XLOC_019175


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_019175
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 43132219 ~ 43134435 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00039495
GGGCTGTTTATTATTTAaaccatataatttatttaattttcgaCCTACAGTGTCAAACACCTGTGAAATAATCCTACCTGGATATTAATAAGGTATTTTGCACTATAAATTCATTAATAAGATATTTTTCACTGTAAAatcatttaacagttttattgtgGTAGACAATCTGGTGAGGTATTTTGCACTGTAAAATCGTCCTGCCTggttattaataatgtattatgcGCTGTAAAATCATCCTATctgattattaataaaatattttgcatcATTAATAAGGTATTTTGCACTGTAAAATCATCCGTTAGTTTATTTAATTGTAGTATAGACAATCTGATGAGATGTTTTGCACTGTAAAATCATCCTACCttgtaattaataaatgtattttgcactgtttaaCCATTAATAAGATATTTCGCACTGTAAAATCATCTACCAgtttatttaactgtaatatagaCAATCTGGTGAGGTAATTTGCACTGCAAAATCATTCTATCTGGTTATTAATGAGGTATTTTGCACTGTAAAAGTATCCTATCTGGTTATTAGTAAAGTATTTTGCCCTTTAGAATCAATAATAAGGTATTTTGTACTGTAAAATCAACTACCAGTTTATTTAATTGTGGTATAGACAATTTGATGAGGTATTTTATGCTATAAAATCATCCAACCTGGgtattaataaagtgttttgcgctgtaaaattattaataagaTATTTTGTACTGTAAAATCACCCTACCTGGTTATAAATAAGGTATTTTGCATCATTAATGAGGTATTTTGCACTGTAAAACCATCTACCAGTTTATTTAATTGTGGTATAAACAATTTGATGAGGTATTTTGCACTGTAAAATCATCCAACCTGGTTATTAATAGgatattttgcactttaaaaatcattaataaggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTACTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTTATAAGGTACTTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTAATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATAATCCTGTCTGGTTATTAATAAggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATATGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTTATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATATGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTTATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTTATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACTCTGTAATAAggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATGAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACACTGTAAAATCATCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAggtattttacactgtaaaatcatCCTGTCTGGTTATTAATAAGGTATTTTACACTGTAATAAGGTATTTCACA

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00039495 True 2113 lncRNA 0.29 2 43132219 43134435

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_019174 CU459082.1 coding upstream 72854 43059248 ~ 43059365 (+)
XLOC_019173 CU462980.1 coding upstream 146578 42891618 ~ 42985641 (+)
XLOC_019172 NA coding upstream 244852 42877788 ~ 42887367 (+)
XLOC_019171 CABZ01024683.1 coding upstream 291148 42840956 ~ 42841071 (+)
XLOC_019170 sh3pxd2b coding upstream 352137 42717424 ~ 42780082 (+)
XLOC_019176 zcchc10 coding downstream 36578 43171013 ~ 43177239 (+)
XLOC_019177 aff4 coding downstream 44382 43178817 ~ 43246873 (+)
XLOC_019178 FP085421.1 coding downstream 59188 43193623 ~ 43272711 (+)
XLOC_019179 shroom1 coding downstream 119103 43253538 ~ 43310488 (+)
XLOC_019180 sept8a coding downstream 194250 43328685 ~ 43374893 (+)
XLOC_019167 NA non-coding upstream 454693 42663889 ~ 42677526 (+)
XLOC_019181 NA non-coding downstream 241798 43376233 ~ 43380146 (+)
XLOC_019184 NA non-coding downstream 379596 43514031 ~ 43515964 (+)
XLOC_019186 NA non-coding downstream 432517 43566952 ~ 43575215 (+)
XLOC_019187 NA non-coding downstream 511438 43645873 ~ 43647249 (+)
XLOC_019190 CR792441.5 non-coding downstream 571173 43705608 ~ 43705684 (+)

Expression


Co-expression Network