XLOC_016799


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016799
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 45095017 ~ 45098398 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033932
GTGTGGCGCACTACAAATTGTCCACTGCTACGATTGGCTGACAATTTTGCATAATTaaggtaaagtctagatgggaatcagctgcGAAACTCACATCATTATAGCATGTTTGTGACACAACATGTTCAACAATAATcaacatttttacattactgtgagtgTTTAAGGTGGATGTAGGGGTtgaagttaataaaatacaattcaatgGGTAATTTTAATCAATAATATGAATACTTGGTAAAAATACTGTTTACAGTACATGTCTGtgatttggtttggtttagggttggggaatgGATAATTTActtaatcatataaataattcgAGTTGTCTgaccgcagctgtatcccttctagcaacatcCCTTACCATCTTCATAGATGGATACCAGGTGCTACAAAGTAACAAGTTACTGTAGTTAAATGACTTTTTTAATTTCGGCAtgatttaataagttattttataatatacttgccttaaatactgtgtaattcaACAGTTCTATATGAATCAATTTAGAGAAGCAGagtaatatacaatatattttgctaaataattttTCAACTAAAGAAGAATGCTAATTTACCAGGACAGCTGCTTGACCTTAAGAATAAAATGAATTAAGAAATCATTTCACAACATAGAAATTCAGGGTAGCTGagtcattgtaaatatttattttgtgttattcaGACATTTTGCATATCAACTCAATTTCTctacaacaaaaaaagtttttaattaaaagttaaatttatGCTATTATATGTGAAATATGGTGTTATTacttttttgaaaagttttgtgcatttgtaaaaatattacttACACTCTTGAATGTTAATTTTTTCAAACAAAAGGCAGTGTTTGAATTGAAGGAAataagaattttattttttgtgtactgagatttataaataatatttagtcaaGTAATTTAAGTAATTATTGAGTAATCAAGATGAATTTCTCAACTGAATTAGAAAGGTTGTTTAAATACGACTGTAATCAtgtatttagtaaataaatactGAAGTAACTTAACACTGATGCGATGTAGGTGAAAAACGCACTGAGTACTATCAAACGATCTATAACAGACAAAGCATAGTGGCTTAAGGCTAGAAATGTAGCAGACCATgcttttaaatgttacatatttATCTCAGGAAAATAATCAAATGTTGAAGCAATATCAAACAGTAGGGTTGATAAAGAAATGGACAAGCAAATAACATGACTTTCCTTATTACAAGCAACTCAACAAAGCCTTTCCGAGTCTTGGATGGCTCCAAATTCAACCAGCGTTCTTCTCTGAAGATCACATTCATTAGTGCTACAGTGCAGCCATATTGCAGTGCTGAGAGTTAAATTACAGCAAAACACCACATTTTTATCTCCAGAGTCTCTTCAGGCAAGTGCTCCAGTCTTCTGCTGGAGTTTCTCTGTGTCCGCCATGTTGTTTTACACCTTTGTTCAGCCGGGGATGTCTCCAGCTGAGATTTCAGGAAGATATTTTTTGGGATCTCCAGGGAAGGGTTGGGACGGCGCCTGGTTAAAATGTCCTGTCAGGAAAATTCCGATGGTGCCCAGGATAAACAGCAGCGCCATGACAAAGAAGCACATCCTGTCAATCACCCTGGCGACCAGAAACCATTCCTCATTTTTctaaacagaagaagaagaaaggatGTCTGGAATTCAGACGTCAACAGCAGTTTGTCTGGGATTGAGAAGTTAAACCCGAACGCAAACATTGAGAGTGTTTATCTTGTATAATGAGAGACTCTTTTTAACCTCATGTTTGGAAGACTGTGGTGCAGTAACTCACACTTTGGAAGTCATTTTGATGCTTGGTGCTTTCTGCGATGTGTTTGCAGGAGGACACACACTGCTGCACTTCAGGGGAGGCCGCTGCTAAACTGCACTCCAGATCCTGTGCCGTGTTTCCCCCCAGACCATTCTCTGAGGTCAGAATAACACAGGATTAATGCCAGAAGCCATTTGGCAAAAACATCACTACAGAAAACCTTATTAAAAAGTGgttaataatatgttttattaatattatctaaAATCTGCATTCATctgtctgtaaaaaaaatattgctgccaAAATGTTCTTTTAGCTAaatcaatttaacttttttagtcATTTCAGCTCACATtaatcaaactaaactaaaaatattaagttgattgttaaaaaaaaaacttcttgtcactcaattgtttacagtgtatatacatttatgtaaacaaaaaaaaatgaaagagtaTAAACGAGCATGAAGGAACtaactaatataaaaaatacactaaTTACTGTTTAATAATATCATCCATTATTTGGTTCTGTATTTTGTGAAGgatgtttttctgtttatttacggttatgaattgcataatgggaagttgatctctgctctgtcgacttttaatgttgaaaattcaactctacagttgaacaaagtgacttttatggacATTTTAGTAGCTTGTGACAATATGTTATATAAGAAAAAACACATGGACAGTTAAGTCCATTATTTACagaaaaatgtactggcagtgtATTACCAGGTTTCTGTTCCAATATTTACAAcccaacccagacaataaatcTCTTCATACTAttaaaatgtctataaaagtcaCCTTTCCacctttttaacattaaaagttgATGGAGGAAAGATCCCGTAAATCAcaaatatattgatatattatagtatatttgaTAATGAATATcaagaatattttttattgttgttgaatATATAATACTGATTTAATAATGTGAATATATATTACTGATTTAATAATGCTCAATTAATTAgataaaaaacactgtaaaaagcgattggTTACATAAAAAAGTAAGTAAGTCCTGTTGCCCTTAAAACAACAAgctgaataattttaataattacacaCATAGTTAATTTAAATTAAGGTCCcgattttactcactttttaaaaaaaaagtcaactagtCACGTTTTAGAAtctacattcattttcctttggcttagtcccttatttattacgggttgccacagtggaatgaaccaccaactattctgtactgtatcaaaaatatatatatattttttgtgtttgttcaaacaacttattcaaaatgagctgaatcgtcacaattcttgagttttttggggtcAAATTATTcctttcatgttcaatccacttaaattttttaaatcaattaagttagcttaatcggtttgtgttgggacaacttgaaggatttttttacagtgttaaagAAATGATAATTTATTCAAGTCTTCTGAATTTTCAGcatgttcgttcatttattcattttctttcagcttagtctctatttcagaagtcgccaac

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033932 True 3382 lncRNA 0.32 1 45095017 45098398

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016798 CR293505.1 coding downstream 21107 45073794 ~ 45073910 (-)
XLOC_016797 NA coding downstream 27831 45052537 ~ 45067186 (-)
XLOC_016796 NA coding downstream 49497 45044482 ~ 45045520 (-)
XLOC_016795 vwa5b2 coding downstream 67263 44984509 ~ 45027754 (-)
XLOC_016794 mul1a coding downstream 123466 44960876 ~ 44971551 (-)
XLOC_016800 CU929150.3 coding upstream 776 45099174 ~ 45099504 (-)
XLOC_016801 eif4e2 coding upstream 18421 45116819 ~ 45135618 (-)
XLOC_016802 capn10 coding upstream 41072 45139470 ~ 45154622 (-)
XLOC_016803 CR407590.2 coding upstream 74440 45172838 ~ 45191319 (-)
XLOC_016804 dre-mir-181b-1 coding upstream 103825 45202223 ~ 45202331 (-)
XLOC_016792 CR788281.1 non-coding downstream 320422 44774275 ~ 44774595 (-)
XLOC_016791 CR788281.2 non-coding downstream 331642 44763082 ~ 44763375 (-)
XLOC_016805 NA non-coding upstream 126724 45225122 ~ 45227245 (-)
XLOC_016808 NA non-coding upstream 315203 45413601 ~ 45415299 (-)
XLOC_016809 NA non-coding upstream 329260 45427658 ~ 45448291 (-)

Expression


Co-expression Network