XLOC_002925


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002925
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 35811752 ~ 36093533 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00006093
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>TCONS_00006096
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>TCONS_00006095
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00006092 False 1778 lncRNA 0.40 3 35811752 35964401
TCONS_00006094 False 2687 lncRNA 0.41 6 35811752 36093493
TCONS_00006093 False 2210 lncRNA 0.41 5 35811752 36093493
TCONS_00006096 False 2607 lncRNA 0.41 5 35811752 36093533
TCONS_00006095 True 2170 lncRNA 0.41 4 35811752 36093533

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002924 ovca2 coding downstream 143168 35664129 ~ 35668584 (-)
XLOC_002923 NA coding downstream 157072 35650584 ~ 35654680 (-)
XLOC_002922 BX663516.3 coding downstream 191303 35620333 ~ 35620449 (-)
XLOC_002921 smg6 coding downstream 198000 35584647 ~ 35613752 (-)
XLOC_002920 si:ch211-244c8.4 coding downstream 269681 35537974 ~ 35542071 (-)
XLOC_002926 BX088524.4 coding upstream 69646 36163179 ~ 36163294 (-)
XLOC_002927 or109-13 coding upstream 111678 36205211 ~ 36207737 (-)
XLOC_002928 or109-11 coding upstream 119042 36212575 ~ 36214582 (-)
XLOC_002929 or109-7 coding upstream 123706 36217239 ~ 36220061 (-)
XLOC_002930 or109-6 coding upstream 127972 36221505 ~ 36223005 (-)
XLOC_002919 NA non-coding downstream 380097 35429504 ~ 35431655 (-)
XLOC_002917 NA non-coding downstream 490115 35312892 ~ 35321637 (-)
XLOC_002912 BX465844.1 non-coding downstream 647461 35160010 ~ 35164291 (-)
XLOC_002939 NA non-coding upstream 371810 36465343 ~ 36469895 (-)
XLOC_002942 NA non-coding upstream 501847 36595380 ~ 36610901 (-)
XLOC_002944 NA non-coding upstream 548633 36642166 ~ 36650904 (-)
XLOC_002945 AL845435.1 non-coding upstream 560664 36654197 ~ 36662611 (-)

Expression


Co-expression Network