G2022919


Basic Information

Item Value
gene id G2022919
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048590.1
NCBI id CM023244.2
chromosome length 51113553
location 33551655 ~ 33556519 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2313745
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>TU2313747
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2313745 False 4731 lncRNA 0.39 2 33551655 33556519
TU2313747 True 4731 lncRNA 0.39 2 33551655 33556519

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118944422 NA coding downstream 162710 33386852 ~ 33388945 (-)
nucb2a LOC106562318 coding downstream 383427 33159342 ~ 33168228 (-)
LOC110506670 LOC106587508 coding downstream 625388 32900561 ~ 32926267 (-)
LOC110506665 polr2l coding downstream 720540 32829426 ~ 32831115 (-)
LOC110506664 sdhaf2 coding downstream 725906 32823041 ~ 32825749 (-)
LOC100136595 calc1 coding upstream 244815 33800216 ~ 33815643 (-)
LOC110506676 pde3b coding upstream 289491 33846010 ~ 33927989 (-)
LOC110506684 LOC106587537 coding upstream 557990 34109965 ~ 34118269 (-)
LOC110506685 rbtn1 coding upstream 596157 34152676 ~ 34184095 (-)
LOC110506117 LOC106587539 coding upstream 797254 34353773 ~ 34358034 (-)
G2022946 NA non-coding downstream 10469 33540295 ~ 33541186 (-)
G2022939 NA non-coding downstream 18709 33529367 ~ 33532946 (-)
G2022813 NA non-coding downstream 232583 33317910 ~ 33319072 (-)
G2022728 LOC107586033 non-coding downstream 368372 33179733 ~ 33183283 (-)
G2022726 NA non-coding downstream 377985 33173364 ~ 33173670 (-)
G2023003 NA non-coding upstream 93012 33649531 ~ 33649738 (-)
G2023004 NA non-coding upstream 95558 33652077 ~ 33652482 (-)
G2023005 NA non-coding upstream 96242 33652761 ~ 33653318 (-)
G2023013 NA non-coding upstream 107291 33663810 ~ 33664136 (-)
G2023017 NA non-coding upstream 110815 33667334 ~ 33667543 (-)
G2022042 LOC106562320 other downstream 672884 32875255 ~ 32878771 (-)
G2021975 NA other downstream 717174 32831627 ~ 32834481 (-)
G2021979 NA other downstream 732675 32810623 ~ 32818980 (-)
G2021956 NA other downstream 834742 32716126 ~ 32716913 (-)
LOC110506653 LOC106563521 other downstream 966296 32528233 ~ 32585639 (-)
LOC110506691 LOC106562361 other upstream 944334 34499589 ~ 34523950 (-)
G2024673 NA other upstream 1319903 34876422 ~ 34928381 (-)
G2024949 NA other upstream 1839555 35396074 ~ 35399967 (-)
G2025061 NA other upstream 1939268 35495787 ~ 35497803 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) G56929 NA non-coding CI01000009 null 8712932 ~ 8714027 (-)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G47901 NA non-coding NC_035901.1 CM008304.1 38671555 ~ 38672278 (+)