G93412


Basic Information

Item Value
gene id G93412
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 83668523 ~ 83701424 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU102874
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>TU102875
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>TU102873
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GACTCTCTGGAGACATGATGATTATTTCTACATTTTCTGtgtggtatttatttatttttaagaaaAATATTTGTTGCATCAAAAGAGACCCCTTCAAATTGTGATTTTATTCAACTAATACTAGCAGTACGTCTATAGTTCTACCCTCTATAAGTTATTCAACCTGCATTTACAACCACTGCTTTTACCCGATCAATACAATGGATACAAATGATACATCCGTTTATTTTAGTCAGAGAATTATTGAGATTTTCAAATATTAACATTTACATGATTGATAAATTAATTGAAATTATAGATTTTATAATGATGTATAGCTGGCTCCTATAATTCTCTCTTTGAGAGAACATACCTGTTGACTTGTTGATGTTGACCTTTCATGTTTCACCTCAGACTTTTATGTACAGGGCTTTGCTTATCTATTTGATGAGAACAGTTTTTACTGCCAAGCTCTATAATAACTTTGTAACGGCGCCCTTCCATTTTCCCCAGCATTTGCACAATTCTGgcaactttccccaaattccacCCTTTTCCAGATGTCCCGGTTGGAATATTCacagatttctggaaaacctgaccATTTTGGGAAAGTTCCTGGAATACTGAAACCACTAAACCATACTGTGTAACGTTACTCTGGCAGAGGTCTGTCTGTTCATTCAAAGTCATTTAACATGTAAGAGAAAACGCATTTCTCCTGCTGAACATATGTAGCTTAAACAGCCATTGATTGAGGAAAGCCGTTCCGTCCCCCATCATCAGAATGATAACCCTTGTGCTGAGAAAGTGTTACTTGCATAAAACTACAGTGCTTTACTACTGACTGGACTTGAACATAAGACTGTTTCCCTCCTTCATATATCATTCCACATGTTTGTCTGTGAGTTTACCTTTCAATAGTAACTGTATAGAATTTTGGTAAGAAAAAAATGACTTAtgttttaaaaaaagaaatattgatgtgttttgatttgtttcattTCCCATGTTTGAATAAAGTATGTAGATTGAAAAACCAACCAAATAAAAATGACAACCTTT

Function

NR:

description
transposase

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU102874 False 1586 lncRNA 0.58 3 83668523 83701424
TU102875 False 5926 lncRNA 0.41 5 83668523 83675952
TU102873 True 6044 lncRNA 0.44 3 83669553 83675952

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110530763 LOC106577187 coding upstream 852 83511117 ~ 83667671 (+)
LOC110530741 LOC106577189 coding upstream 184512 83452248 ~ 83484011 (+)
LOC110530670 NA coding upstream 226392 83407651 ~ 83442131 (+)
LOC110530624 cssa18h10orf11 coding upstream 752112 82456299 ~ 82916411 (+)
LOC110530588 LOC106577200 coding upstream 1489446 82172076 ~ 82179077 (+)
LOC110530841 LOC106613168 coding downstream 20435 83721859 ~ 83798056 (+)
LOC110530850 LOC106577251 coding downstream 97007 83798431 ~ 83817516 (+)
zgc:110319 nfu1 coding downstream 139332 83840756 ~ 83851899 (+)
LOC110530876 LOC106577249 coding downstream 151142 83852566 ~ 83889994 (+)
LOC110530893 LOC106577247 coding downstream 202358 83903782 ~ 83951597 (+)
G93469 NA non-coding upstream 61617 83605746 ~ 83606906 (+)
G93456 NA non-coding upstream 141001 83526395 ~ 83527522 (+)
G93445 NA non-coding upstream 163474 83504333 ~ 83505049 (+)
G93444 NA non-coding upstream 164659 83503639 ~ 83503864 (+)
G93440 NA non-coding upstream 167357 83500922 ~ 83501166 (+)
G93512 NA non-coding downstream 41759 83743183 ~ 83743415 (+)
G93513 NA non-coding downstream 42314 83743738 ~ 83744223 (+)
G93519 NA non-coding downstream 62792 83764216 ~ 83765131 (+)
G93522 NA non-coding downstream 70950 83772374 ~ 83772921 (+)
G93362 NA other upstream 334947 83333266 ~ 83333576 (+)
G93204 NA other upstream 578591 83088531 ~ 83089932 (+)
G92575 trmt13 other upstream 1486727 82180946 ~ 82181796 (+)
G94463 NA other downstream 343887 84045311 ~ 84048149 (+)
LOC110532822 LOC106577256 other downstream 681333 84373236 ~ 84410052 (+)
G95702 NA other downstream 1438716 85140140 ~ 85141006 (+)
G95821 NA other downstream 1533397 85234821 ~ 85235394 (+)
G96133 NA other downstream 1936323 85637747 ~ 85638055 (+)

Expression


Co-expression Network