XLOC_028433 (si:dkey-61f9.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_028433
gene name si:dkey-61f9.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007115.7
NCBI id CM002888.2
chromosome length 78093715
location 3792950 ~ 3805992 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00055201
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>TCONS_00055202
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>TCONS_00055203
CTGCAAATGATCACAGCACATCTATTACTGCAATTATTGatttatagtttttgttttaataaaattatcaCATTTAAACTTGAAGACTCTGACTGACTGGATCTCATTCGATTAATTATTTGCATCAGCACTGTTTACTTTAGTTATTATGAGCATGTTCATGTGAATTTTCCATAGAGAGATTGAGGAAGTGTCTGAATTCAAATGTGTGTTTGAGTCTCCTCTTACTGCAGTCGTCTACTCTCACCTACAGTTCAGACCAGGAGACGATCAGAAGAGATCAGCTGCTCACCAGTGGTTGCTGAAACTGATGTTGATGATGTTTCTGCATGTGTTTCTCCTCATCTGTGcttttccTCCTTCAGCTGCTGAAGGCCGACTGAGACAGTTCTACATGCTGAAGCAGAGGAGTAACAATGGATCTGCTGCTCAGAGTTTATGCAGAGTAAACTACACTGACCTCGTCACAGTTTATGACCAACAAGACAATAATAAACTACTGCAACTGATGAAGAACAGCAGCTCTCCAACTGGCTGGATTGGTGTTTATAGAGGAAACTACAGTCTGAAATGGTCAAATGGTGATGATGTTACATACAGCAGATATTCTCCAAGCTATTCTGATCAAACTCGCTGTGCTGCTATGAATGCTAATGGAGATTGGGAATCTGTCCTATGCAATGAGACAAAACACTTCATGTGCTATGAACAAGAAGCTGGAGGATCATCATACATCTACACATTAATCCTTCAGCCAAAGAGCTGGTCTGATGCTCAGCTTTACTGCAGAGAGAATCACACTGATTTAGTCTCTATCAGAAATGAGGAGGAAAATACCCTGGTAAAGAACAAAGGAACACAGAGTAATACTGCTTTCTGGATCGGCCTGCTGAATGACAATGTGGACTGGAGGGATGGAGGAAGATCTGCTTACAGAAACTGGAATCCAATCTCTGATCAGAGCAAACCTAATGCTTTCATGAGTTTTGCTGATGGGCGGTGGCTAAAAACAATTTCTACAAATAACTATCCTCTGTGCTACAGTAAGACGACACACACAACagctttaaattcaattaattccCATTTTCTCTTCTCATGTCATTCTAATCTGCTGTATTTGACTAGTTTTGTATGTTTGTTGTTGTCAGAGAGCTTCATTCATGTGAGTCCTGCTGAAATGTCCTGGGAAGATGCTATGAATTACTGCAGCTCTCAGTTTTCTGGAGCTCTGTGTCTGGAGTCTGAGAACGATCAGACAGAAACGCAGCGAgagttaaacagaaataatatcTCTGCTCCAGTTTGGGTGGGTCTCAGACAGAGCTGTCCTTTCGGATTCTGGATGTGGATCAATGGTCTTGAAGTGGGaaactggacaaactggagaGGAGGAAAGGCTCCTGAAGCTGCGCTTTCTCAACACTGCGCTGCCATGGAGAAGGTGAACGGACGATACACACTGACTGATAAAGACTGCAGGTCTACATTCAGAGTTGTGTGTGAGACGCAGTAATTTACCACTCTTTActgccttatttttttattgaacagtTTTCAGGAGCTCCTGCTGTTAATAGTGAACAGCTCAATCATTTGCGTCTTTAAAATAAACTTGTAATTAGCATTATCCTAGCAGCTGATGTGaaaccttgtgtgctgttggCTTTCTTTGACTGATTATGTTTATCTCTTtggttaattttcatttattttatcaattcACTTGTGAAACTTTATagaaaaaatttatattataagTTGTTAATTAATATACCGCACATCACATCCAATTTCCTCATATGTTGTCTTGAGTTGTCTTTGTATCATCTCATATTAAATAAAgcgttttaataaagaaaaaaaaaacatttttatttaatattcaataaaGAAATggtttttacagatatttttatcagctaaataaatgaattaat

Function

symbol description
si:dkey-61f9.1 Orthologous to human FCER2 (Fc fragment of IgE receptor II).

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-041210-13 Orthologous to human FCER2 (Fc fragment of IgE receptor II).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112842

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00055201 False 1783 mRNA 0.38 2 3792950 3804493
TCONS_00055202 False 1777 mRNA 0.38 3 3792950 3805075
TCONS_00055203 True 1940 mRNA 0.39 4 3792950 3805992

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_028432 CU928073.1 coding downstream 336848 3446011 ~ 3456102 (-)
XLOC_028431 NA coding downstream 377798 3407711 ~ 3415152 (-)
XLOC_028430 NA coding downstream 387700 3392221 ~ 3405250 (-)
XLOC_028429 pik3cg coding downstream 439355 3343171 ~ 3353595 (-)
XLOC_028428 NA coding downstream 484535 3306145 ~ 3308415 (-)
XLOC_028434 si:dkey-61f9.1 coding upstream 266 3806258 ~ 3811017 (-)
XLOC_028435 NA coding upstream 7626 3813618 ~ 3819984 (-)
XLOC_028436 NA coding upstream 14866 3820858 ~ 3821848 (-)
XLOC_028437 NA coding upstream 126541 3932533 ~ 3933160 (-)
XLOC_028438 NA coding upstream 143234 3949226 ~ 3952125 (-)
XLOC_028427 NA non-coding downstream 535386 3250774 ~ 3257564 (-)
XLOC_028441 NA non-coding upstream 341636 4147628 ~ 4157535 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G153367 NA unknown NC_035913.1 CM008316.1 21725597 ~ 21760551 (+)