XLOC_020649 (slc25a34)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020649
gene name slc25a34
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 184670 ~ 188112 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00040847
gtgatgatgatgatgatgagtggaTCTTCCTCTTCAGTGGATGTCAGTAATGTCTGCAGAGGAAGTGTTGAACACGTGATGCACTGCTGAAAAcacacgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgctgcagtcATGCAGCTGATGAACTCTGCATTCTCGGGTCCGTCCTCCCCGACGCCGGGCCCCTCGCCCCCCCGCCCGCCCCTGTGGCCCCCGCTGGACTTCGGGCTGGGCGCGCTGGCCTGCTGCGGCGCGTGTGTGTTCACCAACCCGCTGGAGGTGGTGAAGACACGGCTGCAGCTGCAGGGGGAGCTGCGGGCGCGGGGCTCGTACCGCCGGCTGTACCGCGGCGTGCTGCAGGCGCTGTGGGTGGTGGGCCGCACCGACGGGCTCCGGGGCCTCCAGAAGGGGCTGACGGCGGCGCTGCTGTACCAGGGGCTGATGAACGGGCTGCGCCTCGGCTCCTACGCCCAGATGCAGGCGGCGGGGGTCACTGACGGACCCTGCTGCAGTCTGATAGCCGGAGCTGCAGCCGGAGCACTGGGGGCCTTCATCGCATCCCCCGCGTATCtgGTGAAGACGCACCTGCAGGCACAGACAGTGGCGGCCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGAAGCAGAACacgtaaacatccatacacaccgagagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcgtaaaCACTGATCCTGCGCTTCCTCTGCGGTCTGATATCTGAGCCCGAGTCCGGCTGCTTTGCTGTCAGCACTCAGGGGGAGAGagcaacacatacacacacacacacacacacacacacacacccgtcaGCGGGATGGTTGTACACAGAATACTGCTTGTCTAAGAATACAGCGCTGTGATAGAGCCGCTCTTCTGCATTACAGCAGCTCATAGTCTGGGTCTGGGGGTCTCCAGCTGCTTCAGTACAGGATTGACTCTCTCACTGGGGTTTTCCCATGATGTATTTTGAGTGCAGCATTCACTTCACTGACTCCATCATCTTACATCAAACACCTTACACCCTATTCCAAACACCATAAGGCAACACCGAACACCTTGCACTGTAATCCAGACACCTTGCACCGTACGGCAAACACCGTCAGAGCTTGTGtacaaaaggaaaatgaaaccaaaagttAGCAAACATGAAAgccatacacaaacaaacagacaatcaCATACAAAcgcaatacaaacaaacaaacaaacatatgaaacATGACGTGTCAGTAACGTGTTCTCCAATCAAACCAGAAACCTTTAGTCCGTAGCAGACCGCACAGCTGAGACGCCGTGATCATGTGCGATCCTTCTGTGTCCGTCTATATCCATGATggtaattaattcataataaaagaCTTCATAACACAAATACCATAAATATCAAATATACAGATAATaaagaagagagagaaaaaaactataTAGACAATATAaacatattgcagaaaaacacacAATAACATCAACACCATCTCAAAGTTATTAACACACTAGTGTCAGGCTCATCTGCAGGATCTGAGTATATCTGAATATAGgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgtcataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatacacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgtcataatgcacactatgagctgttataatgcactatgagctgttataatacacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatacacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgtcataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgtcataatgcgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactttgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttaaaatgcactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcacactatgagctgttataatgcgcactatgagctgttattatgcgcactatgagctgttataatgcgcactaaagagctgttat

Function

symbol description
slc25a34 Predicted to be located in mitochondrial inner membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human SLC25A34 (solute carrier family 25 member 34).

GO:

id name namespace
GO:0005743 mitochondrial inner membrane cellular_component
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0005739 mitochondrion cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040426-1442 Predicted to be located in mitochondrial inner membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human SLC25A34 (solute carrier family 25 member 34).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000087401

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00040847 True 3016 mRNA 0.44 2 184670 188112

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020648 fblim1 coding downstream 19726 158112 ~ 164944 (-)
XLOC_020647 si:ch1073-335m2.2 coding downstream 29043 130967 ~ 155627 (-)
XLOC_020646 NA coding downstream 83223 101082 ~ 101447 (-)
XLOC_020645 ndufaf3 coding downstream 90151 85597 ~ 94519 (-)
XLOC_020644 CABZ01101813.1 coding downstream 104137 76469 ~ 80533 (-)
XLOC_020650 fbxo42 coding upstream 3819 191931 ~ 193234 (-)
XLOC_020651 ora1 coding upstream 20532 208644 ~ 209741 (-)
XLOC_020652 zgc:66156 coding upstream 37825 225937 ~ 237651 (-)
XLOC_020653 zgc:66156 coding upstream 66278 254390 ~ 263117 (-)
XLOC_020654 myhz1.1 coding upstream 80240 268352 ~ 278328 (-)
XLOC_020641 NA non-coding downstream 148554 27146 ~ 36116 (-)
XLOC_020657 NA non-coding upstream 125598 313710 ~ 315380 (-)
XLOC_020664 NA non-coding upstream 204507 392619 ~ 395900 (-)
XLOC_020672 NA non-coding upstream 471805 659917 ~ 697504 (-)
XLOC_020673 NA non-coding upstream 512101 700213 ~ 704907 (-)
XLOC_020675 NA non-coding upstream 545132 733244 ~ 735244 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
bowfin (Amia calva) AMCG00002335 NA coding CM030136.1 CM030136.1 11708258 ~ 11711311 (-)