XLOC_021448


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_021448
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 5129982 ~ 5141915 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00044654
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>TCONS_00042639
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>TCONS_00042640
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Function

GO:

id name namespace
GO:0042737 drug catabolic process biological_process
GO:0042738 exogenous drug catabolic process biological_process
GO:0006805 xenobiotic metabolic process biological_process
GO:0008395 steroid hydroxylase activity molecular_function
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen molecular_function
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GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen molecular_function
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KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117613

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00044654 False 2603 lncRNA 0.42 8 5129982 5140354
TCONS_00042639 False 3860 lncRNA 0.35 3 5132439 5141915
TCONS_00042640 True 3434 lncRNA 0.34 3 5135480 5141915

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_021447 zgc:194242 coding upstream 16984 5108374 ~ 5112998 (+)
XLOC_021446 ube2t coding upstream 21927 5104743 ~ 5108055 (+)
XLOC_021445 tnnc1a coding upstream 234106 4890693 ~ 4895876 (+)
XLOC_021444 vgll4a coding upstream 280037 4777348 ~ 4849945 (+)
XLOC_021443 raf1a coding upstream 382705 4709607 ~ 4747277 (+)
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XLOC_021450 tead3a coding downstream 357392 5499307 ~ 5558256 (+)
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XLOC_021453 pkp1a coding downstream 489466 5631381 ~ 5639675 (+)
XLOC_021441 LO017700.2 non-coding upstream 452482 4559564 ~ 4677500 (+)
XLOC_021432 NA non-coding upstream 848875 4273916 ~ 4281107 (+)
XLOC_021427 FP102158.1 non-coding upstream 1185248 3939908 ~ 3944734 (+)
XLOC_021426 CU682640.1 non-coding upstream 1214228 3913304 ~ 3915754 (+)
XLOC_021423 NA non-coding upstream 1592239 3537283 ~ 3537743 (+)
XLOC_021455 CABZ01026153.1 non-coding downstream 729591 5871506 ~ 5922464 (+)
XLOC_021460 NA non-coding downstream 1186431 6328346 ~ 6341688 (+)
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XLOC_021466 BX005466.1 non-coding downstream 1683773 6825688 ~ 6825802 (+)

Expression


Co-expression Network