G104672


Basic Information

Item Value
gene id G104672
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 972635 ~ 975873 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU117719
ggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatggtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatggtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatggtgtagatctacctaggttaaggtggtatagtgtagatgta
>TU117717
tacctaggttaaggtggtatagtgtagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaacGTGGTATAGTGTGGATGtagctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagtgtagatgtacataggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtaGTATAGTatagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatggtgtagatctacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtggatgtagctaggttaaggtggtatagtatagatgtacctaggttaaggtggtatagtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtatagtgtagatgtacctaggttaaggtggtatagtgtagatgtagctaggttaaggtggtatagt

Function

NR:

description
PREDICTED: involucrin-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU117719 False 307 lncRNA 0.44 2 972635 974741
TU117717 True 773 lncRNA 0.57 2 973905 975873

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
azi2 azi2 coding downstream 67217 879818 ~ 905418 (-)
eomesb eomesb coding downstream 159445 806150 ~ 813190 (-)
LOC110516483 LOC106573240 coding downstream 181764 727654 ~ 790871 (-)
LOC118937315 NA coding downstream 296123 672497 ~ 676512 (-)
LOC118937314 NA coding downstream 464566 423319 ~ 508560 (-)
LOC118937319 NA coding upstream 339791 1314565 ~ 1316245 (-)
LOC110515934 gadl1 coding upstream 451378 1427251 ~ 1457133 (-)
LOC110515405 LOC106590999 coding upstream 597529 1573402 ~ 1683489 (-)
kiaa1143 k1143 coding upstream 727078 1702951 ~ 1704863 (-)
zdhhc3a zdhhc3 coding upstream 733643 1709516 ~ 1732333 (-)
G104666 LOC100194703 non-coding downstream 4913 967407 ~ 967722 (-)
G104662 NA non-coding downstream 7576 962906 ~ 965059 (-)
G104655 NA non-coding downstream 18751 953674 ~ 953884 (-)
G104644 NA non-coding downstream 33731 938002 ~ 938904 (-)
G104639 NA non-coding downstream 39881 932187 ~ 932754 (-)
G104689 NA non-coding upstream 30379 1006252 ~ 1006927 (-)
G104691 NA non-coding upstream 33008 1008881 ~ 1009116 (-)
G104693 NA non-coding upstream 34305 1010178 ~ 1011679 (-)
G104694 NA non-coding upstream 34460 1010333 ~ 1010834 (-)
G104699 NA non-coding upstream 40547 1016420 ~ 1016766 (-)
G105220 NA other upstream 358113 1333986 ~ 1342335 (-)
G105285 NA other upstream 564857 1540730 ~ 1541706 (-)
G105340 NA other upstream 665394 1641267 ~ 1641732 (-)
G105427 NA other upstream 936719 1912592 ~ 1917188 (-)

Expression


Co-expression Network