XLOC_005769 (aifm2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_005769
gene name aifm2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 7241170 ~ 7261679 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00011406
AAAGTCCCCAACCGATGCAGCTATAGAAGTAGGAAGAGTTGAAGATCTATCCGTGTGGAGAAGAAGAAAACAGAGCTGTACATATTCGGAAACCTACATACAGAAATTGCAGTGAAGCATTATGGGTGGGCAGGTGTCAGTTGACGAGAGTGTTCATGTGGTGATTGTCGGTGGTGGTTTTGGCGGCATTGCAGCAGCTCAACACCTTAAACATTACGGTGTGCCCTTCATGCTTATTGACGTCCTGGATGCGTTTCATCACAACGTTGCAGCTCTGCGTGCCTCAGTGCAAACTGgtTTTGCTAGAAAGACGTTCATACCATACAAAGAGACATTTGGGCTGAATTTCCTCCAAGGCCGTGTCATACGGATAGACACAGAAACGCAGACAGTTGTGCTTGATAATGGAAAGGAAGTTCGTTATTCCCACCTTATTCTCTGCACTGGAACAACTGGATCCTTCCCAAGCAAACACAATTCTGTGGACACCTACAAATCAGCCATACAGAAGTATGAGGACTTCTTCCATGTGATCAAGGAAGCAAACGCCATTGTAGTTGTTGGTGGTGGAACCACTGGTGTTGAAATGGCAGCTGAGATCAAGACAGAATTTCACGACAAGAAGGTGGTTCTGATTCACCCGCGGGAGGAGGTGGCTGATCCTGAACTCCTGCCTTGTGTCAAAGAACAAGCCAAGCAGGTGCTGCTGGAAAAGGGGGTGGAGCTATTGCTAGGGCAGAAAGTGTCAAACCTTGAAGAGCTGGAACTGAATGTGTGTCGGAGCGGCATGGTGGTCAAGACCAATAAGAATGAACAGGTCACCACAGATCTTGTCATTTGCTGTACAGGGAGTAAGATCAACTCTGAAGCATACAGGTCCAGCATGAGTTCATGTCTGGCAGAGAACGGTGCTCTGAAGGTGAACAAGCACTTGCAAGTGGAAGGTTTTGACAATGTGTATGCTGTGGGCGATTGTGCCAACCTCAGTGAACCCAAGATGGCATATCATGCTGGACTTCATGCTGGAGTAGCTGCCACTAATATCATAAACAGCCTGTCAGGAAAGGCTTTGACTTCATACAAAACAGGTAATGTGACTATGCTGATTGCGATGGGCAAAGATGCCGGAGTGGGCCAGTTTAACGGTTATAAACTACCTCGATTTCTGGTCACCAAGGGTAAAAGTGAAGGCTTGCTGCTGTGGAAGAGCTGGAGGGAAATGGGACAAAAAGCCCCAAACTAATAGAAGGTTACCTAACAATGTTTACATCATACTCACAATGTGTGAACTACGGTTGCACGCTCTTCCATTTAACATGCCTtgatttatgaattatttaagCTCTTTTATCGTTGTCTTAAATTGAATTAGACCAGCAGAAGGATGCTTTTTTCTTATGAAAAATAACCTAacataatatatactatatatattctACATAACATCATTGTTTGTATCGTTTTTGAGAACAATCATGTGtaccattttaaacatttatacagtTGTTGATggaataaatgtatttacattt
>TCONS_00011407
CAGTGAAGCATTATGGGTGGGCAGGTGTCAGTTGACGAGAGTGTTCATGTGGTGATTGTCGGTGGTGGTTTTGGCGGCATTGCAGCAGCTCAACACCTTAAACATTACGGTGTGCCCTTCATGCTTATTGACGTCCTGGATGCGTTTCATCACAACGTTGCAGCTCTGCGTGCCTCAGTGCAAACTGgtTTTGCTAGAAAGACGTTCATACCATACAAAGAGACATTTGGGCTGAATTTCCTCCAAGGCCGTGTCATACGGATAGACACAGAAACGCAGACAGTTGTGCTTGATAATGGAAAGGAAGTTCGTTATTCCCACCTTATTCTCTGCACTGGAACAACTGGATCCTTCCCAAGCAAACACAATTCTGTGGACACCTACAAATCAGCCATACAGAAGTATGAGGACTTCTTCCATGTGATCAAGGAAGCAAACGCCATTGTAGTTGTTGGTGGTGGAACCACTGGTGTTGAAATGGCAGCTGAGATCAAGACAGAATTTCACGACAAGAAGGTGGTTCTGATTCACCCGCGGGAGGAGGTGGCTGATCCTGAACTCCTGCCTTGTGTCAAAGAACAAGCCAAGCAGGTGCTGCTGGAAAAGGGGGTGGAGCTATTGCTAGGGCAGAAAGTGTCAAACCTTGAAGAGCTGGAACTGAATGTGTGTCGGAGCGGCATGGTGGTCAAGACCAATAAGAATGAACAGGTCACCACAGATCTTGTCATTTGCTGTACAGGGAGTAAGATCAACTCTGAAGCATACAGGTCCAGCATGAGTTCATGTCTGGCAGAGAACGGTGCTCTGAAGGTGAACAAGCACTTGCAAGTGGAAGGTTTTGACAATGTGTATGCTGTGGGCGATTGTGCCAACCTCAGTGAACCCAAGATGGCATATCATGCTGGACTTCATGCTGGAGTAGCTGCCACTAATATCATAAACAGCCTGTCAGGAAAGGCTTTGACTTCATACAAAACAGGTAATGTGACTATGCTGATTGCGATGGGCAAAGATGCCGGAGTGGGCCAGTTTAACGGTTATAAACTACCTCGATTTCTGGTCACCAAGGGTAAAAGTGAAGGCTTGCTGCTGTGGAAGAGCTGGAGGGAAATGGGACAAAAAGCCCCAAACTAATAGAAGGTTACCTAACAATGTTTACATCATACTCACAATGTGTGAACTACGGTTGCACGCTCTTCCATTTAACATGCCTtgatttatgaattatttaagCTCTTTTATCGTTGTCTTAAATTGAATTAGACCAGCAGAAGGATGCTTTTTTCTTATGAAAAATAACCTAacataatatatactatatatattctACATAACATCATTGTTTGTATCGTTTTTGAGAACAATCATGTGtaccattttaaacatttatacagtTGTTGATggaataaatgtatttacatttataacatggtgtaatgtgtgtttatatcagtttgagctttttttttagttttttttttttacgtttttgatAAACTGCTGCAGTTTCTCCACTAGAGGGCAACGATAAGCTATAATCCACTCTACATGTAGCCTGGTCCAACctggtctttctttctttctttctttctttctttctttctttctttcgtccatccacccatctgtctatctgtctgtccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccgtccattcatccatccgtctgtctatccgtccgtccgtccgtctgtctttctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccgtccattcatccatccatccgtctctctgtctatctatctatctgtccatccgtccatccgtccgtctgtctgtctgtctgtccgtccgtccgtccatccctctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctaaatccAATTTAGGTacagtttgtttttattctttgtttaccTGCATTACATCTCTGTAAAAAAGGGATGATgctaaataaatgttgtttatagGACAGATGTTATATTACTAATCTTTAACTACAAAGTTTaaccatttaaatgaataatttgaagTAATGTACTTATTGAACACATACATTTTACGTGAACTGGATTGAaccaccaattaaaaaaaaaaataaaaaaataaaacttttcttaACATGAATAAACTGATAAGAAGAATGAGTCAAATCTTTAGACAGAAACAAAGCTAATAACAGCATGGCGgatgttatatacagtattagaACACAATCagtacatatgtttttttttgtgtgtgtgtttttttgctaTTGTGTTGTTCTtctccttaatttttttttactcattttgcaagtaattaaaaaaaaacctacttgCGATTTTGGAAGGAGGCACTGTCCCTAGGCTATAgtttatcattgttttttttttttggctattaCCATCTTGCCTATGACTGCTGACTGAACGTGTAATACTGTATGCATGCTCTTGACATCCGGATTTTaacaaaatgacattttgttGATTACCTTtagattaatatatttttctaaatcTTTTGGAATCCATGAATAATTTCTATTACATTCTgataattagtattttattaaaaaaactctGATAAAGTtctgataattataaatataattacatcTCAAATTTGACTGTTGACTTTAACCTAATAACCAACGTTTAAACCTAACCATAATCCTGTCTCTAAGTTTAACCATATTCTCCCTAAATATGAGCAAAAGTATAGACCTTGTACTGTACTCACAGCATATTTAGTATATTTAGAAAACACTGTGTTATATAGGGAAACTAAATGGGCAATGGTTAAGGTCAGATATGAGTTTAGGGTTAGAAGTATCTTCATACGAAAcagaactgtaaaataaagttCTACAATATGTTATAATACCATATGAACAaaatgagtttgtttgtttttatttgttttcacacaagCATGTAGTAGTTAAAGACATCTAATAAAAAGTGGAAGTCCAGCAGTCAAACGTTGCATAACTCACATTTTTGGTTTACTTAATATGCTTTATGAAGAGTGGAATGTCTTTACTCGTGGTTTAAATGACTTGATTAACAGAGAAATTCACAGAAAAGTAGAGCAAATGAAATTACAGCTCAAATCGTTTTTAAGAAATCATTGCACTTGTCAAATCAGGTTCTTTTGCTGTAGCTTCATTATTACATGACCTCATCATCACACACAGCAGAGTCCTGTTATCATCTTTCTACTTATacatttctattatatatatacatacagttaaaatcagaattattagcctcattcaaatttaaaaaaaatatttcccaaattatgtttaacagagcaaggaaattttcacattatgtctgataatattttttcttctggagaaagtcttatttgttttatttaagctagaatataagcagtttaaaaatgttaaacaccattttaagaacaaaattattagcccctttaagcaattttttttctataatctacagaacaaaccatcattattcaataacttgcctaattaccctaacctgcctagttaaactaattaacctagttaagcctttttaagtcactttaagctgtatagaagtgtcttgaaaaatgtctattaatataaactattatgtttagaaatgtgttaaaaaaatctgctctctgttaaacagaaattggggaataatgtaaacagggggctaataattcaggggggctaataattctgacttcaactatgtatgtatgtgtgtgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatctctatatatatata

Function

symbol description
aifm2 Predicted to enable oxidoreductase activity. Orthologous to human AIFM2 (apoptosis inducing factor mitochondria associated 2).

GO:

id name namespace
GO:0055114 oxidation-reduction process biological_process
GO:0016491 oxidoreductase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko04115 p53 signaling pathway

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050506-76 Predicted to enable oxidoreductase activity. Orthologous to human AIFM2 (apoptosis inducing factor mitochondria associated 2).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000077549

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00011406 False 1532 mRNA 0.44 9 7241170 7259150
TCONS_00011407 True 3952 mRNA 0.35 8 7242916 7261679

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_005768 gins1 coding upstream 70819 7164345 ~ 7170351 (+)
XLOC_005767 rps6ka2 coding upstream 84108 7086735 ~ 7157062 (+)
XLOC_005766 rnaset2 coding upstream 175171 7049210 ~ 7065999 (+)
XLOC_005765 NA coding upstream 358646 6838601 ~ 6882524 (+)
XLOC_005763 csmd1a coding upstream 658445 6342410 ~ 6582725 (+)
XLOC_005770 NA coding downstream 12792 7274471 ~ 7317333 (+)
XLOC_005771 CU179758.1 coding downstream 60566 7322245 ~ 7340412 (+)
XLOC_005772 CT027980.1 coding downstream 84922 7346601 ~ 7347745 (+)
XLOC_005773 NA coding downstream 107481 7369160 ~ 7370636 (+)
XLOC_005774 CT027980.2 coding downstream 119839 7381518 ~ 7381633 (+)
XLOC_005764 CU929430.1 non-coding upstream 826770 6414284 ~ 6414400 (+)
XLOC_005759 FP089536.1 non-coding upstream 1096349 6142124 ~ 6144821 (+)
XLOC_005756 NA non-coding upstream 1667057 5568968 ~ 5574113 (+)
XLOC_005755 NA non-coding upstream 1682649 5489258 ~ 5558521 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01180000_06984285_06989850 AIFM2 coding CI01180000 null 6983493 ~ 6990671 (-)