si:ch73-265d7.2


Basic Information

Item Value
gene id si:ch73-265d7.2
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 63363590 ~ 63372213 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021578351.2
ATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGAATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGAATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGAATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGAATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGGCCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAATGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACTGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGAAGGATGTAGTCTAGGTAACGGTGGGGACCTGTTAACAGTCCATAATGTAAAGAGGAGGATGTAGGCTAGGTAACGGTGGTGAAGGGGTGTGTCGTGTCATTTCGGGGTTCCTCGTCTCCAGGGGTAACTCAGCAGAATGTGTGACATCACAGCGTTCTTGTTTATAACCTAACCCCTGCTCAGTTCACATACAGACACATCCTGACTCTACAGGATAAAGAAGAGATCTTAGACGAACCAGGAAAACAACATTAAAGGATCCTAAAGAGTACTTTAAAACAACTTTTAGGAAACAGTAACCGGTTGGATTACTACTCGAAGAGACAAGGAATTGTTTTTCCTACGGATTCCactcagtattattattattatctactCTCCTGAAGAACAATATCATTTATTATTTTGAcctttctttttgtttttttactttttCTTCTCAAACAAAGATGGCtgcttcatcttcttcttccacccgtacccttctcctcctcatcctcctctcctctctgtcactgaGTGTGGAGTCTCGACTCTCGTCCCAACCCTCGCCCCGACCATCACCTCGGAAACACGACACACAGGTACTAGATAATCTCTTCAGCGCTCAGCTCCGCTCTCTGATCCTCAACCAACCAGACATCACCTCTGAAGGTTCCACTTCTGGCCCCTCCCATtcctaccatcctccctcccaggGATTGGCTGGTCGTGGCATGGGGGCGGGTCCTGTGGTCCCCAGGTTGTTCCTAGACTTTCTGCGCCAACAGAGGATGTTCCGTGGTCGGAGCAGGAAGAGCGCCACCGCCAGGGGATGCTTCGGCATGAAGGTGGACCGCATCGGATCTATCAGCGGTCTGGGATGCTGATTGGACAACCGCCAGTGGCCTTGTGTTCTGATTGGCTACCTTTCACCCCACTACTTCCTGGGTGTGTCAGAGACCGAGGGAAGGCTGGGAGATCTCTAACTGACAGACAGACGGATGTAACATTCCCACCCGTTGATATCTAACCGCTGAACTGTGATCCTGTGTGACTGTAGAGGTCATCTCCCAAAACCCCAAGTGACCTATAGGTGTTCTGAGGCTTCCATGTGAGAGCTGATACTAATGACCTTTGACCTCTAACCACTGGCTCTGTTACAGCCAGTACAACTAACCTatggggtgtgtgtttgtgtataatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatataatgTGGGTGTATAATGTTTGTCATTCCATTGTATCCATGTATAACCTGACAGGCCTTCTGTTGTGTAAACTGAGACCAACATGTGTCAAACATGTTTACATCTTCCCTGTAACACGCTACCAGTAACACGCTACCAGGACctgctgtgtgttctactgtctgttctCTGTAACATGTTAACTGTGTATTAGTCTGATATGATTTACATATATCACTGTCAGTGGATCAGGACTGGGCTCAAATCAGACTTCAATACAGTGAATGATTTAATGAATCCATCATTCTGGTACTGAAAGCTGAATTGGCCCCAACCCTGAGTCCATATGGATGAAGAGAAGGGTTTATATCTACATGCTGGAAGTCAAAGAACTTGTACTAGACTAAACAAGTTCCTGTTTCTCTGAAATAATAAAACAGCTCTGGTCCTCCTGTT
>TU2016837
CCTGACTCTACAGGATAAAGAAGAGATCTTAGACGAACCAGGAAAACAACATTAAAGGATCCTAAAGAATGGCtgcttcatcttcttcttccacccgtacccttctcctcctcatcctcctctcctctctgtcactgaGTGTGGAGTCTCGACTCTCGTCCCAACCCTCGCCCCGACCATCACCTCGGAAACACGACACACAGGTACTAGATAATCTCTTCAGCGCTCAGCTCCGCTCTCTGATCCTCAACCAACCAGACATCACCTCTGAAGGTTCCACTTCTGGCCCCTCCCATtcctaccatcctccctcccaggGATTGGCTGGTCGTGGCATGGGGGCGGGTCCTGTGGTCCCCAGGTTGTTCCTAGACTTTCTGCGCCAACAGAGGATGTTCCGTGGTCGGAGCAGGAAGAGCGCCACCGCCAGGGGATGCTTCGGCATGAAGGTGGACCGCATCGGATCTATCAGCGGTCTGGGATGCTGATTGGACAACCGCCAGTGGCCTTGTGTTCTGATTGGCTACCTTTCACCCCACTACTTCCTGGGTGTGTCAGAGACCGAGGGAAGGCTGGGAGATCTCTAACTGACAGACAGACGGATGTAACATTCCCACCCGTTGATATCTAACCGCTGAACTGTGATCCTGTGTGACTGTAGAGGTCATCTCCCAAAACCCCAAGTGACCTATAGGTGTTCTGAGGCTTCCATGTGAGAGCTGATACTAATGACCTTTGACCTCTAACCACTGGCTCTGTTACAGCCAGTACAACTAACCTatggggtgtgtgtttgtgtataatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtatataatgTGGGTGTATAATGTTTGTCATTCCATTGTATCCATGTATAACCTGACAGGCCTTCTGTTGTGTAAACTGAGACCAACATGTGTCAAACATGTTTACATCTTCCCTGTAACACGCTACCAGTAACACGCTACCAGGACctgctgtgtgttctactgtctgttctCTGTAACATGTTAACTGTGTATTAGTCTGATATGATTTACATATATCACTGTCAGTGGATCAGGACTGGGCTCAAATCAGACTTCAATACAGTGAATGATTTAATGAATCCATCATTCTGGTACTGAAAGCTGAATTGGCCCCAACCCTGAGTCCATATGGATGAAGAGAAGGGTTTATATCTACATGCTGGAAGTCAAAGAACTTGTACTAGACTAAACAAGTT

Function

NR:

description
C-type natriuretic peptide 2-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021578351.2 False 5563 mRNA 0.44 2 63363590 63372213
TU2016837 True 1224 TUCP 0.48 3 63367706 63372171

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500814 LOC100194636 coding upstream 19976 63329511 ~ 63343614 (+)
pfn1 prof1 coding upstream 46069 63307806 ~ 63317521 (+)
LOC118942976 NA coding upstream 125283 63232777 ~ 63238307 (+)
LOC110500912 LOC105006398 coding upstream 140491 63162215 ~ 63223099 (+)
LOC110500812 LOC106608392 coding upstream 271922 63071618 ~ 63091668 (+)
LOC118942978 NA coding downstream 159522 63528908 ~ 63534562 (+)
LOC110503296 LOC106592207 coding downstream 236458 63608671 ~ 63655491 (+)
zgc:158659 pik3ca coding downstream 291810 63664023 ~ 63813757 (+)
ctc1 LOC106595900 coding downstream 460342 63832555 ~ 63879982 (+)
tfr2 LOC106592655 coding downstream 520981 63893194 ~ 64066184 (+)
G1760852 NA non-coding upstream 8060 63347266 ~ 63355530 (+)
G1760851 NA non-coding upstream 15583 63344035 ~ 63348007 (+)
G1760848 NA non-coding upstream 23288 63339896 ~ 63340302 (+)
G1760824 NA non-coding upstream 27919 63281396 ~ 63335671 (+)
G1760841 NA non-coding upstream 38485 63323857 ~ 63325105 (+)
G1760858 NA non-coding downstream 2956 63375169 ~ 63419796 (+)
G1760865 NA non-coding downstream 24059 63396272 ~ 63418259 (+)
G1760873 NA non-coding downstream 58141 63430354 ~ 63430710 (+)
G1760859 camta2 non-coding downstream 62964 63435177 ~ 63449067 (+)
G1760876 NA non-coding downstream 63601 63435814 ~ 63438049 (+)
G1760800 NA other upstream 147837 63210133 ~ 63215753 (+)
LOC110500813 tsc22d4 other upstream 335150 62991115 ~ 63050683 (+)
LOC110500953 LOC106594432 other upstream 474552 62873681 ~ 62903536 (+)
G1760587 NA other upstream 549349 62811775 ~ 62814241 (+)
G1760504 NA other upstream 621771 62689513 ~ 62741819 (+)
G1760941 NA other downstream 177692 63549905 ~ 63551492 (+)
G1761231 NA other downstream 1045224 64417437 ~ 64418064 (+)
LOC110500801 LOC106608413 other downstream 1362495 64734656 ~ 64754522 (+)

Expression


Co-expression Network