XLOC_025701


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_025701
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 48618161 ~ 48629771 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00052782
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>TCONS_00052783
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Function

GO:

id name namespace
GO:0022402 cell cycle process biological_process
GO:0072698 protein localization to microtubule cytoskeleton biological_process
GO:0044380 protein localization to cytoskeleton biological_process
GO:0005815 microtubule organizing center cellular_component
GO:0015630 microtubule cytoskeleton cellular_component

KEGG:

id description
ko03050 Proteasome
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko05169 Epstein-Barr virus infection
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00052783 True 8284 lncRNA 0.35 2 48621120 48629771

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_025702 hs3st3b1a coding downstream 213147 48842918 ~ 48869632 (+)
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Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G168783 NA non-coding CI01000033 null 1106964 ~ 1115940 (-)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G9620 NA non-coding NC_035898.1 CM008301.1 11282237 ~ 11290523 (-)