G1756670


Basic Information

Item Value
gene id G1756670
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 57853888 ~ 57856734 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2011369
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>TU2011370
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>TU2011381
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>TU2011367
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>TU2011374
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>TU2011377
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>TU2011382
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>TU2011385
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Function

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2011369 False 2422 lncRNA 0.35 2 57853888 57856734
TU2011370 False 1509 lncRNA 0.32 3 57854791 57856634
TU2011381 False 1646 lncRNA 0.32 3 57854791 57856634
TU2011367 False 1499 lncRNA 0.32 2 57854874 57856634
TU2011374 False 1603 lncRNA 0.31 3 57854874 57856634
TU2011377 False 1536 lncRNA 0.32 3 57854874 57856734
TU2011382 False 1503 lncRNA 0.32 2 57854874 57856634
TU2011385 True 1432 lncRNA 0.32 3 57854874 57856634

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500761 LOC106608522 coding upstream 74 57766080 ~ 57853814 (+)
LOC118942955 NA coding upstream 621683 57212075 ~ 57232205 (+)
LOC118942812 NA coding upstream 731964 57118735 ~ 57121924 (+)
LOC110500755 LOC106608544 coding upstream 1398860 56238529 ~ 56455028 (+)
LOC118942793 LOC106608538 coding upstream 2259226 55592334 ~ 55594662 (+)
zgc:194930 LOC106608523 coding downstream 9238 57865972 ~ 57896896 (+)
per1b LOC106608520 coding downstream 113574 57970308 ~ 57986158 (+)
LOC118942956 NA coding downstream 124049 57980783 ~ 57981771 (+)
pcolceb pcolce coding downstream 139894 57996628 ~ 58020445 (+)
lrch4 lrch4 coding downstream 227616 58084350 ~ 58141118 (+)
G1756706 NA non-coding upstream 10050 57842017 ~ 57843838 (+)
G1756702 NA non-coding upstream 20702 57831642 ~ 57833186 (+)
G1756688 NA non-coding upstream 62657 57790908 ~ 57791231 (+)
G1756655 NA non-coding upstream 95872 57757675 ~ 57758016 (+)
G1756630 NA non-coding upstream 119756 57733915 ~ 57734132 (+)
G1756755 NA non-coding downstream 41011 57897745 ~ 57898605 (+)
G1756781 NA non-coding downstream 57093 57913827 ~ 57915007 (+)
G1756791 NA non-coding downstream 73308 57930042 ~ 57931556 (+)
G1756821 NA non-coding downstream 136625 57993359 ~ 57994768 (+)
G1756829 NA non-coding downstream 143908 58000642 ~ 58001118 (+)
G1755570 NA other upstream 1059314 56793731 ~ 56794574 (+)
G1755158 NA other upstream 1466266 56386407 ~ 56387622 (+)
LOC110500754 LOC106591080 other upstream 2262748 55590450 ~ 55592100 (+)
G1753100 NA other upstream 2842210 55001579 ~ 55011678 (+)
LOC110500735 ablim2 other upstream 3546398 54206483 ~ 54342581 (+)
G1756789 NA other downstream 69746 57926480 ~ 57928244 (+)
rwdd rwdd4 other downstream 548550 58405236 ~ 58411726 (+)
G1757578 NA other downstream 826403 58683137 ~ 58686523 (+)
G1758801 NA other downstream 2465481 60322215 ~ 60326620 (+)
G1758818 NA other downstream 2494912 60351646 ~ 60353092 (+)

Expression


Co-expression Network