G667577


Basic Information

Item Value
gene id G667577
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 5562473 ~ 5564827 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU760277
ggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggCTAATAAGGATACAGGTATATGGTTAGGaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttacTAAGAATACAGGTATATGGTTACTAAGGATACAGGTATATGGTTAGGAAGGATACATGTCTATGGTTAGGaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatgg
>TU760278
ggtctatggttactaaggatacaggtctatggttacTAAGGATACAGGTATATGGTTAGGAAGGATACATGTCTATGGTTAGGaaggatacaggtctatggttactaaggatacagGTCTATGGTTAGGaaggatacagGTATATGGTTAGGaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttacTAAGAATACAGGTATATGGTTACTAAGGATACAGGTATATGGTTAGGAAGGATACATGTCTATGGTTAGGaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatgg
>TU760279
ggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggctaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttaataaggatacaggtctatggttactaaggatac

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU760277 False 407 lncRNA 0.39 2 5562473 5564029
TU760278 False 469 lncRNA 0.39 3 5562473 5564827
TU760279 True 282 lncRNA 0.38 2 5562897 5564029

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
znf395b LOC106571047 coding downstream 10923 5535756 ~ 5551550 (-)
LOC110529167 LOC106571044 coding downstream 112133 5364219 ~ 5450340 (-)
LOC110529166 LOC106571043 coding downstream 199791 5344512 ~ 5362682 (-)
LOC110529164 LOC106571040 coding downstream 358051 5187359 ~ 5204422 (-)
LOC110529294 LOC105029941 coding downstream 681027 4845346 ~ 4881446 (-)
si:dkey-229d11.5 NA coding upstream 19018 5583845 ~ 5586635 (-)
LOC110529170 LOC106571034 coding upstream 84669 5649496 ~ 5739571 (-)
LOC118965593 NA coding upstream 145318 5710145 ~ 5711121 (-)
LOC110529295 LOC106571079 coding upstream 374115 5938942 ~ 6044926 (-)
LOC110529288 LOC106571062 coding upstream 1131155 6695982 ~ 6717783 (-)
G667566 NA non-coding downstream 29887 5531329 ~ 5532586 (-)
G667574 NA non-coding downstream 34596 5527602 ~ 5527877 (-)
G667564 NA non-coding downstream 44676 5517554 ~ 5517797 (-)
G667561 NA non-coding downstream 47336 5514919 ~ 5515137 (-)
G667580 NA non-coding upstream 9051 5573878 ~ 5574450 (-)
G667587 mcm3 non-coding upstream 35698 5600525 ~ 5629477 (-)
G667822 NA non-coding upstream 79039 5643866 ~ 5644318 (-)
G667835 NA non-coding upstream 87803 5652630 ~ 5653181 (-)
G667122 NA other downstream 1072253 4488806 ~ 4490220 (-)
G665927 NA other downstream 1892326 3668232 ~ 3670147 (-)
G665797 NA other downstream 2040850 3520790 ~ 3521623 (-)
G665718 NA other downstream 2144185 3417113 ~ 3418288 (-)
G668192 NA other upstream 641731 6206558 ~ 6284021 (-)
G668238 NA other upstream 715369 6280196 ~ 6281640 (-)
wdr21 dcaf4 other upstream 1221705 6786377 ~ 6801903 (-)
G669087 NA other upstream 1425023 6989850 ~ 6991612 (-)
G669278 NA other upstream 1752477 7317304 ~ 7320203 (-)

Expression


Co-expression Network