G48119


Basic Information

Item Value
gene id G48119
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000006
NCBI id null
chromosome length 13024002
location 12143871 ~ 12157706 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU54733
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU54733 True 13793 lncRNA 0.39 2 12143871 12157706

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000006_12092807_12095434 NA coding upstream 48203 12092389 ~ 12095668 (+)
CI01000006_11888383_11923287 NA coding upstream 219481 11888192 ~ 11924390 (+)
CI01000006_11784520_11803562 NA coding upstream 340021 11782031 ~ 11803850 (+)
CI01000006_11751944_11752854 NA coding upstream 390653 11750854 ~ 11753218 (+)
CI01000006_11704767_11714559 WDR34 coding upstream 429210 11704767 ~ 11714661 (+)
CI01000006_12176092_12189504 NA coding downstream 18386 12176092 ~ 12189828 (+)
CI01000006_12219317_12222975 TPGS2 coding downstream 61611 12219317 ~ 12223117 (+)
CI01000006_12230746_12235389 NA coding downstream 71841 12229547 ~ 12235525 (+)
CI01000006_12242654_12249350 NOP56, NOP56.L coding downstream 84948 12242654 ~ 12249555 (+)
CI01000006_12298229_12304430 UB2R2, CDC34, UBE2R2, UBE2R2.S, CDC34A, CDC34B coding downstream 140091 12297797 ~ 12304603 (+)
G48113 NA non-coding upstream 25851 12103183 ~ 12118020 (+)
G48146 NA non-coding upstream 138368 12005256 ~ 12005503 (+)
G48067 NA non-coding upstream 161765 11981856 ~ 11982106 (+)
G47948 NA non-coding upstream 266820 11876815 ~ 11877051 (+)
G47916 NA non-coding upstream 305680 11837752 ~ 11838191 (+)
G48214 NA non-coding downstream 70341 12228047 ~ 12228254 (+)
G48086 NA non-coding downstream 101789 12259495 ~ 12261344 (+)
G48101 NA non-coding downstream 150436 12308142 ~ 12349571 (+)
G48075 NA non-coding downstream 193056 12350762 ~ 12571161 (+)
G48251 NA non-coding downstream 339648 12497354 ~ 12500200 (+)
G47318 NA other upstream 505619 11624267 ~ 11638252 (+)
G47159 NA other upstream 622168 11416229 ~ 11521703 (+)
G47145 NA other upstream 1632065 10485358 ~ 10511806 (+)
G46652 NA other upstream 1984620 10156579 ~ 10159251 (+)
G45416 NA other upstream 3309174 8818814 ~ 8834697 (+)
G48094 NA other downstream 119914 12277620 ~ 12279541 (+)
G48081 NA other downstream 219300 12377006 ~ 12384827 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_018743 NA non-coding NC_007132.7 CM002905.2 12161079 ~ 12182384 (+)