XLOC_002945 (AL845435.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002945
gene name AL845435.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 36654197 ~ 36662611 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00005434
CTGATACGTTCCGTTTTCAAATGTCGTCCTTCCGTGTTTTATAAGTTTATTAAACCATATTACTGAATACTATTCGAAGAGGTGCAAAATATGAGGTCAGCATGAGAGCTGTGAAAGCAGTTTAAAGCCACTTTTCTGATCCTTTGTCACGAGAAAGACATTTGCAAAGCGGCTGGTCCCTCTTTGGTCAGCATCATGAGGGCACAGTTCAGTGCGCTGCCGTACTGGCCGGCCGACGAGTTCATGAACCGCGTTTTCACCACGTC
>TCONS_00006100
GCCTCTTTTAACTGATACGTTCCGTTTTCAAATGTCGTCCTTCCGTGTTTTATAAGTTTATTAAACCATATTACTGAATACTATTCGAAGAGGTGCAAAATATGAGGTAATAACCGTTCACATAACCATAGTTTTTTTCAAAACAGCTTTATTTCcgaaaatgtatgttttgtggTGTTCCTGTCGAATActattacactaacgttaatgtATTTTaggaaaataatgttttactactAATAACACCAACGTTAAATAGTGGCAACAACAAATGAATCATGGTTTTGTCACTCTAATCAGCCATGTTATTTGTATTAAAATGGTGGGTAtacaaatgtgaccctggaccagtcataattgtaatttcttttttgttttaatattctcttaattgtatttttacatcAGTACAAATGATAAGTTTTACATATGTGTACTTTTTTCCTTTGAAACACAAAGTTGTATTTTACTATTAAATATAAGAGaactaaaaaaacagaaaagtggGGGGAAGGGGcaaaaaacataagaaaaaaaagtaaataaataaaataaaataactaaataagggGGGATATTTGAGGTGTTTTTGGTTCAATTACTGCTCTCTTGTTAAAGTACTCAATAAAGGGATTCCATATTACATGgaaattctttgttttattttttagggaAAGCCTTAGCTTCTCAAGTTGCAGACAGGACATGACATCCTTTATTAATGTGGAGCAACGTGGAGGATCTTTCCGTTTCCAATTTAGTAAAATCAATCTACGTGCCAAAAGGGTTATAAATCTAATCACTGTACGTTGAATATTAGATAAATCTGCATCATCACTGACACCAAATATAGCTAAAATAGGCCCAGGATATATTTGTGTTCCCACCACTTCTGATATTAATTCAAAAACTGAAAtccaataattaacaataattgtAATTTCTTTCTGAGTTGAAACGTATACATCATCTGAAAGccgaataaataagcttttcataAATAAAGGGCTTATcaatgcaaatttttaaataaaaatggacttttaatatatatttacaacagggctgcatggtggcgcagtgggtagcacgttcgcctcacagcaagaaggtcgctggttctagatagttgctgtttctgtgtggactttgcatgctctccccttgtttgtgtgggtttccttcgggtgctccggagGAAATAACATGTGgcataagtgaattgggtaagctaaattgtctgtagtgaatgagtgtgtatggatgtttcccagtgatgggttgcagctggaagggcatttgctgcataaaacgtgctggataatttggttctGCTGTGACGATCCTAAataaacaaagggactaagccgaaaagaaaatgaatgaattaatatttacaGCACAcaacaaactacttatttaaaataagctgaatcaacactatccttgagatttcattgggacaacttaattttttgtgttcaattcacataaatttgttaaaagtgttaagtttatccgatttgtgttgggacaacaggaataaattatgtggaaccctgcattttttacagtgcaggatgTTTACAacatatcttcatggaacatgatcttgaCGTAATATTTTAGTGGTTATTGTcctaaaaatctataattttgaccaatacaatgtatttttggttatTTGCAAAAACATAACTGTGCAACAAAAGACTAgagtggtccagggtcacaaataaacggcaaaaaacatgGTTATACTTTTTTCTACACTGaaaaacatgctgggttccacaaaatttactctatgttgtcccaacacaaaactaataagttaacttaataattcttttacaaatttaaggatTGAACATAatttggattgaacataaacaatatagttgtcacaaaaaactcaaaagtattgtgtttttttccaactaattttaaataagcagtttgaacaagcagcaaaaggcggttcatttttggatttttttcgtaactttttttattttattttacaaaaggcTGAAATGTTTTGTTATCACATAAACTAACTCAAAAACAACACTTatcttttagaaatattaatcTAAATGTAAAAAGTGTGATAATTATAGCCCCAGTCTCCCCTATTTGTCTGAAACGCTGAGTCATTCTGATTCATTATGTGAAGTTGCACATATGTTATTCATAAAACAGGACTTTCAGTTCTCCCTCTTTTAGAGACACATCCACTGAGTTAGCTTTTTCGTATAGATTTGCATTAGATGTTGTAAAAGCTGCAAAAAATAATGTCTGGTCAgctgaatgtttttttcttaGATACAAAAACCAAAatcaattgaatgaataaatagtacactcaagttttttttctctaagaaacaaaaaaacaaacaaaatcaccTCAACTACACACTTTAACCCTtgtgcattaattaaaaaaaagttagatGTTGGTCCATAAGGGACAAAAATATCAGTGTCTAAAGAAATGTTGCTATTTTTGTTACACTTTAACTGAgagatttctattttttttgggaagataaaacatatttataaaggtaAAATGAGGATGAACATAGTCAAAGCtcataaaaaaacatactttttaacAGAAATGTTTGCTGTTTGCATTAACATGGccaaaaatatcacaaaaaaattttaaaaagaaagaccATATAAAGAGGCACAAGGGTTAAACCTCTTATCACTATTGTTGAAGATCAGGCTGCTATTTGTGTTTCACGACGGTATGTTGAGACAGAACTGATAACGTAGAGCCGCAAGGCAAAGCTACATGAGGCATACGTTTAAAAACAACTGGTATAGCACGTGCTTCATAAGCTACACAATGCAGCTTATTATTGACTGAGGTCAATTTAAGAGTCAGATGTGCACAGTATACTAAAGCACAGGCCACTCTTGTGTTACTTTTCCTGAATATATGTTTTCCATTCACACTTCACAGATTTGCATTAGTCTTTGTATTGTTAATTTCCCTCAAGTGAAACTCCCTGCTCTTTTCTAATAAAGACATTGTTTGCCTGTCTTTTATAGGTCAGCATGAGAGCTGTGAAAGCAGTTTAAAGCCACTTTTCTGATCCTTTGTCACGAGAAAGACATTTGCGTAAGTCTTTTGCCCTGGTGTGTTGGGCTCTCTGTTGATTTGATCATTGATTATATCTGATTAAATGACTCTTTGGTGTAGGGGAGTCAAATGCATGTGACCATGTGGTCAAAGACGAGACGTTCCCACTTTGGTGTTTGCATCTATAAGAGTAATTTTGTATAGAAAGCACATTAAAGTGTATGCTTTAATCTTTCAGCTAATGTTtgtgaaaattaaatatttaaaggatAGTTCAAACCGTAAATGAAAATACTGGCATTATTTACTTCGTTttaattagtttctttcttctcttacTTAAAAATTGTTGGAGTAAAAAAACAGCCATCATTACTTTTTTTGTTCTTATGCTTATTTTTTCCTCCAACTTATTTAGAATACCATGTTTTGTGTCAAagggaaaaataaattaataaatgtttggaAACCTTTGACTAAATGGTcagtaaattataaataataatgtccCTTTAATGTGAAGTAATCATTGTCATTAACATATACAAAgcaaaaatgtggtaaaacaagctaaataatctgccagtggggtaagtaaattattatttttttattttataattgttagggctgcagaatatatcatttcagcactGATATCACAACGTGTACAGCATCCTCAATAGTTACATCgctggatctgcaatgttgagttataGTTGAAGAGGAGAAACAGACACATTATTGGAGAGTTGAACTATAATGGAGTAAGAGTTTTTTGTTTGCATGTGATTGCCTAAAATTTGTGATTAACAGAGTTCAAAGTGTTCAGGCACATGAAAttttaccatttgtaactttgataaataataattttattaaattatttataaagtaaagacatttgcagtgttattttatatttgattatttaaattttcAGCTGAATACTATTTGACTGCCACAAGAACCCTAAAACACTCTTTATTTCCcttttatctttaattttttttgacattttgtgAATAATTCACTTCCCTACAGAATCAGTCCACTCAATCTTAATGAATAAATTCTTTCTAATTATCAGTTTTCAAATCAGCTGGTGAAATTGTACATATATTGCAATttttatcacagaaaaacaaaatattgcaatgtcagatttttcctaTATTGTGTAGccttaattattatgtttattgaATGTATTATTATCTACTTTCCTAATAGGCaggttattttacttttttaagggaaaaaaacacttaattttgacttattatttcggAAAAATACTTTTTAGTAGAAAGTGCTTCTGGATTTaagcatttttagatatttggagcGAGAGCGAAGACAAAAACTCTTTGCAGTGTATACATCTGAAATAAATGTATATCTTAAATATAAGTCATAACTTTACTTTTAATTGAGTTTTAagtggggcagcacggtggcgtaAGGGGTaacacctcacagcaacaagatCACTggaacctcagctgggtcagttggtatttctgtgtggagtttgcatgttcttcctctgttcgcgtgggttcctttgggtgctccggtttcccctacaagtccaaaaacatgtagtataggtgaattgggtgagctaaattatatgtgtgtgaattagtgtgtatgggtgtttcccagtgatgggttgcacctggaaggtcatccgttacgtaaaacatgtgctggataagttagtgattcattctgctgtggtgaccccagattaataaaagggactattccaaaaagaaaatgaatgaatgaatgaattttaaatgattaaaagcaTCTTGTGGTTTGAAAGAcataaagtataataatattgtaattttgtaaattaaattttgtaTTATACACTCTATTGTTGCACCATGTTATAATTATGTGTTGCTTCTCTTTGGTCATGATTGGTCATTATTTTTTGCTCAGGAAAACAAAATTAagcaatatgttaaataaaaatgctttaaatgttttgtttaaccctttttatattacaacttttcattttcagttgcCGTAATTATTTTAGATAATTGCCAagccaacattttttttactaatatttttgatttGATCATTGATTAATCTTGATTCTTTAGTTATAGGAGaatgaaacctgcaaaaacaataaatatgcaaatgaataaataaattagttgatCATTCCTTAAAATttctgtataaataaaacaataattaaattaatgcacaaataaataaatatattattctaGGAcagcacaatggctcagtggtcagcactgttgagtcgagtttgcatgttctccctgtgttgccgtGGGATTTCTCCAAGTGCTTCagtttctccacagtccaaagacatgtgcgatagatgaattggatgaactaaattgggcatagtgtatggctgtgtttgaatgagtgagtatggatgtttcccagctctgggttgcagttggaagggcatccgctgtgtaaaacatatgctggagaagttggcgactcattccgatgtggcaaccttgatgcataaagggactaagccgaagaaaaataaatgaatgaataaataaatatataaatctacaaattcctgcctaaataaatatataaatggttAGTAGTGTGggcagataaataattaaataaattacacagaTGTTGGGGGAATACGAAAACCTTAAACTGAAAGTTGTAtatgtttacatttatgcatGTGATCTACCTGATACAAAAAAACCTGCTGTATTAACAAAAAGAGAATAATGTATTTCAAATAATGTACAATTTCCAGTTCTtagtataaatatacatttattgatcAGAATTTATGGACCCGTATTCATGACAGTTTtagaaacatttaacatatgtatatataaaaacatttacacactTCAAAATAAAGGTTATTTACTGGCACTGATGATTTACTCAAAATATGTCAAAGAAAAGCCATGTGAAAAGGCATTTTTGTTTTTCCCTgcactgtttctttaagagtGTGCTTTTTCCAACtccctaaaacagacaatatgcACATTTTGCTTCATCGGGCACTTTGCTAACTCATCTTTCATATTTGATGAGCTTGACCTTTGGCCTTACAACACTGCAGCCTTTTTTCAGTGATAAGACTTCAGATGGGGATTCCTCCATTCTCACAACAGGGCGTTTGAGTTATATTTGCTGTCTGTTCAGTCACAGTTAGAAGATACtgatgttgtgtgttcagaaaggCGATTCCCACGAGTGCTGCATTCGAGTCATACACCTCTTGATTTGCTCATAGGAAACAAACATCACAATATTCCAGGATCCCAAGCGCAGGAAGGAGGGCATGAAGCTGTTGGGAATATGGAAacagtatttaatatatatttctcagtaaataatcatgtttttgtAATGGGGTTAAATCAGAGAAACACACCCATGCTTATCTACACCAAAACACATTCACTCAGGAGGGCAAGTGACAGTTTGTTATTATCAATGAGATtttgttattaatgtttattttaatgtatttatttatagtacATTTCTCATCTTTACAATGTAGTTTTTATGGTACTCCTGAAAATCTATGTGCATTGTTTATCGCCTTCAAAACACATTCACTTAGGATTGCAAGTGACAGTTTATTATTATCAGTgagattttgttattattaatgtttattttttttaatttattttaaaaatggttttatatctttatgtttttatatattcatGTTACTACTGCAAATATGTGTGCATCAGACCTGtgaaagttacatttaaagagatattatgcactattttgtttttattaatgattattttgatatttcttgttttaatttaaatgtgagTTGTTGAATTTAACCCCATCACTGTCACCCCACTTTCTGACGTCACacttaaacaaattattaaacaacaaattgactaagccgaaaagaaaatcaatgaattgaaatttggttaaaatataaaacagaaaatatatgtgggggatgggggggggtaattgttttatgttcaatccacttcaatttgtaaaaactaatacgtAACATAATTCCAGCTTGtcgtaaaacaaataaattgtgtggaacccagcattttttagtgttGACAAACTGGAAGCAGTGTTGATGGCGATTTTAATTTTCCATCCTTTTGCTGAACTGACAAATTTTGGACTGATGAATattgaattttacatttttttttaagttttactttttacattttaatgaaaatgttacAATAGGTTAAAttaaatgatcatatttaaaGTATGCTGCATGTGGTAAGTGATTCGTTTCTTTACTtatagtgagtaaacttgttgccttaaaattaggTAAAGTATGTACACAATTGTACAAATTCAATCAACACAACAGTTTCAAGttacttacttttttaagtaatgtcaactaatcacgttttacattgtttatatcagactgcaaaaaatgcagggttccactttattcattcatgttgtcccaacacacatAAATGAAATTTatatggattaaacataaaacaattaagtataGTTAAGTATAGTAAGTGTAGTTCAATATTTACTAAAGCgtttttaaaatccaaattcatgcttgctaacattagttaatgcactgagctAACACCAACAAACAATGAAGtttccattaactaatgttaagtaagatgaataaatactgtaataaatgtattgtttatgatTTGTCcatcactcaaaaaatgatttttcattattgttcaaactacttatttaaaatgagctataaCAACATATTACTGAGGGTTTGTTTGCgacaacttactttttttttttttttgtttaacccacttaaatttggaaaaactattatgttaactTGAtctgtgttaggacaacatatgTTTACTATACATTATTTCACTGAAAGTACActtaaaaatgatgtttgctgtttgtttaaagtacttatttaaaatgagctgaaacaacacaattcttaagggttttgtttgcaacaacttaattgcttcatgatcaatccacttaaatttgtaaaaacagttcacttaatttcttcatgttttcccaacatgTATTGATTGTGTTTTAGCCAGCATTTGTTAACAGTGTATGTTTGTATTTTACTCTCAATAATAGATTACAGTATGTTTTTCTCACCCCTTGTAGAAAGCGGCTGGTCCCTCTTTGGTCAGCATCATGAGGGCACAGTTCAGTGCGCTGCCGTACTGGCCGGCCGACGAGTTCATGAACCGCGTTTTCACCACGTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000097029

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00005434 False 266 lncRNA 0.46 3 36654197 36662600
TCONS_00006100 True 8415 lncRNA 0.32 1 36654197 36662611

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002944 NA coding downstream 3293 36642166 ~ 36650904 (-)
XLOC_002943 rsf1b.1 coding downstream 20271 36613004 ~ 36633926 (-)
XLOC_002942 NA coding downstream 43296 36595380 ~ 36610901 (-)
XLOC_002941 slc1a3b coding downstream 61711 36558804 ~ 36592486 (-)
XLOC_002940 nipblb coding downstream 107069 36475860 ~ 36547128 (-)
XLOC_002946 dnajb13 coding upstream 10776 36673387 ~ 36682522 (-)
XLOC_002947 mrpl48 coding upstream 21389 36684000 ~ 36691681 (-)
XLOC_002948 pimr137 coding upstream 57555 36720166 ~ 36726188 (-)
XLOC_002949 PLEKHB1 coding upstream 68428 36731039 ~ 36738642 (-)
XLOC_002950 dhrs13a.2 coding upstream 122145 36784756 ~ 36793412 (-)
XLOC_002939 NA non-coding downstream 184302 36465343 ~ 36469895 (-)
XLOC_002926 BX088524.4 non-coding downstream 490903 36163179 ~ 36163294 (-)
XLOC_002925 NA non-coding downstream 560664 35811752 ~ 36093533 (-)
XLOC_002955 BX323076.2 non-coding upstream 378467 37041078 ~ 37042232 (-)
XLOC_002957 CT573231.1 non-coding upstream 689869 37352480 ~ 37357303 (-)
XLOC_002958 NA non-coding upstream 755623 37418234 ~ 37476245 (-)
XLOC_002960 NA non-coding upstream 1066700 37729311 ~ 38025967 (-)
XLOC_002961 NA non-coding upstream 1202808 37865419 ~ 37889561 (-)

Expression


Co-expression Network