LOC122327156


Basic Information

Item Value
gene id LOC122327156
gene name NA
gene type misc
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056720.1
NCBI id CM032089.1
chromosome length 18002998
location 13067414 ~ 13098756 (+)
genome version ASM1883169v1_2021_tiger_barb_Genome

Sequence

>TU225243
AGAGTATTACAGACCTTCACTGTACTTGTTCAGTCTGTCAAGATGAAGACTAAGACGAAAGAGAGGAATTTTTTAACAGATCTTTCttgactgagtccagatacagAAACACTTCAGTGCAGCTACATCTTTGTATTTGCAGCACTCATAGATAAAGCATCTCTGCTGGTGACAGTATGGGGTTTCGTTGGGGGTTCTGTCGTCCTGCCATGTTCTTCAGATGATTATGAACATAAACTTCAAGATGTTGATGTGAGCTGGAGACACAATGGTAgcaaaaatgtgtgtgattTAATTCCACAcagtaatttaacaaaaacacaggaCGTACGATacaagaacagaacagaaacttTTCCTGAGGAGTATAATCAAAGAAACTTCTCCATCAAACTCTCTAATCTCACTCACGCTGATGCAGGAAGATACATCTGCTTCATCACACCCTCAGATGAGATGAATACTGTGGAGCTGATCATCAACGAAAAATTAGAACCAGTTacagaaaatgcaaacaaaaccaTTGATCAAAAAAACCTAGAAGAAATCAAACCAGACAGTCTCGAGAAATCATGGCTTTGGATCCTGATTGGCTTACCCATACTGGTTCTTTTAATCATTGTAATTATCTTTAGAAGAAAGATCTCCAGCTGCCTTACGTCAGGTAAACACGTCCGGGGTTCAGAGGTTCATGAGGTGAGTCCTGGTCCAGGTTATAAATCAGTAACTGCTGATGGTCTTTAAGCAGTTAAAGCAGGTGAATGACACAGACAACAGCTTTCTCCTTAAACAAGCAGTCAGAGGAGGAAAGTGCTGCTTTTATTGTTGCTGATGCAGTGAGTGTGTTGTTGTATTTTCTTTGTCTGCACTCTTTAAGACTACATAGGTCTCTGGATTGACTTGGTCAAATATGATTTCAGACAAATTCAAGCAGATTCAGAACATTTTTcacaatcaaaaaaatattgttagcTCATTAAATTGCTATAGAGATTCATTGTTTTAAAGCTGTTGGGATAATTTTGTAGCAAATTCATAGTAAACCATGGCTTTCTGTCACATTTGATGAGGTTCACCAGTCAATGTTCATGTTGGTAACATTGCCAATGCCACACTGATCTTCTTGCCTTTAAATGGCCTACTATCAAAAACTACATATTTGTCTTTTATTcgttatgtatttattgaattatttattttttggaatgtttttttggatgttttgaTTCATTGGTGTCGTTCGCACTGATAAAGGATCACCTGATCCACCTTCTGTATTGTAACCAAGTGCCATATATAGGCCCCTTTCCAccactattaaaatataaagttcaaaatataAGATAGCAAAATAATTCATAGTTAAAATTGTCATAGGTCAGTTctaattatagtttttttctcaaagtcagttttctttttgtcaaTTTTGAACATCATACTTttgacatttatgttttttgttttatatatattgtgtaaatagGATTCTGTAGCTCAATGATGCAGCTCAAATCAGATTCATCCGTACATAATAACAAGTACATAAAGCTCAACACACATACCAGAACTTAATGTTGCTCCTCAAGTACTATGCTGAAAATCAAAAAGTTATAGTGCAGTTTtaataacaggttttttttttttttttttaattttttattatttgtactgttttattactttttatcacTTATGTAAAGTGCTAAGTTAATAAATTTGCCTTGCCTCTCCACTTTGGAAAGTTACTTTTAGATGAATTTGAACAAAACACGATTGTGCTCTTATATTCTTGCCTTACCCACTAAACTCTCATTATATAAGATTATATGATATGTTGAAACATGGAAATGCACTGAAAGGAATATGAGCCTGTCAATATGTTGCTGACCTAAAAATTCTGTACTTTTATGCTTTGTATTGGAccatataatgaaaatatttgcactgaaaatgttttatttttgttcaaaatctaattcaatATTATCAGGCATTTACTtgtctttcattttatattgattGTAAACTTTAAGacc
>TU225244
ACCAGACAGAGTATTACAGACCTTCATTGTACTTGTTCAGTCTGTCAAGATAAAGACTAAGACGAAAGAGAGGAATTTTTTAACATATCTTTCttgactgagtccagatacagAAACACTTCAGTGCAGCTACATCTTTGTATATGCAGCACTCATAGATAAAGTCTCTCTGCAGGTCACAGTAGAAGGTTTCGTCGGTGGTTCTGTTGTCCTGCCATGTTCATCAGCTGAACATGATCTTAAACTTCAAGACATCAGTGTACACTGGAGAAATAGCGGCAGCAAGATTGTGTATGATATACCTGAAAGTAAAGAATTTCAAGACTCAGCATTtaagaacagaacagaaacttTTCCTGAGGAGTATAATCAAAGAAACTTCTCCATCAAACTCTCTAATCTCACTCACGCTGATGCAGGAAAATACACCTGCTTCATCACACCCTCAGATGAGCAGAAGACTGTAGAGCTGATCATCAACGAAAAACCAGTTACAGAAAATGGAAACAAAGCCACTGATCAAAAAAACCTAGAAGAAATCAAACCAGACAGTCTCGAGAAATCATGGCTTTGGATCCTGATTGGCTTACCCATACTGGTTCTATTAATCATTGTAATTATCTTTAAAAGAAAGATCTCCAGCTGCCGTATGTCAGGTGAACACGTCCTGGGTTCAGATGCTCATGAGGGGAGTTCTGGTCCAGGTTATAAATCAGTAACTGCTGATGGTCTTTAAGCAGTTAAAGCAGGTGAATGACACAGACAACAGCTTTCTCCTTAAACAAGCAGTCAGAGGAGGAAAGTGGTGCTTTTATTGTTGCTGATGCAGTGAGTGTGTTGTTGTATTTTCTTTGTCTGCACTCTTTAAGACTACATAGGTCTCTGGAGTGACTTGGTCAAATATGATTTCAGACAAATTCAAGCAGATTCAGAACATTTCTCACAATCAAAAAACTATTGTTAGCTCATTAAATTGCGATTGAGATTCATTGTTTTAAAGCTGTTGGGATAATTTTGTAGCAAATACTGAACCATTATTTTTTCTCTGTGTCTCATCTCTGTAAATCTGAAGATCATCTGCAGTTGACAGTGTAGTAGAAGCTTGAAGCCACAACCAGTCAATCAATCTTGGTCTAAAAAGAGTTTTCAAACTAAATCACTGTACTCGTAGTAAAACATACTGTTGGCTTTCTGTCACATTTGATGAGGTTCACCAATCAATGTTCATGTTGGTAACATTGCCAGTGCCACACTGATCTTCTTGCCTTTAAATGACCTACTGTCAAAACAAcatatctttcttttatttgttgatttatttttttggaatgttCTTATTATATGATATCTTGAAACATGGAAATGCACTGAAAGGAATATGAGCCTGTCAATATGTTGCTGACCTAAAAATTCTGtacttttatactttgtacTGGACCATATcatgcaatatatatacatatatttgtggtgaaaatgttttatttttgttcaaaatctACTTCAATATTATCAGGCATTTACTTGTCTTTCATTTTATACTGATTGTAAACTTTAAGaccaaataaaatgtctaattaaaaTGC
>XM_043222348.1
TACTGTTGACGTCACTTACGTCTGATGTCATCCGTAGGACGCACAACGTGATGCTAACACGGAAGCGTATGTGCTGCTAGGGAGTATTTAGAGTATTTCAATATAGTtcaatatactaaaataaaacatattgatttatgtatttaaaaaattgggGCAACATTATGTTCTGCTACATCTTTGTATTTGCAGCACTCATAGATAAAGCATCTCTGCTGGTGACAGTATGGGGTTTCGTTGGGGGTTCTGTCGTCCTGCCATGTTCTTCAGATGATTATGAACATAAACTTCAAGATGTTGATGTGAGCTGGAGACACAATGGTAgcaaaaatgtgtgtgattTAATTCCACAcagtaatttaacaaaaacacaggaCGTACGATacaagaacagaacagaaacttTTCCTGAGGAGTATAATCAAAGAAACTTCTCCATCAAACTCTCTAATCTCACTCACGCTGATGCAGGAAGATACATCTGCTTCATCACACCCTCAGATGAGATGAATACTGTGGAGCTGATCATCAACGAAAAATTAGAACCAGTTacagaaaatgcaaacaaaaccaTTGATCAAAAAAACCTAGAAGAAATCAAACCAGACAGTCTCGAGAAATCATGGCTTTGGATCCTGATTGGCTTACCCATACTGGTTCTTTTAATCATTGTAATTATCTTTAGAAGAAAGATCTCCAGCTGCCTTACGTCAGGTAAACACGTCCGGGGTTCAGAGGTTCATGAGGTGAGTCCTGGTCCAGGTTATAAATCAGTAACTGCTGATGGTCTTTAAGCAGTTAAAGCAGGTGAATGACACAGACAACAGCTTTCTCCTTAAACAAGCAGTCAGAGGAGGAAAGTGCTGCTTTTATTGTTGCTGATGCAGTGAGTGTGTTGTTGTATTTTCTTTGTCTGCACTCTTTAAGACTACATAGGTCTCTGGATTGACTTGGTCAAATATGATTTCAGACAAATTCAAGCAGATTCAGAACATTTTTcacaatcaaaaaaatattgttagcTCATTAAATTGCTATAGAGATTCATTGTTTTAAAGCTGTTGGGATAATTTTGTAGCAAATTCATAGTAAACCATGGCTTTCTGTCACATTTGATGAGGTTCACCAGTCAATGTTCATGTTGGTAACATTGCCAATGCCACACTGATCTTCTTGCCTTTAAATGGCCTACTATCAAAAACTACATATTTGTCTTTTATTcgttatgtatttattgaattatttattttttggaatgtttttttggatgttttgaTTCATTGGTGTCGTTCGCACTGATAAAGGATCACCTGATCCACCTTCTGTATTGTAACCAAGTGCCATATATAGGCCCCTTTCCAccactattaaaatataaagttcaaaatataAGATAGCAAAATAATTCATAGTTAAAATTGTCATAGGTCAGTTctaattatagtttttttctcaaagtcagttttctttttgtcaaTTTTGAACATCATACTTttgacatttatgttttttgttttatatatattgtgtaaatagGATTCTGTAGCTCAATGATGCAGCTCAAATCAGATTCATCCGTACATAATAACAAGTACATAAAGCTCAACACACATACCAGAACTTAATGTTGCTCCTCAAGTACTATGCTGAAAATCAAAAAGTTATAGTGCAGTTTtaataacaggttttttttttttttttttaattttttattatttgtactgttttattactttttatcacTTATGTAAAGTGCTAAGTTAATAAATTTGCCTTGCCTCTCCACTTTGGAAAGTTACTTTTAGATGAATTTGAACAAAACACGATTGTGCTCTTATATTCTTGCCTTACCCACTAAACTCTCATTATATAAGATTATATGATATGTTGAAACATGGAAATGCACTGAAAGGAATATGAGCCTGTCAATATGTTGCTGACCTAAAAATTCTGTACTTTTATGCTTTGTATTGGAccatataatgaaaatatttgcactgaaaatgttttatttttgttcaaaatctaattcaatATTATCAGGCATTTACTtgtctttcattttatattgattGTAAACTTTAAGaccaaataaaatgtctaaataaa
>XM_043222349.1
CACAACGTGATAATAACACGGAAGTATGTATGTACCGTGTATGTGCTATTAGGGAGTATTTAGAGtatttaaagttcatttaagttcaatatattaaaataaaatatattgaaaagtTATGTATTTGAAAAATTGGGGCAACATTATGTTCTGCTACATCTTTGTATTTGCAGCACTCATAGATAAAGCATCTCTGCTGGTGACAGTATGGGGTTTCGTTGGGGGTTCTGTCGTCCTGCCATGTTCTTCAGATGATTATGAACATAAACTTCAAGATGTTGATGTGAGCTGGAGACACAATGGTAgcaaaaatgtgtgtgattTAATTCCACAcagtaatttaacaaaaacacaggaCGTACGATacaagaacagaacagaaacttTTCCTGAGGAGTATAATCAAAGAAACTTCTCCATCAAACTCTCTAATCTCACTCACGCTGATGCAGGAAGATACATCTGCTTCATCACACCCTCAGATGAGATGAATACTGTGGAGCTGATCATCAACGAAAAATTAGAACCAGTTacagaaaatgcaaacaaaaccaTTGATCAAAAAAACCTAGAAGAAATCAAACCAGACAGTCTCGAGAAATCATGGCTTTGGATCCTGATTGGCTTACCCATACTGGTTCTTTTAATCATTGTAATTATCTTTAGAAGAAAGATCTCCAGCTGCCTTACGTCAGGTAAACACGTCCGGGGTTCAGAGGTTCATGAGGTGAGTCCTGGTCCAGGTTATAAATCAGTAACTGCTGATGGTCTTTAAGCAGTTAAAGCAGGTGAATGACACAGACAACAGCTTTCTCCTTAAACAAGCAGTCAGAGGAGGAAAGTGCTGCTTTTATTGTTGCTGATGCAGTGAGTGTGTTGTTGTATTTTCTTTGTCTGCACTCTTTAAGACTACATAGGTCTCTGGATTGACTTGGTCAAATATGATTTCAGACAAATTCAAGCAGATTCAGAACATTTTTcacaatcaaaaaaatattgttagcTCATTAAATTGCTATAGAGATTCATTGTTTTAAAGCTGTTGGGATAATTTTGTAGCAAATTCATAGTAAACCATGGCTTTCTGTCACATTTGATGAGGTTCACCAGTCAATGTTCATGTTGGTAACATTGCCAATGCCACACTGATCTTCTTGCCTTTAAATGGCCTACTATCAAAAACTACATATTTGTCTTTTATTcgttatgtatttattgaattatttattttttggaatgtttttttggatgttttgaTTCATTGGTGTCGTTCGCACTGATAAAGGATCACCTGATCCACCTTCTGTATTGTAACCAAGTGCCATATATAGGCCCCTTTCCAccactattaaaatataaagttcaaaatataAGATAGCAAAATAATTCATAGTTAAAATTGTCATAGGTCAGTTctaattatagtttttttctcaaagtcagttttctttttgtcaaTTTTGAACATCATACTTttgacatttatgttttttgttttatatatattgtgtaaatagGATTCTGTAGCTCAATGATGCAGCTCAAATCAGATTCATCCGTACATAATAACAAGTACATAAAGCTCAACACACATACCAGAACTTAATGTTGCTCCTCAAGTACTATGCTGAAAATCAAAAAGTTATAGTGCAGTTTtaataacaggttttttttttttttttttaattttttattatttgtactgttttattactttttatcacTTATGTAAAGTGCTAAGTTAATAAATTTGCCTTGCCTCTCCACTTTGGAAAGTTACTTTTAGATGAATTTGAACAAAACACGATTGTGCTCTTATATTCTTGCCTTACCCACTAAACTCTCATTATATAAGATTATATGATATGTTGAAACATGGAAATGCACTGAAAGGAATATGAGCCTGTCAATATGTTGCTGACCTAAAAATTCTGTACTTTTATGCTTTGTATTGGAccatataatgaaaatatttgcactgaaaatgttttatttttgttcaaaatctaattcaatATTATCAGGCATTTACTtgtctttcattttatattgattGTAAACTTTAAGaccaaataaaatgtctaaataaa

Function

GO:

id name namespace
GO:0004197 cysteine-type endopeptidase activity molecular_function
GO:0008234 cysteine-type peptidase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko04612 Antigen processing and presentation

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU225243 False 2039 lncRNA 0.34 4 13067414 13079617
TU225244 False 1586 lncRNA 0.36 4 13090310 13098756
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XM_043222349.1 False 2090 mRNA 0.33 4 13075651 13079637

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
si:dkey-246e1.3 NA coding upstream 111106 12950609 ~ 12956308 (+)
tmem186 NA coding upstream 192080 12863320 ~ 12875334 (+)
slx4 LOC107755350,LOC107659319,LOC107566668 coding upstream 204737 12852441 ~ 12862677 (+)
crebbpa LOC107742089,LOC107655368,LOC107755349,LOC107566670,LOC107566050 coding upstream 215198 12813161 ~ 12852216 (+)
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senp7b LOC107717676,LOC107704544,LOC107704674,LOC107566043 coding downstream 103933 13202689 ~ 13226838 (+)
abi3bpb abi3bpb,LOC107566041,LOC107717674,LOC107704546,LOC107720343,LOC108436625 coding downstream 179615 13278371 ~ 13302756 (+)
tp53bp2b LOC107717669,LOC107704550,LOC107667887,LOC107602677 coding downstream 339431 13438187 ~ 13459632 (+)
pla2g6 pla2g6,LOC107667889,LOC107704553,LOC107602675 coding downstream 381790 13480546 ~ 13497225 (+)
LOC122327695 ncf4,LOC107704554,LOC107667893,LOC107559542 coding downstream 418372 13517128 ~ 13539026 (+)
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G152195 NA non-coding upstream 15585 13050950 ~ 13051829 (+)
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G152161 NA non-coding upstream 97056 12901270 ~ 12970358 (+)
G152173 NA non-coding upstream 110623 12947902 ~ 12956791 (+)
G152200 LOC107568072,LOC107694706,LOC107704533,LOC107755337,LOC107659310,LOC107704541,LOC107659300,LOC107580119,LOC107655326,LOC107731186 non-coding downstream 2304 13101060 ~ 13161699 (+)
LOC122327165 LOC107568072,LOC107694706,LOC107704533,LOC107575395,LOC107755337,LOC107659310,LOC107655326,LOC107711444,LOC107749630 non-coding downstream 2352 13101108 ~ 13106256 (+)
G152205 LOC107686478,LOC107670948 non-coding downstream 17682 13116438 ~ 13121691 (+)
LOC122327169 NA non-coding downstream 73977 13172733 ~ 13175326 (+)
LOC122327167 NA non-coding downstream 95984 13194740 ~ 13197659 (+)
G152065 LOC107716432,LOC107655331,LOC107575070,LOC107715704,LOC107570368,LOC107755334,LOC107659303 other upstream 643492 12409306 ~ 12423922 (+)
G152043 LOC107741571 other upstream 721664 12345206 ~ 12345750 (+)
G152032 NA other upstream 772697 12293400 ~ 12294717 (+)
LOC122327127 vtg6,LOC107563524,LOC107664867,LOC107715697,LOC107664873,LOC107741562,LOC107570371,LOC107734844,LOC107570369,LOC107664832,LOC107564925,LOC107563523,LOC107715728,LOC107655401,LOC107715731,LOC107655402,LOC107576112,LOC107570370,LOC107734958,LOC107579406 other upstream 790806 12010469 ~ 12276608 (+)
LOC122327107 LOC107563522,LOC107715696,LOC108430069,LOC108271041,LOC105898241 other upstream 878408 12175687 ~ 12189006 (+)
LOC122327162 NA other downstream 8750 13107506 ~ 13112733 (+)
LOC122327212 NA other downstream 77671 13176427 ~ 13180275 (+)
G152558 col8a1b,LOC107717673,LOC107720377,LOC107704548,LOC107667898,LOC107602679,LOC107571642 other downstream 284397 13383153 ~ 13383777 (+)
baiap2l2b baiap2l2b,LOC107717666,LOC107704557,LOC107602661,LOC107559544,LOC107720338 other downstream 306086 13404842 ~ 13509252 (+)
G152565 NA other downstream 318708 13417464 ~ 13418407 (+)

Expression


Co-expression Network