XLOC_002959 (si:dkey-65j4.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002959
gene name si:dkey-65j4.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 37485403 ~ 37487721 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00005458
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>TCONS_00006101
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>TCONS_00005457
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>TCONS_00006102
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Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-141219-43 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000101476

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00005458 False 1002 mRNA 0.30 2 37485403 37487678
TCONS_00006101 False 933 lncRNA 0.31 2 37485412 37487685
TCONS_00005457 False 930 lncRNA 0.31 2 37485412 37487698
TCONS_00006102 True 2310 lncRNA 0.33 1 37485412 37487721

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002958 NA coding downstream 9158 37418234 ~ 37476245 (-)
XLOC_002957 CT573231.1 coding downstream 128100 37352480 ~ 37357303 (-)
XLOC_002956 omga coding downstream 147824 37334270 ~ 37337579 (-)
XLOC_002954 myo18aa coding downstream 410042 36950773 ~ 37075361 (-)
XLOC_002955 BX323076.2 coding downstream 443171 37041078 ~ 37042232 (-)
XLOC_002960 NA coding upstream 241590 37729311 ~ 38025967 (-)
XLOC_002961 NA coding upstream 377698 37865419 ~ 37889561 (-)
XLOC_002962 NA coding upstream 541639 38029360 ~ 38168078 (-)
XLOC_002963 dre-let-7c-2 coding upstream 584356 38072077 ~ 38072168 (-)
XLOC_002964 usp25 coding upstream 680437 38168158 ~ 38243851 (-)
XLOC_002945 AL845435.1 non-coding downstream 822792 36654197 ~ 36662611 (-)
XLOC_002944 NA non-coding downstream 834499 36642166 ~ 36650904 (-)
XLOC_002966 CU914142.1 non-coding upstream 888413 38376134 ~ 38376253 (-)

Expression


Co-expression Network