G104571


Basic Information

Item Value
gene id G104571
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 742125 ~ 743032 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU117570
GTTGTAGTGACAGGCCTGTTTGTCCTACGTGTGGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTCCTACATGATGCTGTAGTGACAGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgacagGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgttgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgttgtagtgacAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTAATATGTCTGTTGTACTACATGATATTGTAGTGACAGACCTGTTGTACTTC
>TU117571
GTTGTAGTGACAGGCCTGTTTGTCCTACGTGTGGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTCCTACATGATGCTGTAGTGACAGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacagGTCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgttgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgttgtagtgacAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTAATATGTCTGTTGTACTACATGATATTGTAGTGACAGACCTGTTGTACTTC
>TU117574
GTTGTAGTGACAGGCCTGTTTGTCCTACGTGTGGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTAGTGACAGGCCTGTTGTCCTACATGATGCTGTAGTGACAGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaGTCCTGTTGTACTACATgatgttgtagtgctgtagtgacaggtctgttgtcctacatgatgttgtagtgctgtagtgacaGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTCCTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTGACAGGTCTGTTGTACTACATGATGTTGTAGTAATATGTCTGTTGTACTACATGATATTGTAGTGACAGACCTGTTGTACTTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU117570 False 757 lncRNA 0.43 4 742125 743032
TU117571 False 693 lncRNA 0.43 4 742125 743032
TU117574 True 421 lncRNA 0.43 4 742125 743032

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118937315 NA coding downstream 65613 672497 ~ 676512 (-)
LOC118937314 NA coding downstream 234056 423319 ~ 508560 (-)
LOC118937313 NA coding downstream 258935 476561 ~ 484071 (-)
eomesb eomesb coding upstream 63118 806150 ~ 813190 (-)
azi2 azi2 coding upstream 136786 879818 ~ 905418 (-)
LOC118937319 NA coding upstream 572632 1314565 ~ 1316245 (-)
LOC110515934 gadl1 coding upstream 684219 1427251 ~ 1457133 (-)
LOC110515405 LOC106590999 coding upstream 830370 1573402 ~ 1683489 (-)
G104564 NA non-coding downstream 24657 716673 ~ 717468 (-)
G104560 NA non-coding downstream 26346 715267 ~ 715779 (-)
G104557 NA non-coding downstream 27068 708159 ~ 715057 (-)
G104539 NA non-coding downstream 56922 684926 ~ 685203 (-)
G104535 NA non-coding downstream 61427 680473 ~ 680698 (-)
G104588 NA non-coding upstream 43068 786100 ~ 786786 (-)
G104620 NA non-coding upstream 122990 866022 ~ 867915 (-)
G104621 NA non-coding upstream 124721 867753 ~ 868219 (-)
G104603 NA non-coding upstream 128279 871311 ~ 872653 (-)
G104625 NA non-coding upstream 133600 876632 ~ 876918 (-)
G105220 NA other upstream 590954 1333986 ~ 1342335 (-)
G105285 NA other upstream 797698 1540730 ~ 1541706 (-)
G105340 NA other upstream 898235 1641267 ~ 1641732 (-)
G105427 NA other upstream 1169560 1912592 ~ 1917188 (-)

Expression


Co-expression Network