XLOC_027434 (CR388132.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_027434
gene name CR388132.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 29165840 ~ 29290030 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00053930
tgaagctcctcctcctccagtgaAGTTCCTCCAGTTTAGCAATAAACGCTGGAATATTCCcatctggggtctgttctttgtacgtggattactcactTAGCTGGATCCAGGATCagttcgttcttcaaaactgatccgacAGTTGTTGTCATAACAACAAgtttttaacaatataaaaacaagttaaaaatatatgtattaagtgcaaagagaaaacgtattgatttgaactttttagatcgctttagtacaatttgtgttcTATAATTGAAATGCtcaatatttgacttttttttttaaagcaataatacatttatgcagtcataaacatgttggGACAGTTAATATGACTTCATAAAAGTTACAGATGCCTTAACCAATATcgaaatgcttttgtaaacatcctgttattctttacactgatttaaaaaacggctacaataatactactataataaggaaaatccgctttaactgtaaaactaaataaattgctcttgacacatgaaagggccaagcctgcagcccacaacaaggctCGATAGAtaagtccttcacaacacacgcagcaatctcagatcagttcatccagaggttttaatctgattcacgaacttatttaaagaaccaaattagctagagatcagttattaagattaacagatccaggatctgccaaatcatcttagatcatttaagtgtgctacgaagaacagaccccaggctCCAGTGAAGAGTTTTTTGAAGGACAGCGAGaacatgagtgatccagaaccatGCAAAATTAAAAATGAGGAGTCTGAACAACAAATAGacctaattggaGAGAATGAGTGGAGTAAAgaagaggaacatcatgtcaaaattgaggaaaaaactcatttacagactgatggtattttgcaAAGTAGAGACAAGaattgtttcacctgcactcagtgtggaaagagttctGGAAGAAAAGGCGATcataagattcacatgatgatccacactggagagaggccattcacatgcactcagtgtgggaagagtttcagcaaatcatcataccttaatcaacacatgatgatccacactggagagaaaccattcacatgcactcagtgtggaaagcgTTTCACCCtatcatcataccttaataaccacatgatgattcacactagAGAgcaaccattcacatgcactcagtgtgggaagaggtttaactgctcatcatcccttaataaacacatgaggatccacactggagagaaaccattcacatgcactcagtgtggtaatagatttaactgctcatcacaccttaatcgacacatgaggagccacactggagagaaaccatttacttgcactcagtgtgggaggagtttcagctgctcatcaaACCTTTATCAACACATGAttatccacactggagagaaaccatacacatgcactcagtgtgggaagagtttcagccaatcaacacaccttaatcaacacatgaggatccacactggagagaaaccattcacgtgcagtcggtgtgggaagagtttcagccaatcatcatctcttaatcaacacataaggatccacactggagagaaaccattcacatgcactcagtgtgggaagagttataGACGCTCATCaacccttaataaacacatgagggtccacactggagagaaaccatttacttgcacttgAGTCGCgctcacactggacttttctccccatagatttCCATATATACGCaagcaaatgcgtcagaccagaaatgcAAGTTCGTGCATCAAGTtttcactgcattgcaaagttcaagcttggtgaactctgatctgcgaaatcgcatcacttgacagtGTGAGACTAATGggaaatcaaaacatgacctctctggacataTGTAAattatggaccaatcgctcattATGTCTAAttgtcttgtttaatcccgcctcttTTGCAGCACTGTATAACAGAATtctgcatgctcaaactctagtgtgaccgcagcttcggtgtgggaaaagtttcagcaactcctcagaccttaataaacacatgaaggcccacactggagagaaaccattgacatgcactcagtgtgggaagagttttaaccaaTCAGCAAACCTTAATAATCACATGAAGATCAACACTGGTGTAAAAGAATATGTGTGCTTAaatgtgagaagacttttattaaagcgccaaaattgaaactgcaccagacgattcacactagagagaccgtacaagtgttcacaatGTGACGAGGTTTAATCAgtgaacacatctgaaaacacaaaagaggattcacactggaaagaaaccgtacagatctaatcagtgtctacagagtttcgcTCATTCGATGCAGCTTAAGAAACACGTGGACAAAAAGCTCCAGGACGGTTAGTTTGCAGTATACCAGGGCCTCAAGTTTAGAaagcccattcaattgtcctgttttgcatctttttttgtaaagtttctttacttttaggttcaagattctttctagtttactacatttacttttttgagtagaatacaaacttgatgaatattttatgatttaggcagagTGACAGGTAttacaatacaatattaatacactttGATGATCACAAGACTCCAGATTGgcattactcatcaatgggtatataaaagttgctgtgctagctaccccaggacgctgtggctactcaggagtcctcatgtcaagacctgccatctcattgactGAGATCTCGTTGATCTCATTCAACATTATAATTAGCTAATTGCAGTGGAGATATCGTATAATTAGAACAGGGCAGCGGATCAGCGATAAAGCAGAGATTGGCCTTTGCAGAATGGGTAGTTATGAGACGGCCAATAATGAAGAAAGTGCAAGAGTAGCCTACTGTTCAAAgtttcagttagaggagtcaGAGGAAAATCTGCCATCATCctgggagaaacaagatcgctTATATCCACGACTGCAGCACCTTGCAAGGAGAATCATTCCTACAACACACGGTGCAAACGAACGCTCATTCACTGCAGTCTGCAGCTGGCTGCGTTTTAGAGGCGAGGCGGAGAAGGCGCAGGGATATAAAGACAGggagagagcgctttttcctttgatctcgtttttggtgtattttactgacatgattatgattttccttGTTtatgcttaactttcgtttgggtaaaattattttccaTTACGTTTGCCCACTTTGAGAAATGTAGTGAgttttgctcatttttatttagattaatttgtatgtttttttttttttttttggctctttCCTGACGATATTGAGCTAGCCTATATCTCCTCAAGTTCACTCTTACCTCAGAGTTAGGTGGAAAGGGAAGATGTCGTACtacttccattttgcaaacacgtagaaaatgtattgttaaagacatcaggtaagaggtgaatgtcatctttgtttattttattcagtatagggaagtGTTGTCATTATACACACTGCGCTGAAGGACTTTTTTTCTCTTGATCAGTTTTTAGCGAGGTAAGGGGTAATTCATaaattagaattgttttgttatatttctttcttttgtttggcttCACTATCATCCCCTTACTCGAGTTTATCtagtttttgtttgttactttgtttgaatttgctacattattatattatttttattattattttatttctcttttttgtatatatttggacATTATTCTGCTTtcacttttttacattaaatcactttagtTGGAAGTTCTGTTGCAGTCTTTTGCTTTCACCCttacattgtgaaattaccataATAATTCTTATGACTAAGTTTCGTGAAAGTTACGACACATAGGCGTGCGCTTTTTCTATGACACAAATTCTGTTCCTGTACtccactggaaaaccaaaatgctTCGACACAGGCGACCTAACACAGGGAGCTGCAATCTCAATatatgtgaagcagccatcctgcgtaTACAGTAGTAACCGAGTGATCTCTCACTCAAGTCACTTGACATGGCTTGCACTTGAAAAATACTAACttaagaatataatatttagaacaaaatctcatcattattactattacaatttaatcaaatgtaatgaaataaagatgtttaaattggttcaattaggtAGAGACAAgcgacgtcaacctcaacaaggGGTAGCGGGGGGCGCGAGAGTACCACAGTACGTCATGAGAGTTTCACGATACatatcgtggttggtgtatcgcgatatttcagttcggttttaatatcgttacacctCTAATATTAATGATTCTCTTTTTTATTTGTCTGATTTCATCTCTCTTTTATGTTGCATTACCATACACTGTGtataattactttcagagagtcatgaagttggaggccagtcaagtaccacatgaaattatttatgttgacaaggctggggatCTCGCCGTGGGAGAAACGTAATAGACCAAAGGAccacagttaccgtgccgggccaTAGAAGATATCAAGtgtaatgtggatgagaacatgtggcaaaagaccgggcagaattactttgttatattattataactgtggtccttttgcaaataaagtcagtactgcagcaattctgtgtctgtattttttacataaactgtaaattttataaagctataattttataaagctatattttataaagaatttttgcagtaaaagaaaatgcctgcatttactaaacccaacaaaacaaaactgttgaGAGACTTCAAATATAAGAGCAGAGCTGACACAAAATAATGCAGTTTCATTAATGTCAGACgattataatgatttttattggaagagaacatgttagtgttttgaacaataatttcatattgaaacatgtttacagtgttttgttagacatggtgtattgTGTTTGCttattattgcattttgaaaagtagtttagaggtttagtttacaatgtgtgattttgataaaatacagagttgattttaaaatccttcttttcacttataaagca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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000104041

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00053930 True 6561 mRNA 0.39 2 29165840 29290030

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_027433 NA coding upstream 10820 29154352 ~ 29155020 (+)
XLOC_027432 NA coding upstream 76866 29087013 ~ 29088974 (+)
XLOC_027431 si:dkey-13e3.1 coding upstream 165271 28997595 ~ 29000569 (+)
XLOC_027430 NA coding upstream 189280 28962774 ~ 28976560 (+)
XLOC_027429 znf1059 coding upstream 343447 28814850 ~ 28822393 (+)
XLOC_027437 NA coding downstream 218 29290248 ~ 29292720 (+)
XLOC_027438 CR847895.1 coding downstream 54927 29344957 ~ 29359540 (+)
XLOC_027439 znf1140 coding downstream 242701 29532731 ~ 29553524 (+)
XLOC_027440 NA coding downstream 273707 29563737 ~ 29565367 (+)
XLOC_027441 si:ch211-214c20.1 coding downstream 330929 29620959 ~ 29638221 (+)
XLOC_027428 dre-mir-430b-10 non-coding upstream 456306 28709454 ~ 28709534 (+)
XLOC_027427 dre-mir-430c-1 non-coding upstream 456571 28709197 ~ 28709269 (+)
XLOC_027447 NA non-coding downstream 756966 30046996 ~ 30049798 (+)
XLOC_027448 NA non-coding downstream 896020 30186050 ~ 30190789 (+)
XLOC_027449 CR936249.1 non-coding downstream 966961 30256991 ~ 30260836 (+)

Expression


Co-expression Network