XLOC_004525 (BX548028.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_004525
gene name BX548028.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 7865470 ~ 7870791 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00009020
GTGAGACGAGCTGGATTGTGACTGGTGCGCTAATGGCGGAAGGTAGTGTGGATTCCGGAAGTGATCCGGAAATGGAGGAGGAGAGGGTAGACGGAGATAGTGGAGGTAATGCTAGTAATGAATGGAGCGTTGTAGAAAAtcgtaaaagaaagaaaagttggGCACAAATATCTGAATCGGACAGCGAAAAGGGAAGTCACCAGGCGAGAAGGAGAAGAGAAGAGTATAAGGTAATGCTGAAGTTTGCTAGCGACTCTGTGAATACCATCAATCCTTTGAAGCTTACAAAAACTCTTAAAGAAATGTTAGGAACGATTGAGAGTGTTAAGACCTTGAGAGACGGGAAAATGATTATATACTGTAAAGATCATAAGCAACAGAAGATGGCCTTGGCTATGAAGACATTATTAGGGCATAAAGTAATATGTTCtatcccagaagaaaaaaaatggattaGAGGAGTAATAACAGGAATCCCTACTGATGTTACAGTTGAGAAAATAAAACGAAATATCACTGGGGCAGCAGTAAAAGAAGTCAAACGACTAAAATGCGTTAGAAATAACGAAAAAGTAGACAGTCTGTCTGTAATGATTCATTTTGATGAAAACAAACTACCGGAAAGAGTGTACTTAGGATATTTGAGCTACAACGTTAGGCTATATGTCCCCCCGCCAATACGCTGTTACAAATGCCAAAAGTTCGGACACGTAGCGGCAGTTTGTAGAGGTAAACAGAGATGTGCGAGATGTGGGGGAGACCATGAGTATGGTAAATGTGGGCAGGAAGTAAAGCCAAGGTGTTGTAATTGTGGTGGGGAACACAGTGCGGGCTACGGAGGATGTCAAGTTAGGAAAAATGCTGTACAAGTCCAAAATGTCCGAATGTCTGAGGGAATCTCGTATGCTGAAGCTCTAAAGAAAGTTAAACAGACATCAAGAGAACCAGAAACCAGAGTAACAGAATCTCAACAAAAAGCAACGAtgaaagaacaaaataaagataATGAAGTATGTATTGACAAAGTATCGTTCGTCACATTTATAGCAGAAGTAGTTAATTGCTCTGCGCAGACGGAGAGCAGGACCGAGAGAATTAAAATTATCATCAGAGCTGCTTCAAAATATTTGGAATTAGAGGGTGTTACAGTAGATATGATAAACGATAGACTCAAGATACAATCAGGAACTAGTCAGACAGTATATAGTCAACCATGTGGAAGTATATAATGGTATTAACAATACTGCAGTGGAATGCAAGAAGCCTAATTGCAAACGGACAAGAATTTAAAAAATTCATAGTAGATCATGAAAATAGCCCTGACATCATATGTGTTCAGGAAACTTGGCTTAAGTCACATTTAGATTTTGTAATTAATGGATACACTTCGGTAAGAAAAGATAGAGACAAGTCTAATGGTGGTGGGGTagctacatttattaaacagagtatTGGGTATAGGGCAGTTGAGATCACTGGGGAACAAGAAGCTGTGGCAGTTGAAATATGCGATGGAACACAGAAAGTTagaataataaactattataatCCATGTGATAAATTAAGTAAGGACAATCTAGAACATATCCAAGGGAATGGAAATAATAAAATCGTGTGGTGCGGGGATTTTAATGCTCACAACACTTTATGGGGGAGTAAAAAAACAGATTACAATGGACTAATTATAGAAGATATGCTGGATTGGGGAGGATTAGTATGTATCAATGATGGAGGTTACACAAGAGTAGAGTTAATAAAAGGAAAATACTCAAATTTAGATTTAACACTAGTTTCTGAAAGCCTAGCTGGAAGATGTGATTGGAAAGTATTAAAGCAAAACACAATTGGTAGTGATCATTATCCAATTCTAAGTTCAATTGGAATACAGATAATTCGAACTGTGGTAGAAAGAATGCCAAGGTGGAAATTCAGAACAGCTGACTGGGAAAATTTTAAGGAATTATGTAATAATAGATTGTCGGAAATAGATAGATGTGAGGATGATGTGGAAGTTATTAATTCTAAACTTTGTGAAGTTCTTAAGAGCACTGCGGAAGAAGTAATAGGAAGAAAAAAAGCTAATGATAAGAAGAAAGCAGTTCCTTGGTGGAATGAAGAGTGCAGCGAAGTAGTAAGTAAAAggaataatgcattaaaaaaagttagaaaaacattaaattataatgactttataaattataaaagagCTCAGGCAATAGTGAGGAAAATAATTAGAAGGGCAAAAAAGAATTATTGGAGAGAGTACTGTGACAGTATTGGGGAGGATGTCAATGTATCTGACATATGGGGTATGATAAGGAAAATGGCaggaaaacaaagaaataataatattcctACATTGACAGACAATAACAGATTAGTAATTTCTAATATGGAGAAAGCTGAAGTTCTAGCAAAAAATTTTGCCAGAATTCATAGTAACGCTAACCTATCTGAAGAAATTAGAAGAAATAGGGAACAGATCTTGATCAGGAATCCGTGGTTGTTGGAAAACAAAGGGCCATCTGAAAGTACATTAGATAGGGAATTTAcattatttgagttaaaaaaagcaTTGGCAGAAAGTAAGAAAACCTCACCTGGAAAAGATGAAATTTGTAACGAAATGATTAAGCATTTATCAGATAATTCATTATGTATAatactaaaattatttaataaagtatGGGAGTCAGGGATTTTACCAGCAGAGTGGAAACACGGTGTCATAATACCAATTGCAAAACCAGGTAAGGATCAGTCACAACCAAATAACTACAGACCCATAGCATTAACTTCTAATATATGTAAATTAATGGAACGCATGGTAATGAGCAGACTGGTTTATGCTATcgaaaaagaaaacttttttgcCGCATACCAAAGTGGTTTCAGGAAGGGACGTAATACAATGGATTCAGTGATTTGTTTGGAATCAGAAATAAGAAAGGCACAAGTAAATAAGGAAGTGTTGGTGGGAGTATTTTTCGATATTGAAAAAGCATACGACATGATGTGGAGAGAAGGacttttaattaaattagaaaaaatggAAATTAATGGAAAAATGTATAACTGGATCAAgaattttttgttaaaaagaaCAATACAAGTTAGAGTGGGTTCTGCATTCTCCCAAATATATAAGGTAGAGAACGGAACACCACAAGGGAGTGTTAGCAGCCCTATCCTATTTAATATCATGATAAATGACATCTTTTCAAAAATGGAGTTGGGGATCGGGAGATCTTTATATGCAGATGATGGTGCGCTATGGAAGAGGGGAAGAAATGTAGTTCATGTAGAAAGGTGTTTACAGAATGCAGTGAGGACAGTACAAGATTGGGCGGATGAGTGGGGGTTTAGATTTTCTACTGATAAAACTCAGgttatttgtttttcaaaaaagaaagttaatccaaatataaatattaatatatacagaCAAAAAATAGAACAGGTATCAGTAATTAGATATTTAGGAATGTGGATGgatgtaaaactgaattttaatatgcatattcaaaaaataatagataaatgtaaaaaaggaatTAATGTAATGAGGTGTCTGGCAGGAGCTGAATGGGGTGCATGTCGTTTCTCGCTTAAAAGAATCTATAATGCACTGGTAAGATCTACTATAGATTATGGATGCGTAGTATATAGTTCCGCAGCTAAAACTCAGTTGTTGAAAATAGATGCGATTCAATCTCAGGCACTAAGAATATGCTGTGGAGCACTAAGAACTACACCCATTATAGCATTACAAGTAGAGATGGGGGAAATGCCTCTAAAAATTAGAAGAATTAAGTTAAAAATGAGATATTGGGTTAGCATTAAAAGCCAAGAAGAGAGGCACCCAGTAAAAACAGTACTAAAGGAATGTTGGGAATATGGACATAAAAAGATAGATAGTTTTGGTTGGACAGTAAAAGACGAGGCTCAAAATATGGGCATAAGAGACATCAATTTAGCCCCTGCTGTGCCAACCTCTGCGATTCCGCCTTGGCTTTTCCATAAACCAGTAGTCGATTTATTACTACATgaggaaaaacacaaaaataatatgttaaatgaaaaagaaatacaacaatacataaatcagtcatatttcaattatttacagaTATATACAGATGGGTCAAAAGATCCTAAAGATGAAAAAACGGCAGTAGCAGTTTACATCCCAAAAttcaatattaaaatatcaaaaagaatAACGGACCGACTTTCTGTGTACACTACAGAAATTGTAGCTATACTTCTTGCTCTTCAGTGGATAGAAGACGTGAAACCATTAAGATCAGTAATATGCTCCGATTCTCTGTCAGTACTAAACAACTTAATTACTGGAACATCTAAGGCAAGACAGGACATAATGAATGAGATAATGCAAAATTTATTCAGAATCAGACAGGGTGGACTTTTTGTAAGCTTCTTGTGGATTCCTGGTCATATGGGAGTAGTAGGTAATGAAGAGGCAGACCAACTTGCAAAGGAAGCATTACAACATACTcagatagaaataaaaataaaaataagtaagtcAGAGGTAAAAAACATAATTGCAAAAGAAACAGGTAGAATGTGGCAAAGGGAGTGGGATAATGGAGAAAAAGGCAGACATATGCATAATATTCAAGGATGTGTGGGTGGTACTAGAAATAAGTTTGGTAATAGAAGGAATGATGTGGTAATAACTAGGTTGCGTGCTGGTCATTGTTTGCTAAACCAGTATAAGTTCAGAATAGGGAAGCACGAGACAGGATGTTGTGATAAATGCGGGAAAATAGAAACATTAGAACATGTAATTACAGAATGTGTGGCATATGACAATCAGAGATATCAGTTAGTTCAAGGATTAAGTATTTATGGGattaaaaatttgtcatttcAGACCCTATTAGGAAACAGTTCAAATCAAGTtgaaataataatgcaattaattaattacttaaaggAAACAAAATTGATTAATAGAATTTAAGAATAGCTTA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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000103436

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00009020 True 5322 mRNA 0.36 1 7865470 7870791

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_004524 NA coding upstream 24457 7799801 ~ 7841013 (+)
XLOC_004523 CABZ01050061.1 coding upstream 132820 7732534 ~ 7732650 (+)
XLOC_004522 FQ311940.1 coding upstream 304268 7561065 ~ 7561202 (+)
XLOC_004521 phyhiplb coding upstream 351676 7445595 ~ 7513794 (+)
XLOC_004519 bicc1b coding upstream 435646 7399403 ~ 7429824 (+)
XLOC_004526 rhobtb1 coding downstream 133081 8003872 ~ 8039095 (+)
XLOC_004527 NA coding downstream 172730 8043521 ~ 8046466 (+)
XLOC_004528 cabcoco1 coding downstream 203552 8074343 ~ 8104503 (+)
XLOC_004529 arid5b coding downstream 297481 8168272 ~ 8385702 (+)
XLOC_004530 adoa coding downstream 604077 8474868 ~ 8476513 (+)
XLOC_004520 FP102277.2 non-coding upstream 445322 7420032 ~ 7420148 (+)
XLOC_004517 CU184911.1 non-coding upstream 1157227 6708129 ~ 6708243 (+)
XLOC_004531 NA non-coding downstream 606656 8477447 ~ 8480465 (+)
XLOC_004532 NA non-coding downstream 656777 8527568 ~ 8534915 (+)
XLOC_004533 NA non-coding downstream 685845 8556636 ~ 8557159 (+)
XLOC_004536 NA non-coding downstream 1097526 8968317 ~ 8971032 (+)

Expression


Co-expression Network