LOC118942982



Basic Information


Item Value
gene id LOC118942982
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 64705596 ~ 64715802 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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>TU2018518
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GAGCTTCATGTTGGGCCCTCCTGGGTCTGATCCACACATCAGAGCTATGTTCAGGATCCCCAGTGTTATGGAACATGACCTAATAAACAGTTTTGCAAAGTTGTTGTTGTGGGGTTTTTTCCGTTCACttgcatcccccccccccgtttAGGATGAAAACGGTTTAGTCCACTGACTCCGCTCAGCTGTCCATCACACGCTCTCCATGACAATCACCACAGAATCCTCCTCAGCCAATGGGGTGTCTCCTGGGGCGGGGCTACACAGGGTTAGTCCctcccctgacccctgacctctgaccggACAGTCCAGGCTGTCATGGAGCTcgctcaccccctcctctccttcatcccctgcttcctccactccctcctcctcttcctcctcctcctcgtcttcctcaACCTGACAGCGACACACCTCGATGCCTGAGTCCCCGGTCAGACGGCGGTGGCGGTACTGACTCTCATCGGCCCCAActtcctcctgctcttcctcctcctcctctccctcgctcctgtAGGTGTGGGGGACAAGCTGGTACACGTCCACACAGGGGGAGAACAGGGTCTGCTTGGGGGGAGACTGGGTGGGcctgggggagacagggggaggagaggacaaggggaagactgggggaggagagcaggagggagaCACAGTCTCTGTCCGTTCCACTGCAAGAGCTCCAAGAGGATCAAAAAAGGCCTGAGCCTTTGGGTCTGAGGCTACAGGAgaagagactgggacagaggaggtaggggctggggaggctagggttagggtaggggctggggaggctagggttagggagagggcagagggggtAGGAGCTGgggaggctagggttagggtaggggctggggagagggcagaggggGTAGGAGCTGgagaggctagggttagggtaggagctggggagagggcagagggggtAGGAGCTGgagaggctagggttagggtaggagctggggagagggcagagggggtAGGCGCTTGGGCtggggagagggcagagggggtAGGCGCTTGGGCtggggagagggcagagggggtAGGGGTAcaagaggtggtggtggtaggggagGGGACAGCAGAGGTGGGTGTGGTAGGGGAGGGGACAGCAGAGGTGGGTGTGGTAGGGGAGGGGACAGCAGAGGTGGGTGTGGGGGAGGGACTGTGGGGACAGGATGGTCTGTCGTGGCCTGGATTGGTTAAAGGACAAGCAGTCCCAGCTAGAGGGTGTTCTGTTGTTGTAGCAACTAGAGGGTGTTCTGTAGACGTGGGTGAGGTACGAGAAGAGAGACGAGCTACATTAAAAACATCTGTCTCCATAGTAACAGTTTCCATGGTAGCACCAGGAAAGTAGTGCACCTGTGCAGGTTCTGTAGATTGTTCGCTTAAGTTGGTGTCGGCCTCTGAGGTTATAACAACAGTAAACGCATCAGCAACAACACCCATCCTGTTGCCTCCGGCAACATCCGCATCTGTCTCTGAAGATACAGAGACAATCATCTCCGAGGATGTTACCGTGGCAACTGTCTCCAAGACAACAGCAGCAGTGTTCTCTGCAGCGTATTGGGACAGTGTTGTGGGCGTGGAAGCACGGCTTGTGTCGGTCTCGTAGGTGCTACAGGGAGATGACGGACAGCAAGAGTCACAG

Function


NR:

description
PREDICTED: WW domain binding protein 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XR_005038739.1 False 2868 mRNA 0.44 2 64710482 64713731
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TU2018516 False 7627 lncRNA 0.50 9 64705596 64715802
TU2018517 False 6777 lncRNA 0.49 14 64705596 64715802
TU2018518 True 6663 lncRNA 0.49 12 64705596 64715802

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110510008 LOC106562799 coding upstream 130381 64547942 ~ 64579984 (+)
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LOC110517355 NA coding downstream 92921 64806646 ~ 64842255 (+)
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G1762021 NA non-coding downstream 53450 64767181 ~ 64767393 (+)
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G1761231 NA other upstream 292301 64417437 ~ 64418064 (+)
G1760941 NA other upstream 1158873 63549905 ~ 63551492 (+)
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G1762135 NA other downstream 153691 64867422 ~ 64867665 (+)

Expression



Co-expression Network