G104722


Basic Information

Item Value
gene id G104722
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048566.1
NCBI id CM023220.2
chromosome length 103806877
location 1047586 ~ 1048146 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU117786
gctctactctactcaactctactctactctactctactctactctactctactctaccctactctactctactctactctactctaccctaccctactctactctaccctaccctaccctaccctaccctactctactctaccctactctactctactctactctactctgctctaccctactctactctactctgctctactctactctactctactctactctactctactctactctgctctgctctgctctgctctgctctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctgatctactctaccctactctaccctactctgaTCTACCCTACTCTGATCTACCCTACTCTgatctaccctactctactctactctacactaccctgCCTCTACCCTGCTCT
>TU117787
gctctactctactcaactctactctactctactctactctactctactctactctaccctactctactctactctactctaccctactctactctactctactctactctactctaccctactctactctactctaccctaccctaccctaccctaccctactctactctaccctactctactctactctactctactctgctctaccctactctactctactctgctctactctactctactctactctactctactctactctactctgctctgctctgctctgctctgctctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctactctgatctactctaccctactctaccctactctgaTCTACCCTACTCTGATCTACCCTACTCTgatctaccctactctactctactctacactaccctgCCTCTACCCTGCTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU117786 False 441 lncRNA 0.38 3 1047586 1048146
TU117787 True 471 lncRNA 0.46 2 1047586 1048146

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118936923 NA coding upstream 78058 968616 ~ 969528 (+)
LOC110506977 LOC106595099 coding upstream 139010 905576 ~ 908576 (+)
cmc1 cc068 coding upstream 175072 860459 ~ 872515 (+)
LOC118937316 LOC106573240 coding upstream 321611 724791 ~ 731551 (+)
zgc:110410 LOC106594189 coding upstream 325193 714730 ~ 722393 (+)
LOC110515032 LOC106606177 coding downstream 173984 1222130 ~ 1224904 (+)
tgfbr2b LOC106606173 coding downstream 261056 1309202 ~ 1390936 (+)
LOC118937323 NA coding downstream 376170 1424316 ~ 1426453 (+)
stt3b stt3b coding downstream 408190 1456336 ~ 1564305 (+)
LOC118937324 NA coding downstream 522164 1570310 ~ 1573421 (+)
G104716 NA non-coding upstream 12820 1032044 ~ 1034766 (+)
G104711 NA non-coding upstream 19438 1027631 ~ 1028148 (+)
G104690 NA non-coding upstream 38472 1008879 ~ 1009114 (+)
G104685 NA non-coding upstream 53686 993601 ~ 993900 (+)
G104684 NA non-coding upstream 54915 992465 ~ 992671 (+)
G104730 NA non-coding downstream 18434 1066580 ~ 1067219 (+)
G104746 NA non-coding downstream 62031 1110177 ~ 1111073 (+)
G104756 NA non-coding downstream 91045 1139191 ~ 1139974 (+)
G104770 NA non-coding downstream 124262 1172408 ~ 1173528 (+)
G104771 NA non-coding downstream 125509 1173655 ~ 1174059 (+)
G104092 NA other upstream 346315 690046 ~ 701271 (+)
G103851 NA other upstream 866564 174996 ~ 181022 (+)
G104761 NA other downstream 104915 1153061 ~ 1153749 (+)
G105036 NA other downstream 650927 1699073 ~ 1700431 (+)
G105042 NA other downstream 660823 1708969 ~ 1710557 (+)
G106019 NA other downstream 1472570 2520716 ~ 2527972 (+)

Expression


Co-expression Network