGTCAGTTAATATAAACACAATTGTTCATTGTGTCTTCATCTTATTTCAGAGTGAATTAACTAATGTTAACGGATATAACTTTGGATCATACAAATGCTGAGATTAACATCAACTAAGATTCACTTAATCTTAATATCTTCATTTTGCATCTCCAGTAAATGTATTTTGATTTAAGAATGTTTCGATATTTGTGCTGCACTGTAAACCTGAATAAGTTGGGCTAACTCAAAACATTTGAGGTAATCAGTTACATAATTTTTTTGAGTTATGATGTTCCCAATTTTAAGTAAGCGGAACTATCAAGTTTTGAGTTTGTAGTACTCATGCATGTTAATTGCTTGAAGTACTGAGTTATCAAACTACATTTTGATAGCAATTAACATAAAAGATTTAGCTAATTAACTTTTTTTTATTTTGAGTTCTTGCAAATCAAATGTTATTTACTTCACTGTAAACCCTAATAAGTTGTCAGAACTCAAAAAAGTTGAATGATAATTTTTTAAGTTAAGAAATTCAAAGTTTAAGATTTTTATTTTGTTCTTGACTTGAAATATTTGTGTAAACTAATTTATACATTTAACTTAAAATTATCAGGTTATCTCAACGTAAATATTTTATAATAGAAATCCCAGCCCAGTTTCAGTTAAACTTAAGTTCATCTGAATGAAAAGAAATGAGTTCATACAACTCAAAACAATGAAAGAGTTCAGTTTATTTTAAATATGTCAGTACTGTGAACTCAAAAGAAAAAGAAAGTTCTAAATACTCATAACAGTTCATTTAACTGAACTAATTTGTGTAATTTAAGTTTGTCCTACTCAAACCAATTAAGTATTTTGAGCGTTAGGGTTTACAAACTAGACAAAAACACTGAGGAAATAATCTTGTGAAACAGTGTGCGAATGAAAGTGAGACGGTGCACTGGGGTGAAACGGTTTTATGTTCTGGGATGGTGCGTTTTGTTTCGAGGGAGAAACAAATGGAGAAAGATTGAAGAAAGAAAAGAAGGTGAATAAGTGGGTTAATTTATATGGTTTGCAGCAGCGGCACATCACATGCGGCCGTCTGACGCAGCGCTGTAGGATCGTGCTGCGCCTCGGGCCATCTGTGAGCGGAATAGCAATTTTATTACATTGTCATTAAAGCAATTTCACAGCAGTATTGTTTGTTAATGAGAAGTCGCAAACGAGGAGAGATGTCACGGGCAGGAGTAGCATCGAGCTTCTCTATCTGCTCTTTTTATATATCACTGAAAAATAAATGCGCACTCACCCTTCCCATCTGTCTCTGGGCTCTGGCTTGTAAAAGGGAAACCCACTTAAAGCTGAAATATAAAGTCTATACTGCCAAGGTTGTGTTTATGAGCTGCCGTTGGACTTTAGTGTTCACTGCTCTGCTAGTTGGACTTCATATACGGAGCACTAACGTTCAGCTGAATCCAGTGTGTCTCTGGTCTCAGACTAGCAGAAACCTGATTGTTTTGGTTGCGTTCGTTCGGGACTCTGCTGGTCCTGGCGAGGATGTATGGCTGAGAGCTTCCTGTGTTTCACTCTCAGACGGATCAGTTGGCTTTTTCCAGTTATTTATAGAGGCAGATCTGCTGCTCCTCACACAGAGGATGAGGGAAATACAGCCCACATTAGTGAAATAAAGCCTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGGCGTCTTTCTGCTGACTCTGCAGATGAACATAGTGTGAGCTGGGAGGAAGTTAAGAGGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACCCTGGAGAGAAGAACGACTGACAATCAGGATTTGAAGGAACGAGTTTATCAGTTTCAGGCTGAAGAGGTTGTGGGATTCTGGGGGCATTCGGAGGGCTTCACTCTTCATAAAATAGGGCGTGAAACTCTTCTGAAATTATTTTTGCTCTTGTTCAATGAATAGCCGGTAAAAATATCTGCTGGATCTTCAAAAAACACTGATCATCAGCCTCAGGAGGTCCAACTAAATATGTTTCATTTATTAATTGCTATATAAGGTTGCAATCTTTGCAACCAAAATTTGGGAGATGTCTAAATGCATTTGTAATAAAGTTGTTATTTTGATATTTTCTAGCAATAAACAAACAATAAAATAATTACATTTTAGATAGATAGATAGATAGATTCACTAATGGATGCAGATTTAGTCTAAATGAAGCTGTCACTCAGTATAGCACCAGCTTGTACTTTTTAATAAACCTGTATTTCCCATAAGAAAAATATTTGTTTAATATTTTTTTCTTACGCTAACATTGAAGACCCTTGAGCTTTGTGCCTTTATTGCTTTAAAAAAGTAACGAGACTTCGTCTTTCTCATACAGTCACAAACACAAGCCGTACCTGAGATCTGTTTTCCCAGGATTCAATTTATCGCCCATTCTCTGAGCTACACATGCCAGCAGCGCCATCATAAATTAATACCTCACGTTTGTTTATTGAAGCGTGTCGTGTCAGCGAGCGGAGATGTTCTGGATGAGCTACCAGCAGAAATGATGCCAAAACGCGACGCGCTCTGGACGAACTCCAAACTGTGTTCACACACACCAACGGTGAAATAAAAGCAGGCCCTTTAAATGTCTCTCTCAGTGGACACTCCAGCCCTCTCGTCTCTCATTATCAGTTTGCACACACCCGCCCGCGTGGTTCTTCACAGCGTGAGACGGGACTGAGGGGTGAGAGACCGAGAGGAGCAGCGAGAGAGAGAGGGTGTTGAACCGTGGGCCCCTTTAGGGTCTGAGAGAATGGGCTGATTTTGAGATTGAATGGGGTGACGGGGGTGTGCGAGGGTAATGACAGAGTCCTCGCAGGCGGCAGTAAGTGAAAGGAGGTTAATTGAGAGGTTTCACTGATGACGGGCAGATCTCGGGCGCAGGTGCCCTGCAGCGGCTCCTCGCCGTAACTTACACTCCACATTAACCAGCATTACCCTCAGACATGTGTACACGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCGTCGTACGACACCAGGCCTCACGTCAAAGACAAAAATCAATTTTATAAGCAGGCAGTCCATCATATTTTATGTCCCTGTTCATGTTTTAAAAATTTTTTTTTTTTTTAAATAGTTTTGCTTTTGTAAAATAACATGCTTCTTTTGAGAGTTTGTTGTGCAATGATTGCACCAGACTGAGAAAAACTGGTGTAGGATTTACTTCGAAACAATTTTCACTCAGAAATTGCTTGTAAATTTCAGAGTTCAACTCTTAGTGAATCCAGGAACTGATCAAATGCTTAATATTTTTGAGTTTTATTTAAGTTTTGGGGTCAGTAAGATTAAAAATACAAAGTGGCAACATTTCCCTAGAGAGAGAAAGACTCGTGTCGGGTCAGAACGGTGGCGAGCGTCTGTGATCCCAGTGATAATCAAAAACAACTTGCAGAGCAAAGGTGCCTGAGCCGAGGAGGAAGACAGATGAGCCGAGGGAGGGTGAGAGAGAGAGAGACAGGATCCTCACACAGGTGTGTTGACGCCCGGGGCATCTTTGGCTCTGATTTGAGCCTGACTATCATGTCTTTAAGGACGCAGCGTCAGATGTCTGTGAGCTTTACCGGGGCCAAGACAAACCTGCCGCAGTTGTCAGAGCTTGCTGATGTAGCCAGTGAAGGTGTTTCTCGCGTGCGTCTCTCTCTCCTGCGGTAGACTGGCTGCTGTTGTGCCGCAGGACAGAGAGACGGAGAGACAGCAGAACAAAGTCTCGCTGTAAAAACCAGCAGCTGCTACTGCGGGATCAAAGGAGCAACAAGCGGCCCTTCCTGACCGGCCGACGCTCCAGGTGTTTGACGGACAGCTGACAGCCGGGGCCGACTCGGACCCTCCGGTGGGCCGCGCATATATGGGTGCAGCCCGCCTTCATACGCCACGATCACAGCCAGTCAGAACATTTTCTGATGCTTTTGTGGACCAATGAGATTCTGAGAAAGAAACACGGACGAAATAGCTTTATTGGTACGCTGCGGCTGGTCGGGACACTCCCAGCTGTTGTGTCTTTGATCAGGACACAGGCAGATATTTGAAAACACATCT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU594301 True 7876 lncRNA 0.41 2 301795 309690

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000360_00276724_00299803 MEIS1 coding upstream 1927 276337 ~ 299868 (+)
CI01000360_00239322_00269102 MEIS2 coding upstream 32607 239126 ~ 269188 (+)
CI01000360_00045139_00056179 GABRR1 coding upstream 245449 45139 ~ 56346 (+)
CI01000360_00032742_00035125 NA coding upstream 266646 32742 ~ 35149 (+)
CI01000360_00313760_00316560 MEIS2 coding downstream 3581 313271 ~ 316840 (+)
CI01000360_00461890_00465387 NA coding downstream 152013 461703 ~ 465569 (+)
CI01000360_00577462_00621640 DPH6 coding downstream 267772 577462 ~ 621645 (+)
CI01000360_00631283_00631570 NA coding downstream 320410 630100 ~ 631892 (+)
CI01000360_00647308_00657918 NA coding downstream 337144 646834 ~ 658405 (+)
G518118 NA non-coding upstream 98858 202513 ~ 202937 (+)
G518105 NA non-coding upstream 129647 171928 ~ 172148 (+)
G518013 NA non-coding upstream 188733 112694 ~ 113062 (+)
G517989 NA non-coding upstream 200895 64327 ~ 100900 (+)
G518309 NA non-coding downstream 369892 679582 ~ 679807 (+)

Expression


Co-expression Network