LOC110501915 (LOC106582460)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110501915
gene name LOC106582460
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 44381552 ~ 44438653 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036959386.1
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>XR_005038842.1
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>XM_036959384.1
TCAAGCTGATGATCTCTGGGATGCGGCATGCCGGGATATCTTCCCTGTGAAAAAGCACTTGCTTGTACTTTTAAAGCTCGTGCACGAGCCTGTGCTATGTGCGCGCGGGCAAAGCGTGGATTTATATTGAATTGTAAAACACCGCACTTGCGCGGATGCAGCATAGGAGTCTGTCTGCTCGTTGGTTTCAGGTGTCTGGCCATCAACTTCCATTCGCCCCGCGCCCGATGCTGCAAGAGTCATCTCCCCCACTGACTGGATACATGAAGACTTTCCCGTGAACGACATCTCCCCCGCTATAACGGGCCGGAAGATAATTACTGCGTTGACGTGTTGATATACATATATTTAAAATATCAAATATGAATCATGCATTTGATATTTCTAGCAAATTTGCTCGTGAGCATCCTTGCAGCCGGACTCCATTCATCCATAGCATCAATCGgaggagagaatgaggtgGTGGAGAGAGACGCAGAACCATTATTGTCGGAGCGAGAGGCAACTGCAGCAGCGGCCACAGACAACACAAGTCACAGTGCGGCTGAGCATGTGATCACTTACCCCTCTCGGCTCATCTATTACCTGAAGGAGGACTCAGAGAGCACTTATCATGACCTGGACACCCGGGCTAGAAACCAGGGCACAGAGGGTCATGACCAGGCAGTCCATCTTGCCCAAGCCAGTTTCCAGTTAGATGCCTTTGGCTCCAAATTTGTACTGGACCTAACGTTAAACAATGACTTGTTGTCGGCGGATTATGTGGAGATCCACTATGAGGAGGGTAAACCTGTTCTATCGAAGGGTGGTGAACACTGTTACTACCACGGCCAGGTGAGGGGGAAAGATGATTCCCACGTGGCCTTGTCTACCTGCAATGGGCTGCACGGAATGTTTGACGATGGACTCTATCTCTATATAATGGAGCCTTTGCAACAGACTCACTCAATTGATACAGCCGCACGGCCCCACTCACTGCGCAGGATGCCCAGCCTCCAGTGGAACAGTGACTCCGAGGAACTGGTGAAGGACGAGCGGCTGCTTTCGGAGCTGGACGACATGTCCTGGCTGAAGCGCAGGAAAAAGCGGGCTATGCCTAGGAATGTATTTGAGGAGATGAAGTATTTGGAGATTATGATCGTCAGTGACCATAATATGTATAAGCGACTCAAGACCAAGCAGCACACCAGGAACTCTGCCAAGTCAGTGGTGAACCTTGTTGATGCTATCTTTAAGGAGCACCTGCACACACGGGTGGTTCTGGTTGCCGTGGAGATCTGGTCGGACAAGGACCCGATTCCCATCAGTGTGAAGCCTCTGGACATGCTGAAAGATTTCTCTAAGTACCGGGCGCAGAGCATCAAGCAACACGCTGACGCTGTGCACCTCTTCTCCAATGTGACCTTCCACTATCGCCGAAGCAGTGTAGCGTACTTCGGGGGCATGTGCTCTGTGAGCCGTGGAGTAGGGGTCAACGAGTATGGCACCACATGGACTATGGCTTCGTCACTCTCCCAGAGCTTGGCACAGAACCTCGGCATCCAGTGGGATCCAGCCGCAAAGAGAAAGGAATGCGGCTGCTCTGACTCCTGGGTGGGCTGCATTATGGAGGATACCGGGGTCCAGCATCCCCGGAAGTTCTCCAAGTGCAGCATCTCAGACTACAAGGAGTTCCTGCTGAAGGGCGGTGGATCATGTCTCTATAACAGGCCGACCAAGCTGTTTGAATCTACAGAGTGTGGGAATGGATACATTGAGGTGGGAGAGGAGTGTGACTGCGGAGATAGAACAGAGTGCTACAAGGACTGCTGTAAGAAGTGTTCCCTAGCTAATGGTGCACATTGCGCTGACGGACCTTGCTGCAACAACACTTGTCTGTTCTACCCACGTGGTTACAGTTGTCGCTATGCGGTGAATGACTGTGACATCTCAGAGACATGCTCAGGAGACTCTGGCCAGTGCCCTCCCAACCTCCACAAACAAGATGGCTACCAATGTCAAGTCGACCAGGGGCGCTGCTACAGCGGAGAGTGTAAGACCAGAGGAAACCAGTGCAAATATCTCTGGGGCCCAAAGGCGGGCGGGTCTGAGAAGTTCTGCTACGAGAAGCTAAACACAGAAGGAACCGAGAAGGGTAACTGTGGAAAGGATGGAGATAAGTGGCTCCAGTGCAGCAAGCATGATGTGTTCTGTGGGTTCCTGCTGTGCAGTAACATCGGACACAACCCCCGCATCGGCATGATGAAGGGAGACATCACTCGTACCACCTTCAACCATCAGGGCAGGCCGGTGAACTGCAGtggtggCCATGTTCTTTTGGACGATGAGACGGACTTAGGCTACGTGGAGGACGGAGCGCCCTGCGGGCCGTCCATGATGTGCCTTGACCACAAGTGTCTGCCCATCCAGTCCCTCAACATGAGCACCTGCCCCAGCGGGCCCAACGGCCAGGTGTGCTCATCCCATGGGGTGTGTAACAACGAGGCGTCGTGCACCTGTGACACCACCTGGGCGGGGACTGACTGCAGCATGCCCGACCCTCCCAAGGAGCCTGCACCCACAGAAGACGAAGAACCAAAAGGTCCTAGTGCCACCAATCTTATAATAGGCTCCATCGCCGGCGCCATCCTGGTGGCTGCCATAGTGCTGGGGGGGACCGGATGGGGCTTTAAAAATGTGAAGAAGCGAAAGTACGACCCCAACGCCAGCGCCATATAAGGTTGGAGGAGAGGTCAGCGGGCACAGAGGAAACCTTCTGGGCTTCCTTAGTACTCTACAGCTGGACTGCACTTAACTGCGGAGGATTTTTTGGGCATTAGATTTACTTGAAAAATACATAGAGGACAATTTAACATTATCCATTTTAGTCATGTAGAGATGTAGCCTTTTTCAACCCTAACAACCCACCTAACAACCCCAACCACCTACCTAACAACCCACCTAACAACCTCACCCACCTACCTAACAACCCAGCTAACAACCCCACCAACCTACCTAACAATCCACCTAACAGTCCCACCCACCTACTGAACAACCCACCTAGCAACCTCACCCACCCACCTAACAACCCGACTCACCTAACAACCACACCCACCCACCTAACAACCCCACTCACCTAACAACCACACCCACCCACCTAACAACCCCGCTCACCTAACAACCACACCCACCTACCTAACAACCCCACTCACCTACCTAAAACCCCACTCACCTACCTAACAACCCCACCCACCTACCTAACAACCCCACTCACCTACCTAACAACCCCACTCATCTACCTAACAACCCCACTCACCTACCCAACAACCCCACTCATCTACCTAACAACCCCACCCACCTACCTAACAACCCCACCCACATACCTAACAACCCCACCCACCTACCTAACAACCCCACCCACATACCTAACAACCCCACTCACCTACCTAACAACCCCACTCATCTACCTAACAACCCCACCCACCTACCTAACAACCCCACCCACATACCTAACAACCCCACTCACCTACCTAACAACCCCACTCATCTACCTAACAACCCCACTCACCTACCTAACAACCCCACTCATCTACCTAACAACCCCACTCACCTAACTAACAACTCCACTCACCTAACTAACAACCCCGCTCACCTAACAACCACACCCACCTAATAACCCCACCCACCTCCCTAACAACCCCACTCACCTAACAACCACACCCACCCACCTAACAACCCCACCCACCTACCTAACAACCCCACTCACCTAACAACCACACCAATGGCGGACTGGCCGTCAGGAGCCCCGGGACATTCCCGGTGGCCTGAGGGTCGTTTGGGACTGCCGTGAATAGTCAACTTGACCAGCGATAATATAGCAAGCAGGAATTAGTTGACGGAGAATCCACGAATCAGGCGCGACTCTCACACTCTTGCTGCAGTGTCCCAGTGCCAAAAATGACCTCAGGTCTCTCCACGACGCACATAGCAACCGTCTACCTGCTTCTCTACCGATAACATTTTAGACAAGTCGTCCGGCGAAATGGTCAGAAAGGGAAAagtggagcagagagggagagaataaaaaACAGAAAGGCCCTTGCCACAGTCAAAAACActagctaaaacacacacacactgacacacacacgtcacCCAGCATGGCTAGCTAAGTAGCCTAGCTAAAAATAGTGACACAATGGCAGGTAGGCTAAACAGTTTGCACGTCTTACGTCTTCGTGGAGGAATTATATCACAGCAATGAGTGCAACATAGCGATCATAATATGACATTGAAGGCAATATGTTTCAACTAGTAAAACATAATAAACCTAGATTATGGACTTGCCAGGATTCGGTCATGACTCATGGCCACATAAGCGAGGGAAAGTGCACATCCACTGTACAGTGAAACAGGCTACAGTAACCTAACCATAATGCATCCATGAACATAACACAGTGGCCTGTGTGACACAGCACAAAAGATCATTAGCGCCATTAGTACCAGCATTACAATTTACTACGATAATATACAGCTCTGGGGGAAAATTAAGAGACCACTCCAAATTAAGAGACCACTCCAAATTAAGAGACCACTCCAAATTAAGAGACCACTCCAAATTAAGAGACCATTCTTAATTTTTCCTAGAGCTGTATTAATGTAGCCTACTGATACACTAATGATAGTGAGTATGATAATAGAGTATTTTCTTTGTAAAGGTGGAGGAAGGAAGCAGCAGCACTAGAGTTTCAGGTGCTCCTGCTGAACTGGAGGAACTGGAGGAACTAGTGGTCAGTTCAGAGTCAGACTCAGAGCAGGAACCTTCAGCTACAACTTAAGAGCACAACCCTAAACATGTAGGTTATGATTTTAGATTAATATGTGCTTTATTTATGAGATTATCAGTAGGACTGTAATCGGGGGCCATACCTTGTACATTTGTATGTGCTATGATTGGTGTATTCCTAGAGCGTTTATGAGGGTGCACCCATAGCCATAGCATACCTTGAGAACTCAGTGTT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Function


NR:

description
PREDICTED: disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 23-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K06837 ADAM23; disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 23

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036959384.1 True 5299 mRNA 0.50 26 44381553 44438653

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110502169 LOC106582455 coding upstream 59481 44148629 ~ 44324651 (+)
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LOC118943610 LOC106576908 coding upstream 402325 43976015 ~ 43979227 (+)
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G1813588 ino80d other upstream 9629 44362661 ~ 44371923 (+)
G1813442 NA other upstream 270685 44108244 ~ 44110867 (+)
G1812953 NA other upstream 1231168 43149762 ~ 43150384 (+)
LOC110502157 LOC106582435 other upstream 1645685 42688215 ~ 42735867 (+)
G1813665 LOC106582464 other downstream 59804 44498457 ~ 44508051 (+)
G1814811 NA other downstream 671894 45110547 ~ 45111229 (+)
LOC110501942 atp5g2 other downstream 734322 45172891 ~ 45175477 (+)
LOC110502177 LOC106582482 other downstream 1083267 45521920 ~ 45527893 (+)

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