XLOC_018743


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_018743
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 12161079 ~ 12182384 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00039359
TGAGCTCGGCGAGGCAGCAGGGAAATCAGGAGGGGAGGCTGCAGGGACCGAGGCTATTCTTAAACACACAGCAACAGGCAAACGCAATTACAGGCGCAGGGAGACAGAGAACTAATCAAATCAGCAGAGAGACCAGACCAGACGAGACgagagagagaagagaaaaaGAAGAGGTCGCTGCTGCTGGAGAAACTCACCCACACCCAGACCTCTGCTCTCCAAATGAGGCCTGACATGCAGAgccacaacacacaaacacagatatacAGTAGACCCACACATGCCAGCTGCTGAGGGCCAAAAGGTAAGCTCATAAATCTACCTTTTTCACGCTTTGTATGATCGGATTAGAGGTATAGGCTTCCAGTGGAGCAAAAACAGGGCGCAAAATTAACACGCAGATTAAAAAGCGAATCAAAGTAACAATCAGGTACATAAAAACAAGATATGAGTATTTGTAGAATTGCCACATTCAATTATATATGTTTTGTATAAAGGATAGTTTTTTCTTCAGGCAAGGGATCAGGGTCAATAAGTAACATTCACCAAGGAAGTGCAAGCAAAGCTCCTGCATAAACATGATATACATGCAGGACTGCCacaaagaaaatctaaatatatacaatttaagtcagaattattaggcctcctgaattattagccactctgtatatttttcccccattttttaTTTAACGGGAAGCAGatttcaaacacatttctaaacatagtagttttattaactcatttcaaatagaagatttctttaatctttgccatgatgacagtacataatattttactacatacttttaaagatactagtatttatcttaaagtgacatttaaaggcgcaactaggttaattgggcaagtaagggtaattaggcatgtcatTGTATAAGAAACtgttatacaaaaaaaattatatatatatatatatatatttgggttgGGCGATGTTAacatgtctaatgtgaaacatcacgatAGATGATGGCATCGTTGTCATAGGTGgaggtaaattaattatttatgaaaaattaattattcataatgaaTCAATTATTTGTTGCCTcggtttcaactacctgacccacgTGGGCTTTGTTTAcccataaaaaaatcacaaataaataaagataagttgcacacaaattaccacctttTAATCACTTTTTCCGGGGGTTTGGGGGGGTTGGAAGCGTTGTTTGGCAgagtgcgcgcgacgtgtctgaagagtgaggagggaTCCGGTGGTGAGGGGTGAGAGGGGTGCGCGACTTATttaaggaccgggagggagacgtgcaatttccgggagattatcattcgtttgcgggcattcgggagtctctatgcatttgcgggatgtctaaatatcacgtttaacaagtatagtgagacgcgatccagcagtacatccttgataaattGTCCAACGTGAACTGCTTACGTGATAGTGTGTTTggttggctgtgtgtgtgtggtcatgtgatgtacaTTTTCAGTggatggagggctgttcagaaatgctagataatATCTGGTGTGaatgtggatcatttttgttcttaaatggcattttattattaagacatattagtgtaaatggggcctaggtgtgtatttttcgcaagcgggtttgcgacgggggcggggCAGAGGATCAGCAATGCCGGATCAGCATTGTGTTGTTGCCGATGGACGATCaggacgatatatatatatatatatatatattgcttaaggtggCTAAAATTAttatgcaaggtgtttctaatgcagtgtctatgtAGCTGAGaataaatttgatgttattctctcctctggcttctcgtcatcagtctcacaattttttttcctttttctgaaagtcttgttaacaccatcatggagtttttctgtcattatttcagGAAATAGgattggaaaaaaatgttttaacctcccattcactgcgctctaaatTTACCCAACCATGATGCCTTcggctactgagaaacccggaaatgtgaaaagggtctaagAAAaagatataaatgaaataaaccatTATTTATCGTTTTCCAAGTCGAACAGTATTCAgatacaaatgtaaaataatacttcatagtctttgttgtataaataattcaataaaattattgATATTTAGGTTACAATTTAGGTTACAACAgaatcaacattgcatatcctgtaaTGTGACAATTGCAGATgctcacattgcaatattgatgctggaACAATATATGATAAGTAGGAAATCAAATAATAACATATGTAAATGTACATACTTTTTACAAGGTATGTCTACAACGTCATCTAAACAAAATGCAATCCAGTAATCTCTGTTTCAGTCACCagaggaaaaaagagaaaaaagaagagCAGAATGATTTCTTATGGATCGTGTGATACAGAAGACtcttgaataaaattaaattgtaaaaatatgaataaattaagcTGGTATGCAAGTAATGCGTATTATAATAGTATAGAATGTTAATTGCGATACTATCTTTTCAAAATTTGTATATATTGTTAaaccatttatatttttttatcatagaATTTAATGAAGAAAAACCCTTCAGCGCCACCTATTTATTACCAGCTTATTTTCTCAATTGACCTCCCATTTTCAGCTGTGTTCGAGAAGCTAATTTTAGCCTCAGCTTCAGAGCcttaaaaaaaagaagcttttcaGCCGTTCAGGTGCCTGAACTTCCACAGCCCACACTTAAAAAATGTTGAATTGACCTCGGTGGCCTGTACCACAAAACAAGCAATGTTAGGTTTTGCTCAAATAGGTTAGAGAAAACACCAACCTTTGCTCATAGCTTTCTAAATGGACTTTCAGTCTACTGTTtgttggcgtgtgtgtgtgtgttctgcactgATAAAGGCCAGGCCGACGCTCGACTCGAGTCGACCTCAGTGAGTCACGGCAATCATTTCTCATAAAGCATCTCGATAACGTCAACTAATCAAGTATAATGGTGCGCTGCGCCTTTCCAGACGCCCACCTCCTGCTCTCCAGGGCCACAGAAGATCCTTTAACCTTTTTTACTTCCAGCAGAAACAGAGCTGTGGCCCCGTGGTCCGCAGGGGCCCAGAGTGTGAGGAGGCCTGTCTGCTTCCCCCTCACGTTAATGAGCAGGGTAATTACTGACGCCATAACCCTGGTTCACAGAGCAGATCTGATTCTGTactgaaccacacacacacacatgcacgcacacgaacacacacaaagACCTTTAATTAAAAAACGCTCTCAGGGACCAGGAGAATGAGATAGaggaagtgcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaacacgaAGAAGTAAAAAATCTACATAGACTTTTGCTGATTACTTCCTACACACACATACTATGGGCtgggcaattaaaaaaaattctaagtatttttcaaatttttatttattttatatatatatatatatatatatataattttttatttaatttttttattttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataggttaattaggcaggttggggtaattaggcaagtcattgtataacgatggtttgttctgtagactatcaaaaaaaagcttaaaggggctaataattttgtctctaaaatgctttttaaaaattaaaaactgcttttattctatccaaaataaaaaaacaaaaaatattatcagacatactgtgaacatttccttgctttattaaacatcatttaagaaaaaaaaaaaaacaattaaaaggggggctaataactctgacttcaactgtatatacatactacatactatactatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatacatacatacatacatacatatcatTATTTAGGGcactttcacatctgtggtttggTTCATTTGGTCCGGCCAAAGGGCAACAAATAAAACACTGTAGAATATTTCTGCCGTTTTGGgtcattttcacaccacactgattgctttgatCCAAACCGGTTGAAAAGAACCAAattgcagtcatgtgacaaaatccacatcactcattggccagatgttattgaatgtatttcctaaactgcttttcgattggtcagaattaacttgagggaaaatgccaatggaactcccgcaAACCGGCAGTCACTTTTTACAATGGAGGGACGGCCTGCACTGGCTGattgtatacaaactatatagtttgtataaatcactttagacaaactatacatttcgagaatgaagcacggctgcattgactttgggacgagggaaccggaactgttAAAATGCTATCTAGCTTCCAGTTTTTGCATGCAAATCAGtcagttcctccactctattccttttagtttaaattttgcaaaaaaaaaaaaataaataaataaataataataataataaaataataaaaaatgtcctATGGTTTCAGTTTTGTCTAACTACATAATAGCCcccaattaaacattaaatatagtTGATATATTCCAAACTCAATATCCACAGCGAACGCACAGCCCTCTTACAGTATTTCCTCAGTTGCGCAGGGATCTGTGGGTGAGTGAATGACAGAAAGGATCAAAACATTTTCACCCCCCAAAGCAAACAAGCTCAGTCGACAATAACGCAGTCAAACTTTTACTCTCTCTATGATTAAAACATGGCGGGCGCTGTTCGCTCACCCCTCGCGTTATTAATGAGTGAAGCACTGGCCTGTGAACACTCGTCCACATCACAGGCCCGATACATCAGACACTTCAAACACCACAATCCACAATTAACTGACAAGAGCCGGCAATTAGTAAAAGGAGCACAGCAACCCGTATATGCAATCTCAGCAGAGGAACAAGCAGCGGCCCTCAGAGAGACCACCACGTGTTGTGCTGATACTTGTTCAACTACGACAGTTTCATCTGTTTAGTAAATCTCTGACTGAGAGCCAAGACTGGGATATTCACtgaatatatgtacatttattcaCCATTTAATCATCAACAATTCATTCCaaacatttattcaattaatgtttatttgtttagcgtATGGGGCAATAATTACTGTTTAAAAGGGTCTTTACAAAAGGGGCATTataattattgcattacaattaaaatcagaaaagttaaggaGTGTATAGGGCAGACATTATATTTAAGCATATTActctgcagttatatagtatattgtccttccaaaaaaaaaaagtatttctttttctgttgaacccaaaagaagatattttgaagaatgttggaaaccggtagccaTGACTGACAATCATATTAGGAAAATAACATACTATGGAAGCTAATAAATATCAGTTTCAGGCCTGTGCAtagactgtccaaagggcatgtgcaggataaattttttgaacTCAAGattggtgttgtcgcgcgcctactgaagggcggtacAGGGGAGGGGGGTGTAtcgtgggggcacttttgatcattttggaagggcactttctatccaagactaaaaagggcatgtgcactgcacaggttgagccctatgtgtgcacgtgcctgatcggtttacattcatttatcaagtaacattcttcaaattatctttttttgGTTTAACAGAAGACACCAAATACAGTGGAAAGCACAATGACACAGATAGTTCACTCCAAATAGTACACTTCTTCATCATTTAGTCACTCCAAGTTAGTTCCCAACAgttatgaaatgtttttttttctgttgaacccaaaagtagatattttgaagaatgtttgaaacataTAGTCATGATTGACAACCATATTtggaaatgaaagaaaaaaaaatcgttaCAGGTTACAGTCTTCGAATCATCTTTTTTTTCAAGCAAATGCAATGGAGAGCATGCAATGGAGATGCAATGGAGAGCTGGTAATAACttgcttaataaactactaattagctgcttattaatagttaggtagtagttgggtttaagCATTGGGTATAACATTAAAGAagtactttaaaatataattattctttataagtgctaataaacagttaaaatctTAATAATAGCCAGGTAAGAAGCCAGTAGTTAGTGCGAACAATTTTTGGAAAGAAAAAGTGCAGATATTGGTCAAGGATTAATCTTTCTAGTGTGCATCCGTGCACAAATGGAGTGTACTTGAGTGTTTGACTGCATGTAAGAACGTGGAGTACACAGTGCTTTGGGTATTAGTCAGCATCTCTACAATGAACAAACGGCACAAATATGATTCGAAATGCAAAAAAACGCCCACGGCATTCAGTCAGCACTGGTTGCATCCATTAGAGTGAAATGCACTTAgacataattagaaaaaaatcaaatatccGAACTGTCCTTAGTCTGACCTCGCGGAAACTTTACTTGAGATCATAAATTCCAATCAAGAGCTTTATAGGACACTCGATAGTTTGATGCTTATAATTCATTACTCAGCTTATTCTTTAAACACCAGGTTGCCAAGACACTGCTGCTGTAGGACAAATACAAAACAAgcatcttatttatttaattttttttattatatcttttAAATATCCCATAGATTTCCCTGAATTTCGATTTAatgaggaaataaaaaataaataaacatctcaTTCTAAAAGATAATTCCCCCATAAATAAATTCTCTCTTCATTTACACACCTTATGCTGctgtattttttcttcttctgtagaAGATTATTTTTTATGCATGGGGATTCACTAGTCTATTTGAAAGcaacataaaataatcataaaagatATGTATATTATTCATGCACGATATTCCTCCTCATGAGATGTCTTGCATAGCTGTGTGGTAAGCAAACGGATGTTTAAGTAGCCTTTTATTGATATTCAAGAACTGGTTTAATCATTTAGGACaaaccaaacaaaccaaaaagaGAGCAACTTTCAAgataaaagcacacacacacacacacacacaaatggtcCTACTTTATATCAGGTGACCATGGACTTGcatcataaaataaatactatgtacttactgtgttcatcatgtattgcagaacacttttAGTGCTCTTGAGGTGAAAAAACAGGTAGGGTTAGGAACTTTAAGGGTTTAAGGGTAAGTTTAGATGTAAGGCATGGTCAAAAGTGtgattacagaaaataataacatgtaattacatgcaggtatttaatcaatcaaaaGTACAATGTGTAACATGTatttaccaacacaatctcacggcaattcgtaactttttgatttagtggctaattcgtttaaattcgtatgatctaattcgtacaatttagtacgatttgctcatcacctaatgatggttggggttaggggtggagttggatgccacgcctcttttttaaaatcatacattttcgtaagACTGAACtccaaatattatatttaatatatttatattatatttaataattttttttttgtaagatcaggctggtatttacacaataagtacactgtgatttattattattttaagtttaagtaCAAagtaaggccacctaatatacagtgggacaaaaacaaaacaaaacatgacttTGAGATTTTATTTAGTATGTTTTAAAGGAATACTACCCTATTTTTTGaaaataagctcattttacagctcccctaAACAGTTGAAAAACTAACTAAAGAGTTTTGATACtattatttaaagtttgactctgTAGTTACATCATTGACTAAGAATGAcggaaaacaaaattattattttttggttccACAGAAGAGAGCAAATGTGGCCGAGAGCACAATAACACtgggatagttcactccaaatTGTACAATTATTCACCATTTAGTCATTCTTAATTGGTTCCTAACATTCATgagttgcttttttattttcgttgaacccaaaagaaggtgttttgaagaatgttggaaaacagcaGCCATGATTGTCATCCATATTAGGAAAACAATCATAAGTCAATGATTTTCGGTTTACTTTAACTTCAAGTTAAATTCATTATGACATTATTCAGCACCTGAAAATCTTTGATTCAGATGAGATGATTCAGAAGTACTTTCTGCTGTTAATGTAATTGCAGAAAAgtaaagctttaaatagaaaaatgattaaaaaaagtaaaagttaaaagtgctcccgcAAGATCAACTGAATGgatcaaaaatggtaaaactcaacagaTTAACTCTAGCGGAGTTGTAAAATTATCCAGCACAGCAGTGACAACTGTACATGCAAGACAAACAGGTTTTGAATGATATGAGGATGAATATATTTGTGGTTAAACTAGCTACTGTCCAATGATAAAGAGGGATAATCACATCGGGCTGTTTGCATGTGTAAGATCCGTCACAACAAAGGGCCTGTCTTCGGATATGCCTGATGGATCAGCATTCTGGGCATTCACTCCATTACCATTTCACAAAAGAGACACGTACTGGGACAAGGGGCAGATTGCGCTCCTCAAATGAAGAAATATACGTCTGTCAGCAGGGGAAAACACTGGCCTTCTGTGTTAACCAGCGCCTGACCTCCACAGGACCTGTCTGGAGAAGAGCTGTCACACATGTGCGTGTGCTTGCTTATTCATACTTTGTCTTCTACCGCAGATCTGGCAAAGGGGGAATTGCTTTAAGacgttattttttatatttagtaaaaaaaaggagaaaaaagatCAGAGGTAaaagaccattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattcattttctttcagcttagtccatttattcatttattccgccaacttatccagcatatgtttaacacagctgatgctcttccagctgcaacacagcactgggaaacatccacagacactcattaggtaaaaaaaaaaactagttttcctcaaaataaatgatcaattaatgattaatgatgtttatttcataattatttttatattcctTTTAATCAACtttgtattatttacaataatagtttcagattttttatatttttgtcctgtttttttttctttttttaaatattaagatgTTCGCTAAATATCTGAGCTGCTATTCTCCATATAAACAAAATTTCCCAAAATCTTCAATTTCCCCCCCAAAATTACTAACATtgtaaaagttttattatttataacaattacttttctataattattttaatcatttgttttttgataaatCCCCTTTTTTCTGAATTCACTTTTTGACCACCTGGACTTTAATTGAAtggttaaataaaactaaaaacatgtatttatgcGGGATATGATGTCCATATTTTCCTGCATAGACGTTTTAAGTTTAAGAACTTCATTAATCCCACCAGGGGCAATTAAATTAGGGCAGTAGCATCatgacacaacaaacacacacagtgctcagcataatttagtacactccattttgaaaatgaatatttttctccatttctcagtaaatataggcaatgctTTTTGGTTCatataaacaaaacagaattattaaacagatatattaattaaaattatattttagtcaccaaacatattgagAAATCGATCGATAATATGATTAAATTCAaggaaaattttgaaaaaaaaaattactacctataaaatttcaattaaatgattacattttttgtttcttttcattttttcttttccctttttaagttggtattaaatttttttatagcatatacatttgggtgtactagtttatggaccattatcgtaagttattttgttagataagctccagatttggcttcagtactgactaatctaatgtatatgcacaaacataatattgtatagcttcctattaaaaatataattttaaaatatagatcTTTACTTatatatgcagagcactgtagagacaaatcacttacaaacaatattaaaaaacacaatccaGCATGCTTTATAATAATTCATGAATATAACAATGCTTCTAAGAAAAAGATGTACCCGCACATGTGCAAAGACAGGTGCACACACACTCCCATACATCAGAAATAATTACCAGTCCAGATCTTTAACTTCATTTAAAAGGTTTCAAGTCATAAATGGAACATAATCTAAGTATGGCTTCTAAGAAAAGGACAGAAATTATGTGATGTACATTACACACACATGTGCATAGACAGGTGCACACACACTTCCACATAGCCAAAACAAGGATCAGAGCTATTTACCAGTCCAGATCTTTAACTTCTTTTAAAAGGTTTTAAGTCTTGAATGATACACAATCCAAGTACAGCTTCTAGGAAAAGGGTGGATTTTAATGGATGTACAAAACCGTGCAAagacagatgcacacacacttcCATCCATCAGGCATCAGAAATAATTACCAGTCCAGATCTTTAACTTCCTTTAAAAGCTTTCAAGTCATAAATGGTACATAATAAAAGAATATCTTTTAAGAAAAGGATGGATTTTAAGCGATGTACACACACATGTGCAatacaggtgcacacacacactcctacgcataaaaaataataactagtCCAGATCTAtagctttctttaaaaacatttaagtcaTAAATGGTGCATAATCCAAGTACATCTTCTAAGAAAAGGACGGATTTTAAGCAATGTACACACACATGTGCAAAGTCAGGTGCACACACACTCCTACGCATCACAAATAAGCTTAtaatcacacgcacacacacatgcgggGTCTATTTCTGACAGTTAATATGAACAGATGTGGGCCTCCTCCTCTGCCTCACACCTTATATACACAACACCATTTTCCCAGCACCTGGTGTGCTGTTCCAGATTGTGTGCGTAAGCTGTGATTGAGGCGGATTTCTAAAAGAGGAGGGAATAGGAGTCATTCCAAAGTTTAATCAAAGAAAAAGAGTGTCTTCATAGAGTCGACTATCCTCCTAAACATCTGGGCCCCTGTACGGCTCCCAACAGCACGCCGGCTGCTTCATATGAGCTGCAACTCTCCACGGTCTGGAGCCTCCATATGAGACAGTACAAACAGATGAATTAAGAACAGAGAAAGCCAAGAGAGGAAGATGAGGACATGAGACAGAAGAGGCGAGTGGGGAGAAATGCAGGGGATtatgggagagagaaagagaaagagaaagagagagagacggtgtgaaaaaaagacaacaaaagcGAGTGAGAATGAAAGAGAGGCTGGGAGGAGGAGGAGAGCGAGTGTGTGCAGAATAGCAGAGCTTGTTTAATTCATCAAAACTGGCTTCATAGAGAGTTGTAGATTTAAACTTTAATGAAAGAGCCCTAAAGTCCTGATGTAACAAGATGAAGAGAGCGGGAAAATAAAACAGGGAACTCAGCGAAAGGAACACGCGGGAAAGACTGGAGAGAAACAATTCCTGTCTGTGTCATTACTGTGAGCTCCGTGGGGGAGAGGAACTATGCACACACACGCTAAAAATTCGGTCAAAATTAATTGTGTCCACTGatggcagcatttatttgaatgcACTGTCTGCAAGGTATTAGCACACAGCTCTGGAAAATATTCACCTGCCTATTcaccatctgtccatccatccatttacacCTCAatgtatccattcatccatccacccgtctACTTATCAATCCATCTATTGTCCACCTGTCATTTATCAGTCAATTCATGTATTGTACCTATCCACCTGTTGCTTAACTATCCATCTATCAATGGATCTATtaaccatccacccatccatccatccatctgtctattgaCCAGTATATTTGTCTGTCATCCATCCGTTCGTTTATCTgcttatttttccatccatccatccatccatcagttcattTGTGTcatccatcctttcattcatttgtctatttttccatccatccattgatcagTACATTTTTCTGTCATCCTTCCATTCATTTGTCTGTCTAtttttcaatccatccatccatccattttattgtatatcatccatccattcattcatctgactattttccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctgtccgtctattGACCAGTATATTTGTCTGTCATCCATCCGTTCGTTCATCTgcctatttttccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccagcagtTCATTTGTGTcatccatcctttcattcatttgtctatttttccatccatccatccatccatccattgattagTACATTTTtctgtcatccatccattcatttgtctgtctatttttcaatccatccatccatccattttattgtatatcatccatccattcattcatctattttccatccatccatccatccatccatccatctgtctattgaCCAGTATATTTGTCTATCATCCATCCGTTCGTTCATCTgcctatttttccatccatccatccatccatccatccacccacccacccacccacccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccattttattgtatctcatccatccattcattcatctgactattttccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccgtctattgaCCAGTATATTTGTCTGTCATCCATCCGTTCGTTCATCTgcctatttttccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatccatccatccatccacccactcagccatccatccatccatccatccatcaatttattgGTCCAACAACCCATCCATCAGTTTATCTATTGATTTAAAATTGTCACCACCAATCCATCCTTCTGTGTATTTGTGCATCGGTCCATCCCCCATCTACCTAGTAGGTaccaatttgtaaatttatgcATATGGATACATCAGTTCAttgtcaattcattcattcaatgattCATCCATTATCCTCAGTTTAGTAACCATCCATCAACCTGTTTATTGTCCATTCATGCATTGTCCATTCATCTATCATCTGAAAATCAATCCATCCAGCTGTCTATCCATCCTCCAAACTGTCTTTTATCCATTTACTGTATCTATCTCTCCACCTATCCACCCAAtaatccatctgtctatccaacTATCTATTCGTTCTTTCATCTTCTACAcatccaaccattcattcatccttccatctatGAGGAAGGATGAAAACAGGATTGAAAGAGCAGCTGATGTGACTCTTTCCTCTGATTTCTAttcatctctctctctatatatctaTTGATTCTTCCACCTTCCCATTTATAATTTACATAATAGGTAAAGTGTTTATGCAGAAAATACTGACAGTCACAAATTAAGCAACCAGCTAAACAGAATTATGGTCATTTTGTGGAAACTCTTTTCTTTGTAGTGCAATATTACTCACAAAAGTGTTGGAACTGCTTAGTCAATTCACCCCACAGTCTGTGTCTCTGTGGTTATCCGCTCATCCTGTTTCAGTCATTGTTATGAGTTCAATGTGTCAGCAAAACATGCTCGCCTGCTGTGACCGAGGAACTCAtcactatgtgtgtgcgtgtgtattttaAGCCAACATGCTTGTGATGGAGGCAGTATGCAAACAAGCATTCACGCAGTTTTATCAGCATCTCTGCTTATCACTCTGCTTGGGGACTGTGGGCCGTTACACTGCGTTTATAAATTCGTTTTGTGCACTGTCAGTTCTGCACATATTCAATTTGACCTCCAAATGATTTTGTCCATTACTTGTGTGCAAAAACAGACACCGACCCACATATTCTTGACAAATTACTTTCTCTATTGGTGTTTTCTGTGCTATTACACTTTACTGGGTTTTAGTGCTTTTTATACCTAAATAACCTGCCATTCTGCCAtcattgcatttttttatgtacatataCAGCTATGGTCAGTAgcggaaagagtactgaaaaatcatacttgttAAGAGAACTATTACATGaccaaaaatgtagtgtgagtaaaaGAATCTATTGTAAAGATTACTTAAAGTATGTACTCAAAAGCACGGAGTATTACGCcgtaaaaagctgatgcgtttacatgtattttgtggatgtgtgtaaacgtaacattctgtagtgcatttagttattacccagcaggcacacaacatcattagatgttaacattaagttagatttaggttttgatgtcaggtgaccaaaattcaatgtccagctattgtctaaggacaacattattttgacgtccaataacaacatcaaatgacgttgatatttggttaattttaggttgtgttggaaagtgaccaaaatccaacgtcgagccaacatcttaaccaACGTTATATTgaggtcaaatactgacatttatttgtcaggtttggcaaccaaaatccagtatcagatagacgtcatagtggtaacgtcgacACAACGTCAAGCCGTAACATCATtagcgttgatatttggttggttttaggttgcgttggaaagtgaccaaaatccaacgtcaaaccAACATCTTAACCAATGTTATATTgaggtcaaatactgacatttatttgtcaggtatggcaaccaaaatccagcatctgatagatgtcatagtggtaacctccacacaacgtcaagctgtaacatcattatcaTTGATATTAGGTTGGACGCTGGACACAGATATCGGCCTGATGTTGgattctgatgtcaacctgattttcatttccaagcaaAATGAAACGTCGCCACGTACatcgtcaatctgacgtcatgttgatgtcttgtgcctgctgggtgtttaagatGAAAAAGCATAATTTAACTTTGGTTCAaactttaaaattgtatttaatctaaataaaatttaattaactaaaaaataatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacacacacatttttttttttactttggtacattgtagatttttttgttggaatgatcttttttttattcttatattaCATTCACATGTAATTATTTAGCAGAcgtttttgtccaaagtgacttacaatttaggcattcagcgattcaacaagaagtaCTAATTCTACAAATGTACcattagtgctcagagaattaggtttatttatgtatttattttgataaagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagatgtacaATGCTTCATAAatgcactatttatttatttattttaatatttttattttcatcatttatttaattcatgtttatttaaagaGCTTATTACAACGTAGattgtttattgattgatttattgcaaAAATGAGTCTGGTGCAaatgtgtcaaaaaaataaaaaaattaaaataaataaaacgggGGATGAGACAGCTTACAAAATTGTTTGTTAAGCagatagtctactaatactcaaatggaccatcaaaataaagtgttaccactttTTTATAGGGGGTTCGTTAGGTAAACTGAAAACAAGAAACCATCATTTTTCactttccaaaataaaaatatgctttGAATGAACGACACAGTAGTTTCACTTTTCTCAGTGCAGTGTCCATGTTAGAAATGACATCTACAcactaaattattaaattaaattattggcAATTACATGCAATGGCTAAACCTAAACATGAAATTTTacattaaagggattgttcaccccaaaatgaaaaattactcactatttactcacccttcatttgtttcaaagcttTATGAAtatctttcctctgttgaacactaaagaagatataatgaaaatgatgaaaaccattgactttcattttaagaaaaaaacggtcacactttacaatgttcattagttaatgttaattaaagcatttactaacatgaacaaataatgaacaatacatcgaCTATActgtattagttcatgttagttaacgttagttaatgaaaatacagtagtttattgttagttcatgttaactcatggtgaattaaccaatgttaacaagcatggacttggatatcaacaatgcattagtaaatgttcaattatgattaataaatgctgtacaagtgttgttcatgattagttcatgttagtaaatgcattaactaatgaactttattgtaaagtgttaccgaaaaaactaataccatgaaagtcaatggttacaggaatCCAGCTTTCCTATTGTCTTTAGTATTCAATAGaagaataaactaataaaagtttggaacaaatgaatgatgaataaataatgacagaacttttgcttgaactatctctttaataatacaaatgtacaaTTAGTGACAATGATTttgcacaaataataaaacagtCAACTGAAACAAAATCACAGCGTGCTTATTCCCCACCTCCAAAAACCCTCCCTTCATTTTGCAGCCCCTCTGCATTCATTAGCTAGTTGAGTTTAGCAGCTGTCCTTAAAAGTCTCCATGCAGCATCCAGGGCCTGTAATGATGCACAGGTTGCACcatctgtgtgtcagagcccctGTGCGGCTATGCTTCTCTGTGACTCATCGGTCTGCGCCATCACTGTTGGCGCTGTCGTACGCATCATCATTCTGCGCCAGGACTCCGCTGCATGCCGGCATCCCATACATCTTCGACCATCATTTATTTGGCACCAGGCAATTAGAGGACCCAAAAGCCTCAGTGTGGGGTAGGACTAGGTCTCCCTTTTTAATCACCCTCCTTAATTACTTTCTCTGTTCCGTGTCATAAGCCGGCATCTGCATTGAAAATTTTTTTGTATCTTCAATTGTACAAAGCAGAAAACGAAAGCCTTTCGGAGTTGGGGTGCTGTCCAAAAACATTACAAGGTTGTCCCATGAGGAGCCAATCCATCAAAGTGATTTTTCTCTCCGCCTCCACTCCAGCCCTCTTCTCCTTTGCAACGTAGTCATTTTCTTCTCACTGGGAGTGACATTGATTCATAAAGTACTGTGCTGCAGGTGCCAAGGCACGCCAGAGTTTTTTTTTGGGGTAGTGTCGTTGAGTTTGAGACTGTGGCTCTCTCCATCTTCTCTGCTGGAGCCAATAGCGTTTAGTCGTCCAGTATTAGCAGGGGATGTGTCATATGACGAGGCCAATAGGTCAAGGCTTGAGGTTTTTGGAGAGCCGTGACCTTGAGCCGCTGTGCTGATGCAGTGAAAGGCCGCCGATGATCCTCCGGCTCTGAAGGGACTTAACCGGGTTCCAAGGGTCTGACAGGAGGACAGGTCTAATCAGAGAATACAGCTTAGAAGGGTAAGACAGCATAATCTGCTCATAGCTCACTCTGCAGAGAGTGGTAATAAAGCTACGGGACTGACACATGGTTTAGTGCCATTGGCACATGGGGGTACAGTCAGCGTGGATGGAGGAAGACAGTTGGGGTCATGTGACCATGGAGCCACTTTATCAGATTTGGGCAGAGGGGACGTTCGGGAAGGTTATGGCTTACTGTGTGATTGATAACCTTGAGGGAGATTCACTAACATGAAAGCATGTCAGAAAGGCTGTGCTTACATGATATTTAACCTGCCATGGCATCTTTATATGCACATTTCATTTCATAAagtctaaattcattcattttcttgtcggcttagtacctttattaatccggggtcgccacagcggaatgaaccgccaacttatccagcaagtttttacgcagcagatgcccttccagctgcaacccatccctgggaaacatccacacaatcacacacacaaacactacagacaatttagcctacccaattcacctgtaccgcatgtctttggactgtgggggaaaccggagcacccggaggacacccacgcgaatgcagggcgaacatgcaaactccataaagtataattgttaaacaatattttcaaaacCTGCTGACATTAGCCACTTTGAaatttaattttccttcggcttagtctctggtttatcaggagtcgccacagtggaatgaaccgccaactattccggcatttgttttacatagcagattctcttccagctgcaacccagtactgggaaacaatctaaatgttgactaatgaaaacAAATTTGAAGTGTGAGTCAAGTTGGGCACAAATAGAAATAAATCATGATAAATTGAGTGAAAAAAGTAAGCACTTGATAGGAcaaattcaacccaggctcattcagaaaatgtaccgctatatacatttctggagagcaccgaatacgtcctaggagctacattttttgcagttttagttttttcgCAAATCCATTATaggccgctgtgtacatttttcagatgtcaaatttcaCTTATGAGTGAAACTCGCGCATGCTGTTCACACGCAATTGCACCACAGGCTGCtgatgactgactgacccaccctcctccttccctaaacccaaccaatagtgttttcaaaaccaccgATTTACCTGCCTACCAACtgtcctaaacccaactgactgttttaaataacaattctgaatgaaaaagccctcacctgatttttaccatgttttcagattttacaacattcttaccctgttttttacttgtttattttatttttttggcttctgtttttgtcttagccACTTTCTGGACTCTAACCCTATCGTCATGGTCAACAAACTGGATTCGGGGgtgagcggtcagctggtaagcgcgaaaaggaacggcatcatactgcccagtagcattcattttaaagatgaaatgcagccatatgtacctctggctacatgatTAGCAAAGtccggaaatgtatatagggcaacttttccagaatgagcctatgatagacaaattctaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacatacatacagatTCAAAAacgttttttaatttaaaataaaatatagtcatTCAGAGaaaatttatttacagaaaaaacaactggtcagaaaacaaatttaaaaaaaagttctaaaTGACAACATAAATTGAACAATTCAGTATTCAACAggataaaacaaacaagaaaaacaatgttttactgTAAATCAGAAATGCCGAAAAAATTAAATGCTATCTTATTTaatctatacatttatttataaaaagctATGAAAAACacttaatatacaaaatataattaatagaCATTAGTCTATTAATCGGCCATATCAGTCAACATTGTGATGTGAAATACCGGATACCCCTTAAAAACTGCACAGATCTACAAAAGCATTTGATTGCTAccctaactgtttatgctcatttaagacaaaattagttgtgtttaaaagaaaacccaccaagatcgacatgtttagttattaattttataataataataattattattatgtgtatattttaGTTCAAACAAGCACCCAAAACCCATACtgtgtacagaatccatttgggaaagagcgtctatttatcactatggagcatgtCTGACAGACCCGCACCGCTACATGAAAAGGATTGCATAGGGGCGCCTGtgatgaaaaggaagggaatctcgccgtttttatatttaattcaaaatgttttcctgcctaaataaaatgaaagaacaggttcacatttaagagcaaggggcatcCCCTGGTGATTCGGCAGTATGGGTTGCGTAAAGGGAAGATCAGCTCTTTAaagtttattgccacccttcatagaatgattaaaaatacagaagaaatacgggaaaatagcTTAACCGGACTGATGATAgagggatagaattgtaaaatatgggagaatcccaggACACACGTAAGGGTTGAGAGGTATTGACATGACTATTTTACAGTTAATGtaaacaatactgtaaatacacatactgtacagcaagATAGATGGTGCTGTAAATATATTTAGttgtaattaatttacagtaagcTACTGGTAAGTACTCTGTTACTGTATATATCTAAAGAATACCAGAAAAATGTAAGTGCTATCTTAATAtgttctatatttttatttatataaagtagtaaaaaaaaatacaaaatataattaatagaCGTCAAATTAGTTTGTCAGCTTAGAATTCCACTGTTCACAGACCTGTATGAATTTCCTGTCGCAGAATGAAAATGATGCAATACACAGAAAAAGCATCAGCTCCACACACCTAAAGTGAATGTTTGGCTCTTCGTGATGTGCTAAAAGCATTCTGTCTTTTTCAggatgtgaaaaaaaaagagtgtgaTATGAAAATCGCCCCAACACATCCACTTCATCCCGATCATCAAAATCACTTGAATGCACATCATGGTATAATTACGACTACCCGACTCATAAGCTGGAGCCTCCCAGGAGGGCGTGAAGGCAGCGGCGGCTCCTCAGCATTGTTAGCGCAAATGCTAATGCAGCATATTAATGAGAGCTAAGCTAGCGCTCCTCTCGCCTGCTGATCTGACTAATAATGGACCCCAGATATCAAGACTTCGGCGTCCACAGAGACTGACAGTAAAACTAAAGAGAAAAAGGAAAAGAGTTAACAGAGGTTGACACGTCTGACGTCCAGAGTTGTTAAATTACTTTCGGATAGCAGGAAGAGTGTAAGCAAAGGGCTGCAAGTGACGAGACCAGAGAAAAAGCGAGAGAGACTGAGTGGGTCTGACATTGTTCTGCCATGTGGAAAGGTGAAGAGAAAAAGAGTGCGCAGAAAACCAGACCCAGTTTGAGATGAACTTCACAGAAGAAGTCCAACATTTAGAACTGAACACTGCTGATAAGGTCAGCGCTAGCTATTAAATAAACGTCCTGCAGTATTGATAAGTTATCAATAAAACATAATGCTAGATGCGCACACCAGCAGTGGTCTCAGACACAGACgaacagacatgcacacacttgCTGGGTTTTCATGTGATATGGGGACCTCCCATATAAAGGCTGCACAAAATATtgtttcatcatcattattgcAATGtgccacaatagtcacattgcaggatctgcaatgttcaAATGGGATTATAGTTGACATTACAGTTCAGAACATAGCGAAGTCATTTCTGTTTTTAAGCTTGGAGTGAAATTAATTATTTCGCATTTGTTTTTAATGCCTGTGCAAGCATTTCAAGCTAATTTAACCTTTGACTgtctgctctaccaaatggttgaccatgttttgactgtttcAAATAATGTCTTTTAAAGaattactgtttaaaataatggattacacta

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00039359 True 21306 lncRNA 0.37 1 12161079 12182384

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_018742 NA coding upstream 81140 12076692 ~ 12079939 (+)
XLOC_018741 zgc:162344 coding upstream 86869 12036238 ~ 12074210 (+)
XLOC_018740 aqp7 coding upstream 139486 12010505 ~ 12021593 (+)
XLOC_018739 mlnl coding upstream 179556 11969603 ~ 11981523 (+)
XLOC_018738 ubap2a coding upstream 205766 11916788 ~ 11955313 (+)
XLOC_018744 NA coding downstream 161234 12343618 ~ 12347702 (+)
XLOC_018745 CR293531.3 coding downstream 345736 12528120 ~ 12528236 (+)
XLOC_018746 CR388176.1 coding downstream 780338 12962722 ~ 12962838 (+)
XLOC_018747 NA coding downstream 904661 13087045 ~ 13092450 (+)
XLOC_018748 odf2a coding downstream 945358 13127742 ~ 13148318 (+)
XLOC_018732 NA non-coding upstream 583511 11565880 ~ 11577568 (+)
XLOC_018727 NA non-coding upstream 655195 11503197 ~ 11505884 (+)
XLOC_018721 NA non-coding upstream 903903 11254561 ~ 11257176 (+)
XLOC_018720 FO393393.1 non-coding upstream 908453 11252511 ~ 11252626 (+)
XLOC_018753 NA non-coding downstream 1152168 13334552 ~ 13336689 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G48119 NA non-coding CI01000006 null 12143871 ~ 12157706 (+)