G1753124


Basic Information

Item Value
gene id G1753124
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 55071557 ~ 55074587 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2007306
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>TU2007307
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>TU2007308
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>TU2007309
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2007306 False 2986 lncRNA 0.38 2 55071557 55074587
TU2007307 False 3008 lncRNA 0.38 2 55071557 55074587
TU2007308 False 3010 lncRNA 0.38 2 55071557 55074587
TU2007309 True 3009 lncRNA 0.38 2 55071557 55074587

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500741 LOC106595343 coding upstream 84562 54982792 ~ 54986995 (+)
ccdc96 ccdc96 coding upstream 103489 54966234 ~ 54968068 (+)
LOC110500744 grpel1 coding upstream 111555 54955547 ~ 54960002 (+)
LOC110500891 afap1 coding upstream 563280 54349344 ~ 54508277 (+)
LOC110500735 ablim2 coding upstream 728976 54206483 ~ 54342581 (+)
smim20 NA coding downstream 57381 55131968 ~ 55133176 (+)
LOC110500752 NA coding downstream 67637 55142224 ~ 55148988 (+)
LOC110500894 rbpj coding downstream 95789 55170376 ~ 55268660 (+)
LOC110500895 LOC106577483 coding downstream 275328 55349915 ~ 55429706 (+)
LOC118942953 NA coding downstream 381470 55456057 ~ 55473044 (+)
G1753144 NA non-coding upstream 427 55070931 ~ 55071130 (+)
G1753114 NA non-coding upstream 28244 55042885 ~ 55043313 (+)
G1753096 NA non-coding upstream 64621 54997956 ~ 55006936 (+)
G1753074 NA non-coding upstream 118376 54952931 ~ 54953181 (+)
G1753058 NA non-coding upstream 143531 54927746 ~ 54928026 (+)
G1753145 NA non-coding downstream 4706 55079293 ~ 55094050 (+)
G1753155 NA non-coding downstream 20165 55094752 ~ 55094964 (+)
G1753157 NA non-coding downstream 21150 55095737 ~ 55104444 (+)
G1753165 NA non-coding downstream 30656 55105243 ~ 55105629 (+)
G1753172 LOC100194703 non-coding downstream 45210 55119797 ~ 55120218 (+)
G1753100 NA other upstream 59879 55001579 ~ 55011678 (+)
LOC110500722 NA other upstream 1814956 53251413 ~ 53256660 (+)
G1751699 LOC106608599 other upstream 2099174 52962449 ~ 52972383 (+)
G1750050 NA other upstream 2874550 52191200 ~ 52197007 (+)
LOC110500754 LOC106591080 other downstream 516018 55590450 ~ 55592100 (+)
G1755158 NA other downstream 1311820 56386407 ~ 56387622 (+)
G1755570 NA other downstream 1719144 56793731 ~ 56794574 (+)
G1756789 NA other downstream 2851893 57926480 ~ 57928244 (+)
rwdd rwdd4 other downstream 3330697 58405236 ~ 58411726 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
bowfin (Amia calva) AMCG00017611 NA coding CM030131.1 CM030131.1 13446501 ~ 13474811 (+)