G180765 (slc25a46)


Basic Information

Item Value
gene id G180765
gene name slc25a46
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 34289777 ~ 34386787 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU244943
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>TU244945
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>TU244947
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>TU244949
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>TU244950
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>TU244952
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>TU244953
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>TU244956
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Function

symbol description
slc25a46 Acts upstream of or within axon development and mitochondrial fission. Located in neuron projection. Is expressed in brain and eye. Human ortholog(s) of this gene implicated in pontocerebellar hypoplasia. Orthologous to human SLC25A46 (solute carrier family 25 member 46).

NR:

description
PREDICTED: solute carrier family 25 member 46

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU244943 False 1808 lncRNA 0.41 3 34329111 34331578
TU244945 False 2162 TUCP 0.42 2 34329111 34331578
TU244947 False 1507 lncRNA 0.41 3 34289777 34331578
TU244949 False 1471 lncRNA 0.41 3 34329111 34331578
TU244950 True 2647 lncRNA 0.49 4 34328368 34331578
TU244952 False 1441 lncRNA 0.41 2 34297084 34331578
TU244953 False 852 lncRNA 0.66 2 34328368 34386787
TU244956 False 808 lncRNA 0.66 3 34328368 34386787

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120545303 NA coding downstream 49478 34230011 ~ 34240299 (-)
LOC120545302 NA coding downstream 105190 34182310 ~ 34184587 (-)
LOC120545310 NA coding downstream 116706 34171136 ~ 34173071 (-)
LOC120545096 NA coding downstream 218198 34070085 ~ 34071579 (-)
LOC120545258 NA coding downstream 418898 33867993 ~ 33870879 (-)
LOC120545296 NA coding upstream 58882 34445669 ~ 34456896 (-)
fsd1l fsd1l coding upstream 300842 34687629 ~ 34701659 (-)
wu:fi75a02 NA coding upstream 506385 34893172 ~ 34910067 (-)
LOC120545270 NA coding upstream 1348572 35735359 ~ 35758865 (-)
LOC120545312 NA coding upstream 1463488 35850275 ~ 35853425 (-)
LOC120545331 NA non-coding downstream 20694 34247488 ~ 34269083 (-)
G180677 NA non-coding downstream 50646 34236913 ~ 34239131 (-)
G180748 NA non-coding downstream 124055 34165214 ~ 34165722 (-)
G180714 NA non-coding downstream 306959 33982373 ~ 33982818 (-)
G180675 NA non-coding downstream 427234 33862203 ~ 33862543 (-)
LOC120545351 NA non-coding upstream 15729 34402516 ~ 34402914 (-)
G180790 NA non-coding upstream 26245 34413032 ~ 34969045 (-)
G180799 NA non-coding upstream 28256 34415043 ~ 34415518 (-)
LOC120545330 NA non-coding upstream 82286 34469073 ~ 34487071 (-)
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apc apc,LOC104937427,LOC106906682 other upstream 337089 34723876 ~ 34773434 (-)
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Expression


Co-expression Network