XLOC_036495 (CR376741.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_036495
gene name CR376741.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 27203326 ~ 27206934 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00071308
accatagatttagattaattaatgttaagtcttattttactcttattatatttatctgtttttcagctacaataattgatgttgaaaaactgatgctaccaatcactcctcactttattattcaagcccagattgtgatggacctggaatgcgacaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggagggatttgcagccaaacttactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacacattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcatttggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtatttttacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctttgttatattgaattattgctactgttttagcatggtttacacaataaacctttattgtgaa
>TCONS_00071309
tcgacctgcaggcaacggctctcctaatttgaaattcacctgtcgtctttcatccagcgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcgaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaccgttaagctacaataattgatgttgaaaaactgatgctaccaatcactcctcactttattattcaagcccagattgtgatggacctggaatgcgacaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggagggatttgcagccaaacttactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacacattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcatttggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtatttttacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctttgttatattgaattattgctactgttttagcatggtttacacaataaacctttatt
>TCONS_00071310
gaagggacagttcaccccaaaatgaaaataatagcatctttggcatcctccacttgtttcaaaatagttatatatttaatttgttccgttgaacacaaactcgtattttttaaagaaatttggttcaaatatggatgtcaatagttactggttactaacattcttcaaaatatctgctttagtgtttaacagaaattcaaactagtttaaaacacatggagtaaatagtggcaaaatagtaaactattcctttaaatattttattctgagacttttatttatatgtgtcttgtcttttgtcatattgtccttctagcccagattgtgatggacctggaatgcgacaccagttactcttaagacaagaaccgaataaagcacagatgtggagggatttgcagccaaacttactggagggaaggaacctttagtgtgggtgaacatactacctggatgtccaacaaaggctgcacaagagctcatttgatagcacacattctgtcctgtctacatctctgatgacctggaagtgcttcgacatcagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtccctttccacatcatttggccttcatcatttcctgtcttgtagcagtatttttacctgtttttaaaattgtaataatttttgatgcattaattgttgactggttttaatgatcaattgtttattagtgttctgttgctttgttatattgaatt
>TCONS_00071311
cacaacactgagatgaaggcgaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaccgttaagctacaataattgatgttgaaaaactgatgctaccaatcactcctcactttattattcaagttcctaagataaaaaaaatctggtgttaaaacagccacggctatgctatttgcctaccaagtgctgagtaaatattagacaaacatttttttctataactgttgtctttgtgtttattagcaattttactgggcgtatgtgttttttttttttcaaacagcctggaaactgtaagtttagttcaatatgttattttatgctattcatttttgtcttaacatggattgcatgttgaagctatcgttttatagtgggaaaatgtaaaagagaatcactgaatacaatggcataatgattctgcttgttcaaagaaggtacttgatttagttttcctcaagcgacacatcagtttttatgactattgcttgacacttgaattgaagggacagttcaccccaaaatgaaaataatagcatctttggcatcctccacttgtttcaaaatagttatatatttaatttgttccgttgaacacaaactcgtattttttaaagaaatttggttcaaatatggatgtcaatagttactggttactaacattcttcaaaatatctgctttagtgtttaacagaaattcaaactagtttaaaacacatggagtaaatagtggcaa
>TCONS_00071312
caacggctctcctaatttgaaattcacctgtcgtctttcatccagcgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcgaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaccgttaagctacaataattgatgttgaaaaactgatgctaccaatcactcctcactttattattcaaggtaatgttgatgtcttcctcattttgattagatttttaaatgtcaagttgttcacagatttgttgtgaggagtttcatgtacaacctctttttcttcttccagcagttcctaagataaaaaaaatctggtgttaaaacagccacggctatgctatttgcctaccaagtgctgagtaaatattagacaaacatttttttctataactgttgtctttgtgtttattagcaattttactgggcgtatgtgttttttttttttcaaacagcctggaaactgtaagtttagttcaatatgttattttatgctattcatttttgtcttaacatggattgcatgttgaagctatcgttttatagtgggaaaatgtaaaagagaatcactgaatacaatggcataatgattctgcttgttcaaagaaggtacttgatttagttttcctcaagcgacacatcagtttttatgactattgcttgacacttgaattgaagggacagttcaccccaaaatgaaaataatagcatctttggcatcctccacttgtttcaaaatagttatatatttaatttgttccgttgaacacaaactcgtattttttaaagaaatttggttcaaatatggatgtcaatagttactggttactaacattcttcaaaatatctgctttagtgttta

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095393

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00071308 False 587 processed_transcript 0.36 4 27203326 27206090
TCONS_00071309 False 643 processed_transcript 0.40 6 27203331 27206934
TCONS_00071310 False 730 processed_transcript 0.35 3 27203373 27205479
TCONS_00071311 False 729 processed_transcript 0.32 3 27205246 27206559
TCONS_00071312 True 848 processed_transcript 0.33 3 27205292 27206922

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_036494 CR376741.3 coding downstream 2162 27183274 ~ 27201164 (-)
XLOC_036492 CR847799.1 coding downstream 224247 26977429 ~ 26979079 (-)
XLOC_036491 NA coding downstream 232200 26967436 ~ 26971126 (-)
XLOC_036490 slc16a1b coding downstream 241547 26923613 ~ 26961779 (-)
XLOC_036489 zmynd12 coding downstream 284810 26902358 ~ 26918516 (-)
XLOC_036496 TAFA3 coding upstream 154753 27361687 ~ 27515540 (-)
XLOC_036497 NA coding upstream 344290 27551224 ~ 27574083 (-)
XLOC_036498 AL954868.1 coding upstream 389501 27596435 ~ 27606953 (-)
XLOC_036499 mov10b.2 coding upstream 423758 27630692 ~ 27656765 (-)
XLOC_036500 mov10b.1 coding upstream 452310 27659244 ~ 27687095 (-)
XLOC_036486 NA non-coding downstream 502991 26685829 ~ 26700335 (-)
XLOC_036483 NA non-coding downstream 834960 26329253 ~ 26368366 (-)
XLOC_036501 BX664731.1 non-coding upstream 521036 27727970 ~ 27728086 (-)
XLOC_036503 NA non-coding upstream 962203 28169137 ~ 28228356 (-)
XLOC_036506 BX664742.1 non-coding upstream 1087542 28294476 ~ 28295796 (-)

Expression


Co-expression Network